胃癌是我國最常見的消化道惡性腫瘤,且世界上近一半的新發(fā)胃癌位于我國。胃癌以高度侵襲性和易遠處轉移為特征,死亡率在我國所有惡性腫瘤中位列第三,但其侵襲轉移的具體機制仍遠不清楚。上皮間質轉化（Epithelial-mesenchymal transition,EMT）可以使腫瘤細胞獲得侵襲轉移的能力,是腫瘤轉移的開端,但其分子基礎仍有待深入研究。近年來,高通量測序技術促進了我們對腫瘤分子特征的認識,也為EMT的研究帶來新的契機。胃癌的高通量測序研究揭示了以高侵襲轉移性為特征的間質樣胃癌即EMT分子亞型的存在。為了進一步認識胃癌EMT的具體分子機制,本課題利用公共數(shù)據(jù)庫研究了間質樣胃癌相關的基因表達譜,并通過生信方法篩選出了胃癌EMT的潛在關鍵基因TNS1。我們提出TNS1通過激活EMT上游關鍵驅動基因從而促進胃癌EMT及侵襲轉移,且影響胃癌患者預后的科學假說,并通過細胞功能實驗、機制研究及臨床關聯(lián)研究予以驗證。本課題初步揭示了 TNS1在胃癌侵襲轉移中的作用和機制,為抑制胃癌侵襲轉移提供了理論依據(jù)和潛在的治療靶點,有利于胃癌精準治療的發(fā)展。第一部分 間質樣胃癌的分子特征及EMT關鍵基因篩選... 

【文章來源】：江蘇大學江蘇省

【文章頁數(shù)】：64 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

間質樣胃癌和上皮樣胃癌間差異表達基因.A:火山圖;B:TOP50基因熱圖

胃癌上皮間質轉化關鍵基因TNS1的識別和驗證及臨床關聯(lián)研究6圖2.基因集富集分析結果Fig2.Genesetenrichmentanalysisresults2.3WGCNA及關鍵基因篩選間質樣和上皮樣胃癌兩組間表達量比值對數(shù)值(logFC)大于1的顯著差異表達基因共1230個。WGCNA將這些基因分為3種顏色的模塊，我們關注與間質樣胃癌正相關的藍綠色模塊，模塊內基因與間質樣胃癌呈現(xiàn)高度的正相關(SpearmanR=0.83;p<0.001)。通過對基因的功能關聯(lián)程度評分并排序，我們從中篩選出了最為核心的30個基因。其中，TNS1基因與胃癌EMT的關系尚未見報道。

江蘇大學碩士學位論文7圖3.加權基因共表達網(wǎng)絡分析.A:聚類樹狀圖；B:模塊-特質關系圖；C:；D:通過對藍綠色模塊內基因的功能關聯(lián)程度評分并排序，我們從中篩選出了最為核心的30個基因。Fig3.Weightedgeneco-expressionnetworkanalysis.A:clusteringdendrogram;B:module-traitrelationshipdiagram;C:relationshipbetweengenesinblue-greenmodulesandPNISignificance;D:Byscoringandrankingthedegreeoffunctionalassociationofthegenesintheblue-greenmodule,weselectedthe30coregenesfromthem.

【參考文獻】：
期刊論文
[1]Tensin1蛋白與胃癌臨床病理特征及預后的關系[J]. 曹一鑫,李小琴,王宏宇,任琎,顧漢剛,嚴玲花,陳文琪,王德強.  中華消化外科雜志. 2018 (06)
[2]亞洲癌癥研究組新近提出胃癌分子分型的淺析[J]. 于穎彥.  診斷學理論與實踐. 2015(06)
[3]Snail2在子宮內膜癌中的表達及意義[J]. 王洪偉,胡建國.  現(xiàn)代預防醫(yī)學. 2012(17)



本文編號：3073476