胃癌是我國最常見的消化道惡性腫瘤,且世界上近一半的新發(fā)胃癌位于我國。胃癌以高度侵襲性和易遠處轉(zhuǎn)移為特征,死亡率在我國所有惡性腫瘤中位列第三,但其侵襲轉(zhuǎn)移的具體機制仍遠不清楚。上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化（Epithelial-mesenchymal transition,EMT）可以使腫瘤細胞獲得侵襲轉(zhuǎn)移的能力,是腫瘤轉(zhuǎn)移的開端,但其分子基礎(chǔ)仍有待深入研究。近年來,高通量測序技術(shù)促進了我們對腫瘤分子特征的認識,也為EMT的研究帶來新的契機。胃癌的高通量測序研究揭示了以高侵襲轉(zhuǎn)移性為特征的間質(zhì)樣胃癌即EMT分子亞型的存在。為了進一步認識胃癌EMT的具體分子機制,本課題利用公共數(shù)據(jù)庫研究了間質(zhì)樣胃癌相關(guān)的基因表達譜,并通過生信方法篩選出了胃癌EMT的潛在關(guān)鍵基因TNS1。我們提出TNS1通過激活EMT上游關(guān)鍵驅(qū)動基因從而促進胃癌EMT及侵襲轉(zhuǎn)移,且影響胃癌患者預后的科學假說,并通過細胞功能實驗、機制研究及臨床關(guān)聯(lián)研究予以驗證。本課題初步揭示了 TNS1在胃癌侵襲轉(zhuǎn)移中的作用和機制,為抑制胃癌侵襲轉(zhuǎn)移提供了理論依據(jù)和潛在的治療靶點,有利于胃癌精準治療的發(fā)展。第一部分 間質(zhì)樣胃癌的分子特征及EMT關(guān)鍵基因篩選... 

【文章來源】：江蘇大學江蘇省

【文章頁數(shù)】：64 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

間質(zhì)樣胃癌和上皮樣胃癌間差異表達基因.A:火山圖;B:TOP50基因熱圖

胃癌上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化關(guān)鍵基因TNS1的識別和驗證及臨床關(guān)聯(lián)研究6圖2.基因集富集分析結(jié)果Fig2.Genesetenrichmentanalysisresults2.3WGCNA及關(guān)鍵基因篩選間質(zhì)樣和上皮樣胃癌兩組間表達量比值對數(shù)值(logFC)大于1的顯著差異表達基因共1230個。WGCNA將這些基因分為3種顏色的模塊，我們關(guān)注與間質(zhì)樣胃癌正相關(guān)的藍綠色模塊，模塊內(nèi)基因與間質(zhì)樣胃癌呈現(xiàn)高度的正相關(guān)(SpearmanR=0.83;p<0.001)。通過對基因的功能關(guān)聯(lián)程度評分并排序，我們從中篩選出了最為核心的30個基因。其中，TNS1基因與胃癌EMT的關(guān)系尚未見報道。

江蘇大學碩士學位論文7圖3.加權(quán)基因共表達網(wǎng)絡分析.A:聚類樹狀圖；B:模塊-特質(zhì)關(guān)系圖；C:；D:通過對藍綠色模塊內(nèi)基因的功能關(guān)聯(lián)程度評分并排序，我們從中篩選出了最為核心的30個基因。Fig3.Weightedgeneco-expressionnetworkanalysis.A:clusteringdendrogram;B:module-traitrelationshipdiagram;C:relationshipbetweengenesinblue-greenmodulesandPNISignificance;D:Byscoringandrankingthedegreeoffunctionalassociationofthegenesintheblue-greenmodule,weselectedthe30coregenesfromthem.

【參考文獻】：
期刊論文
[1]Tensin1蛋白與胃癌臨床病理特征及預后的關(guān)系[J]. 曹一鑫,李小琴,王宏宇,任琎,顧漢剛,嚴玲花,陳文琪,王德強.  中華消化外科雜志. 2018 (06)
[2]亞洲癌癥研究組新近提出胃癌分子分型的淺析[J]. 于穎彥.  診斷學理論與實踐. 2015(06)
[3]Snail2在子宮內(nèi)膜癌中的表達及意義[J]. 王洪偉,胡建國.  現(xiàn)代預防醫(yī)學. 2012(17)



本文編號：3073476