鮸魚兩種免疫相關(guān)microRNA的靶基因驗(yàn)證及調(diào)控研究
發(fā)布時(shí)間:2021-03-20 19:07
在生物體的長(zhǎng)期的進(jìn)化過程中,為了抵抗外界病原體的感染,脊椎動(dòng)物已經(jīng)進(jìn)化出了較完善的免疫系統(tǒng)。脊椎動(dòng)物的免疫系統(tǒng),是它們防御疾病的重要組成部分,可以分為先天性免疫系統(tǒng)(Innate Immunity System)和適應(yīng)性或者獲得性免疫系統(tǒng)(Adaptive or Acquired Immunity System)。Toll樣受體(Toll-like receptors,TLRs)在生物體對(duì)病原體的鑒別的過程中,發(fā)揮著關(guān)鍵的作用。MicroRNAs(mi RNAs)是一種小的RNA分子,具有內(nèi)源性的和非編碼的特征,約含1825個(gè)核苷酸,能夠在轉(zhuǎn)錄后水平上通過誘導(dǎo)靶基因mRNA的降解或者抑制蛋白質(zhì)翻譯的方式來調(diào)控各種生理過程。當(dāng)機(jī)體感染病原體時(shí),免疫細(xì)胞會(huì)通過模式識(shí)別受體特異性的識(shí)別病原體的組成部分并激活下游的信號(hào)通路,從而引起促炎癥細(xì)胞因子和I型干擾素的產(chǎn)生。在本研究中通過對(duì)實(shí)驗(yàn)室利用高通量測(cè)序獲得的鰻弧菌感染前后miRNA的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,篩選出了病原體感染相關(guān)的差異性表達(dá)的miRNA,對(duì)其中的幾個(gè)mi RNA對(duì)Toll受體的靶標(biāo)調(diào)控進(jìn)行了研究,研究結(jié)論如下:...
【文章來源】:浙江海洋大學(xué)浙江省
【文章頁(yè)數(shù)】:67 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
miR-122的特征分析
第三章 結(jié)果與討論在不同的時(shí)間點(diǎn)進(jìn)行了具體的研究。與未感染鰻弧菌的情況下的 miR-122 的表達(dá)量相比,在其感染后 48 h,鮸魚的 miR-122 的表達(dá)量下降了 0.013 倍。然而,與未感染的陰性對(duì)照進(jìn)行比較,TLR14 的表達(dá)量強(qiáng)烈地升高,在鰻弧菌感染后的 48 h,大約上升了 11.85 倍,如圖 3-2 所示。由此可知,在鰻弧菌感染的條件下,鮸魚 miR-122 能夠負(fù)性調(diào)控 TLR14 的表達(dá)量。miR-122 的表達(dá)量的下調(diào),表明 miR-122 在病原體的感染條件下,可能參與對(duì)鰻弧菌的免疫方面的負(fù)性調(diào)控。為了進(jìn)一步確認(rèn)這種關(guān)鍵性的變化趨勢(shì),我們使用在 LPS 的刺激鮸魚的巨噬細(xì)胞的條件下,來模擬進(jìn)行體外的感染條件下,進(jìn)一步地對(duì) miR-122 和 TLR14 的表達(dá)量進(jìn)行檢測(cè)。與未感染 LPS 的細(xì)胞作為陰性對(duì)照相比較,在細(xì)胞感染 LPS 后的 3 h 和 6h 后,miR-122 的表達(dá)量是下降的,而 TLR14 的表達(dá)量是上升的,如圖 3-3 所示。綜上可以看出,在體外的感染性實(shí)驗(yàn)和在體內(nèi)的攻毒的實(shí)驗(yàn)情況下,這些表達(dá)量的結(jié)果可以清楚地表明,miR-122 能夠負(fù)性調(diào)控 TLR14 的表達(dá)量。
