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山胡椒果實LgBASS2和LgMPC2基因克隆與表達分析

發(fā)布時間:2021-03-08 19:56
  山胡椒(Lindera glauca),系樟科山胡椒屬(Lindera Thunb.)的芳香植物,廣泛分布于中國秦嶺及淮河以南各個省區(qū),其果實中含有大量芳香油,可供于食用和藥用,極具開發(fā)利用價值。本研究基于實驗室前期獲得的山胡椒果實轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),對其進一步注釋和篩選得到參與萜類前體物質(zhì)丙酮酸轉(zhuǎn)運的兩個基因LgBASS2和LgMPC2,開展其全長序列克隆及表達載體構(gòu)建與遺傳轉(zhuǎn)化擬南芥研究,進而通過對質(zhì)體LgBASS2和線粒體LgMPC2轉(zhuǎn)基因擬南芥植株的表型和基因表達分析,探究兩種丙酮酸轉(zhuǎn)運蛋白對山胡椒果實萜類合成代謝的影響;同時,開展基于染色體步移技術(shù)的LgBASS2基因啟動子序列克隆及其順式作用元件的預(yù)測分析,通過重組植物表達載體構(gòu)建以及煙草瞬時轉(zhuǎn)化和GUS組織化學(xué)染色分析,以期明確LgBASS2基因啟動子的組織表達特性和順式作用元件種類。通過上述研究,可得到如下主要結(jié)果:1.成功克隆得到山胡椒果實的丙酮酸轉(zhuǎn)運蛋白基因LgBASS2和LgMPC2,兩者序列長度分別為1,251 bp和327 bp;借助生物信息學(xué)手段和相關(guān)軟件,分別對二者的核酸序列和編碼蛋白的氨基酸進行分析,并對基因編碼... 

【文章來源】:北京林業(yè)大學(xué)北京市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:98 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

山胡椒果實LgBASS2和LgMPC2基因克隆與表達分析


圖1-1萜類物質(zhì)合成代謝途徑??Figure?1-1?Anabolic?pathway?of?terpenes??

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&S2和MPC2基因的克隆及生物信息學(xué)分析???2.3結(jié)果與分析??2.3.1山胡椒果實總RNA的獲取??利用RN53-EASYspin?Plus多糖多酚/復(fù)雜植物RNA快速提取試劑盒,提取獲得??山胡椒果實總RNA,電泳結(jié)果表明,28S?rRNA和18S?rRNA兩條比較清晰、而5S?rRNA??條帶較淺;此外,28SrRNA條帶的亮度是18SrRNA的2倍,這說明從山胡椒果實??中提取得到的總RNA降解少、產(chǎn)量高,可用于后續(xù)分子生物學(xué)實驗。??28S??18S?P??圖2-1山胡椒果實總RNA電泳圖??Figure?2-1?Electrophoresis?map?of?total?RNA?from?L.?^lauca?fruits??2.3.2山胡椒果實和AgA/PC?基因編碼區(qū)序列的克隆??以山胡椒果實總RNA為模板,通過NCBI上ORF?finder在線工具,分析山胡椒??果實和MPC2基因的幵放閱讀框ORF?(Open?reading?frame),可知兩個序列從??384-1684?bp和120-446?hp各自分別構(gòu)成一個完整的開放閱讀框,可分別編碼416和??108個氨基酸。通過PCR擴增得到大小約1300?bp和350?bp片段,將片段進行切膠??回收之后連接載體進行測序,通過與己知片段進行對比,證明為目的基因,大小分別??為丨251?bp和327?bp?(圖2-2?),分別命名為和基因。??a?M?1?b?m?2??IB??—wsibp??ooobp??2&0bp??B9??圖2-2山胡椒果實Z^5/^2和基因擴梢屯泳閣??注:a:?擴增電泳圖,1:?Lg5必S2基因擴增產(chǎn)物,b:?

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&S2和MPC2基因的克隆及生物信息學(xué)分析???2.3結(jié)果與分析??2.3.1山胡椒果實總RNA的獲取??利用RN53-EASYspin?Plus多糖多酚/復(fù)雜植物RNA快速提取試劑盒,提取獲得??山胡椒果實總RNA,電泳結(jié)果表明,28S?rRNA和18S?rRNA兩條比較清晰、而5S?rRNA??條帶較淺;此外,28SrRNA條帶的亮度是18SrRNA的2倍,這說明從山胡椒果實??中提取得到的總RNA降解少、產(chǎn)量高,可用于后續(xù)分子生物學(xué)實驗。??28S??18S?P??圖2-1山胡椒果實總RNA電泳圖??Figure?2-1?Electrophoresis?map?of?total?RNA?from?L.?^lauca?fruits??2.3.2山胡椒果實和AgA/PC?基因編碼區(qū)序列的克隆??以山胡椒果實總RNA為模板,通過NCBI上ORF?finder在線工具,分析山胡椒??果實和MPC2基因的幵放閱讀框ORF?(Open?reading?frame),可知兩個序列從??384-1684?bp和120-446?hp各自分別構(gòu)成一個完整的開放閱讀框,可分別編碼416和??108個氨基酸。通過PCR擴增得到大小約1300?bp和350?bp片段,將片段進行切膠??回收之后連接載體進行測序,通過與己知片段進行對比,證明為目的基因,大小分別??為丨251?bp和327?bp?(圖2-2?),分別命名為和基因。??a?M?1?b?m?2??IB??—wsibp??ooobp??2&0bp??B9??圖2-2山胡椒果實Z^5/^2和基因擴梢屯泳閣??注:a:?擴增電泳圖,1:?Lg5必S2基因擴增產(chǎn)物,b:?


本文編號:3071584

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