發(fā)布時(shí)間：2021-03-11 08:12

　　本研究旨在檢測水貂成纖維細(xì)胞生長因子5（fibroblast growth factor 5, FGF5）基因多態(tài)性,解析該基因變異位點(diǎn)與水貂毛長性狀的相關(guān)性。首先對30只美國短毛黑水貂的FGF5基因部分序列進(jìn)行了擴(kuò)增和測序;使用DNAMAN軟件分析發(fā)現(xiàn),FGF5基因內(nèi)含子1中T376C位點(diǎn)存在多態(tài)性位點(diǎn);通過在線酶切軟件NEBcutter V2.0分析表明,Taq I內(nèi)切酶可用于該SNP位點(diǎn)基因分型。以美國短毛黑水貂和丹麥咖啡水貂共計(jì)252個(gè)血液樣本的基因組DNA作為模板,采用PCR-RFLP技術(shù)對252只美國短毛黑水貂和丹麥咖啡水貂FGF5基因T376C位點(diǎn)進(jìn)行了基因分型,并將該位點(diǎn)與水貂毛長性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果表明:PCR擴(kuò)增片段在376位點(diǎn)存在突變,該位點(diǎn)存在2個(gè)等位基因T和C,形成TT、TC和CC 3種基因型,該變異位點(diǎn)在美國短毛黑水貂群體中為中度多態(tài)（0.25 <PIC <0.05）,而在丹麥咖啡水貂群體中表現(xiàn)為高度多態(tài)（PIC> 0.25）;X²檢驗(yàn)結(jié)果顯示,T376C位點(diǎn)在美國短毛黑水貂群體處于Hardy-Weinberg平衡狀... 

【文章來源】：特產(chǎn)研究. 2020,42(05)

【文章頁數(shù)】：5 頁

【部分圖文】：

CC、TC和TT基因型的測序峰圖

芍??FGF5基因T376C位點(diǎn)存在3種基因型，分別為TT（621bp）、TC（621、376和245bp）和CC（376和245bp）。123456M7891011621bp376bp245bp注：M.DNAMarker(8000、5000、3000、2000、1000、750、500、250、100bp)；1、2、6、7均為CC基因型；3、4、5、8、10、11均為TC基因型；9為TT基因型。Note:M.DNAMarker(8000,5000,3000,2000,1000,750,500,250,100bp);1,2,6,7wereCCgenotype;3,4,5,8,10,11wereCCgenotype;9.TTgenotype.圖2FGF5基因T376C位點(diǎn)的酶切分析結(jié)果Fig.2ResultsofFGF5T376ClocusdigestedwithⅠenzyme2.3FGF5基因型頻率和等位基因頻率分布由表1可知，美國短毛黑水貂群體中檢測到3種基因型，以CC型居多，TC型次之，TT型最少，而C等位基因頻率高于T等位基因頻率；咖啡水貂群體中以TC型居多，CC型次之，TT型最少，而C等位基因頻率與T等位基因頻率相差不大。表1FGF5基因T376C位點(diǎn)的基因型頻率和等位基因頻率Table1GenotypefrequencyandallelefrequencyofFGF5T376Clocus群體Population基因型頻率Genotypefrequency等位基因頻率AllelefrequencyTTTCCCTCDH0.0080.0780.9140.0480.952KF0.0150.8170.1680.4230.577注：DH為美國短毛黑水貂群體，KF為丹麥咖啡水貂群體。Note:DHrepresentsAmericanshort-hairedblackmink,KFrepresentsDen-markcoffeemink.2.4不同水貂品種FGF5基因T376C位點(diǎn)的遺傳多樣性分析由表2可知，T376C多態(tài)位點(diǎn)在美國短毛黑水貂群體中為中度多態(tài)（0.25＜PIC＜0.05），而在丹麥咖啡水貂群體中表現(xiàn)為高度多態(tài)（PIC＞

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號：3076162