由植原體侵染泡桐韌皮部而導(dǎo)致的泡桐叢枝病（Paulownia Witches Broom,PaWB）是泡桐生產(chǎn)中的致命病害,這種傳染性病害具有危害性高、治愈難、致死率高等特點,給農(nóng)林業(yè)生產(chǎn)帶來了嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析使人們了解植物環(huán)境變化的表達(dá)譜;時間序列轉(zhuǎn)錄組分析可以幫助了解植物對環(huán)境變化反應(yīng)的敏感期。權(quán)重基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析（WGCNA）分析不僅可以識別具有較高生物學(xué)意義的模塊;還可以識別那些具有高連通性或模塊中的基因。因此,為深入挖掘與泡桐叢枝病發(fā)病密切相關(guān)的基因,解析泡桐叢枝病發(fā)病機理,本研究選取不同濃度及不同時間點(20 mg·L^-1和60 mg·L^-1甲基磺酸甲酯methyl methane sulfonate,MMS)處理的白花泡桐患病幼苗和白花泡桐健康幼苗,模擬了泡桐由感病→形態(tài)恢復(fù)健康→患病以及逐漸恢復(fù)健康的過程。利用Illumina HiSeq高通量測序技術(shù),構(gòu)建泡桐響應(yīng)植原體侵染的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫。采用“標(biāo)準(zhǔn)分析”和“網(wǎng)絡(luò)分析”兩種方法對轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。在標(biāo)準(zhǔn)分析中,通過對各比對組進(jìn)行比對分析挖掘與泡桐叢枝病發(fā)生相關(guān)... 

【文章來源】：河南農(nóng)業(yè)大學(xué)河南省

【文章頁數(shù)】：68 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

技術(shù)路線Fig.1Technicalroute

轉(zhuǎn)錄組生物信息分析流程圖

TopHat2分析流程


本文編號：3079351