圖 3-3 鮸魚 miR-122(A) 和 TLR14 (B) 在 LPS 刺激鮸魚巨噬細(xì)胞的表達(dá)圖譜Fig.3-3 The time-course expression patterns of miR-122 (A) and TLR14 (B) in macrophages of miiuycroaker with LPS stimulation. Data are expressed as the mean ± SD (n = 3).3.1.4 雙熒光素酶報(bào)告基因分析miRNA 對(duì)靶基因的調(diào)控作用是通過與其 3’UTR 區(qū)域的靶作用位點(diǎn)相結(jié)合來實(shí)現(xiàn)其負(fù)調(diào)控作用的。為了確定 TLR14 是否能夠作為 miR-122 的直接靶基因,我們利用計(jì)算機(jī)軟件分析數(shù)據(jù)庫(kù)來對(duì) miR-122 在 TLR14 3’UTR 非翻譯區(qū)上的靶向結(jié)合位點(diǎn)進(jìn)行了預(yù)測(cè)。也就是說,是將預(yù)測(cè)得到的“種子區(qū)域”的靶向結(jié)合區(qū)域進(jìn)行了點(diǎn)突變,突變的序列過程如下圖 3-4 所示。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]大黃魚脾酪氨酸激酶的克隆與表達(dá)分析[J]. 王小龍,葉坤,王志勇,韓芳. 湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2017(06)
[2]has-miR-16在舌鱗癌中的生物學(xué)功能及分子機(jī)制研究[J]. 李琦,耿亞軍,郭菁,鄂麗華,徐溢涵,金武龍. 中國(guó)實(shí)用口腔科雜志. 2017(06)
[3]水稻白葉枯病菌Ⅲ型效應(yīng)物基因hpaF與毒力相關(guān)[J]. 劉國(guó)芳,蔣蓉,蘇輝昭,牛祥娜,玉延華,姜偉,何勇強(qiáng). 華南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(05)
[4]牛ATP5B基因啟動(dòng)子雙熒光素酶報(bào)告基因載體構(gòu)建與活性檢測(cè)[J]. 段美艷,李安寧,趙志東,王明明,昝林森. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2015(08)
[5]魚類Toll樣受體及其信號(hào)傳導(dǎo)的研究進(jìn)展[J]. 范澤軍,鄒鵬飛,姚翠鸞. 水生生物學(xué)報(bào). 2015(01)
[6]Toll樣受體信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的負(fù)調(diào)控機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 高明,敖越,欒新紅. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2015(01)
[7]柑橘黃龍病菌外膜蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)[J]. 高玉霞,盧占軍,鐘八蓮,易龍,蘇華楠,趙培婭,劉志芳,賴愛萍,夏宜林. 贛南師范學(xué)院學(xué)報(bào). 2014(06)
[8]Toll樣受體信號(hào)通路在宮頸高危HPV感染致癌過程中的相關(guān)功能[J]. 徐小仙,樓寒梅. 國(guó)際腫瘤學(xué)雜志. 2014 (11)
[9]Toll樣受體信號(hào)傳導(dǎo)通路及其免疫調(diào)節(jié)作用的研究進(jìn)展[J]. 高明,敖越,欒新紅,曹中贊. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2014(04)
[10]TLR7和AP-1在基底細(xì)胞癌中的表達(dá)及意義[J]. 鄧妮,高永良,趙恒光. 激光雜志. 2013(06)
本文編號(hào):3091513
【文章來源】:浙江海洋大學(xué)浙江省
【文章頁(yè)數(shù)】:67 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
miR-122的特征分析
第三章 結(jié)果與討論在不同的時(shí)間點(diǎn)進(jìn)行了具體的研究。與未感染鰻弧菌的情況下的 miR-122 的表達(dá)量相比,在其感染后 48 h,鮸魚的 miR-122 的表達(dá)量下降了 0.013 倍。然而,與未感染的陰性對(duì)照進(jìn)行比較,TLR14 的表達(dá)量強(qiáng)烈地升高,在鰻弧菌感染后的 48 h,大約上升了 11.85 倍,如圖 3-2 所示。由此可知,在鰻弧菌感染的條件下,鮸魚 miR-122 能夠負(fù)性調(diào)控 TLR14 的表達(dá)量。miR-122 的表達(dá)量的下調(diào),表明 miR-122 在病原體的感染條件下,可能參與對(duì)鰻弧菌的免疫方面的負(fù)性調(diào)控。為了進(jìn)一步確認(rèn)這種關(guān)鍵性的變化趨勢(shì),我們使用在 LPS 的刺激鮸魚的巨噬細(xì)胞的條件下,來模擬進(jìn)行體外的感染條件下,進(jìn)一步地對(duì) miR-122 和 TLR14 的表達(dá)量進(jìn)行檢測(cè)。與未感染 LPS 的細(xì)胞作為陰性對(duì)照相比較,在細(xì)胞感染 LPS 后的 3 h 和 6h 后,miR-122 的表達(dá)量是下降的,而 TLR14 的表達(dá)量是上升的,如圖 3-3 所示。綜上可以看出,在體外的感染性實(shí)驗(yàn)和在體內(nèi)的攻毒的實(shí)驗(yàn)情況下,這些表達(dá)量的結(jié)果可以清楚地表明,miR-122 能夠負(fù)性調(diào)控 TLR14 的表達(dá)量。
圖 3-3 鮸魚 miR-122(A) 和 TLR14 (B) 在 LPS 刺激鮸魚巨噬細(xì)胞的表達(dá)圖譜Fig.3-3 The time-course expression patterns of miR-122 (A) and TLR14 (B) in macrophages of miiuycroaker with LPS stimulation. Data are expressed as the mean ± SD (n = 3).3.1.4 雙熒光素酶報(bào)告基因分析miRNA 對(duì)靶基因的調(diào)控作用是通過與其 3’UTR 區(qū)域的靶作用位點(diǎn)相結(jié)合來實(shí)現(xiàn)其負(fù)調(diào)控作用的。為了確定 TLR14 是否能夠作為 miR-122 的直接靶基因,我們利用計(jì)算機(jī)軟件分析數(shù)據(jù)庫(kù)來對(duì) miR-122 在 TLR14 3’UTR 非翻譯區(qū)上的靶向結(jié)合位點(diǎn)進(jìn)行了預(yù)測(cè)。也就是說,是將預(yù)測(cè)得到的“種子區(qū)域”的靶向結(jié)合區(qū)域進(jìn)行了點(diǎn)突變,突變的序列過程如下圖 3-4 所示。
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期刊論文
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[4]牛ATP5B基因啟動(dòng)子雙熒光素酶報(bào)告基因載體構(gòu)建與活性檢測(cè)[J]. 段美艷,李安寧,趙志東,王明明,昝林森. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2015(08)
[5]魚類Toll樣受體及其信號(hào)傳導(dǎo)的研究進(jìn)展[J]. 范澤軍,鄒鵬飛,姚翠鸞. 水生生物學(xué)報(bào). 2015(01)
[6]Toll樣受體信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的負(fù)調(diào)控機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 高明,敖越,欒新紅. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2015(01)
[7]柑橘黃龍病菌外膜蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)[J]. 高玉霞,盧占軍,鐘八蓮,易龍,蘇華楠,趙培婭,劉志芳,賴愛萍,夏宜林. 贛南師范學(xué)院學(xué)報(bào). 2014(06)
[8]Toll樣受體信號(hào)通路在宮頸高危HPV感染致癌過程中的相關(guān)功能[J]. 徐小仙,樓寒梅. 國(guó)際腫瘤學(xué)雜志. 2014 (11)
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[10]TLR7和AP-1在基底細(xì)胞癌中的表達(dá)及意義[J]. 鄧妮,高永良,趙恒光. 激光雜志. 2013(06)
本文編號(hào):3091513
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