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基于全基因組數(shù)據(jù)對丹參普遍脅迫蛋白基因的研究

發(fā)布時間:2021-03-08 19:39
  丹參(Salvia miltiorrhiza Bunge)是唇形科鼠尾草屬植物,其藥用部位根和根莖中含有多種活性成分,被廣泛應用于心血管類疾病的治療。丹參具有外源基因轉(zhuǎn)化體系成熟、基因組小等優(yōu)勢,被認為是一種“模式藥用植物”。隨著全球氣候變暖、土壤鹽漬化等環(huán)境問題加重,人工種植丹參的產(chǎn)量越來越受到各種逆境脅迫的制約。普遍脅迫蛋白(USP)是一種能廣泛響應多種脅迫,提高微生物和植物抗逆能力的蛋白,目前在丹參中對該類蛋白的研究非常有限。本實驗基于丹參基因組數(shù)據(jù)庫,利用擬南芥中的UspA保守結(jié)構(gòu)域序列在丹參的數(shù)據(jù)庫中檢索并確認了 32個含有UspA結(jié)構(gòu)域的丹參普遍脅迫蛋白基因(SmUSP)家族成員,利用生物信息學方法研究了 32個成員的基本性質(zhì)以及它們的進化關(guān)系。然后,通過qRT-PCR技術(shù)研究了 32個成員在丹參的根、莖、葉、花和種子中的表達模式,以及它們對鹽、熱、鹽和熱的共同脅迫的響應情況。最后,從克隆得到的9個成員中選擇了 3個構(gòu)建到原核表達載體中,檢測過表達SmUSP基因的大腸桿菌對鹽、熱以及它們的共同脅迫的抵御能力。本研究為深入研究SmUSP基因的功能,培育抗逆能力強的丹參新品種提... 

【文章來源】:陜西師范大學陜西省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:74 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

基于全基因組數(shù)據(jù)對丹參普遍脅迫蛋白基因的研究


不同脅迫共同作用對植物造成的影響總結(jié)}syFigI-2Summaryofeffectsforvariousstresscombinationsonplants.

示意圖,二級結(jié)構(gòu),示意圖,蛋白


第1章文獻綜述述??構(gòu)是由一系列a螺旋和p折疊組成,這些結(jié)構(gòu)都跟USP蛋白的ATP結(jié),如圖1-3[63]。隨后,Sousa等對流感嗜血桿菌中的USP蛋白(1JMV)究,發(fā)現(xiàn)其序列與大腸桿菌中UspA蛋白具有68%的一致性,但和MJ0的是,1JMV蛋白不能結(jié)合ATP[67]。這些證據(jù)表明,UspA結(jié)構(gòu)域可以一種可以結(jié)合ATP,以MJ0577蛋白為代表;另一種不能結(jié)合ATP,以為代表[68]。Zarembinski等人通過對MJ0577及其亞家族中其他UspA對比發(fā)現(xiàn),UspA蛋白的空間結(jié)構(gòu)與人的電子轉(zhuǎn)運黃素蛋白、DNA光酰tRNA合成酶空間結(jié)構(gòu)十分相似%],Aravind等人的進化分析也發(fā)現(xiàn)在進化上的親緣關(guān)系,于是他們提出,UspA家族是-個功能分化程度族[69]。??

丹參,脅迫蛋白,擬南芥,基因


擬南芥基因6個,丹參基因6個。C組中有9個成員,其中擬南芥基因4個,丹參??基因5個。B組最少,共有2個成員,擬南芥和丹參中各1個。??對丹參中32個USP家族成員進行保守基序分析結(jié)果如圖2-2:??100[??StnUSP4???—?———??A'jl?'??SmUSP13??M??1?Sn,USP20.????SmUSP14???100>??SmUSP31???*-J.?I?SmUSPIS*?__??StnUSPO????A1???SmUSP24???***??1001??SmUSP25??—?—?—???SmUSP23???■?--???—?SmUSP”??.?-SmUSPB*?**?*?1??w??—?I?1001??Sm〇SP19??f^3C5r:^^*??[?I?SmUSP26??■■■■??_〇s|?I??SmUSP27??______??1?'?<tm ̄|?!??SmUSPIB*?■■■■??lOO?>?SmU8P32??■■■■■■■■■??.?SmUSPIO*?_____?????—I????SmUSP2???麵^^^*??hd,— ̄?smusps.?—?■^■圓???〇〇[-^\—?Sn

【參考文獻】:
期刊論文
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[2]氣候變化對中國農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的影響研究進展[J]. 郭建平.  應用氣象學報. 2015(01)
[3]丹參轉(zhuǎn)錄因子SmbHLH93的克隆及表達模式分析[J]. 周宏駿,武玉翠,晉鑫鑫,饒麗華,王喆之.  中草藥. 2014(23)
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[6]探討道地藥材研究的模式生物及模型[J]. 黃璐琦,戴住波,呂冬梅,袁媛.  中國中藥雜志. 2009(09)
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博士論文
[1]基于聯(lián)合測序技術(shù)的丹參活性成分生物合成及調(diào)控機制研究[D]. 徐志超.北京協(xié)和醫(yī)學院 2016

碩士論文
[1]水楊酸誘導的丹參轉(zhuǎn)錄組測序[D]. 張曉茹.西北農(nóng)林科技大學 2016
[2]基于EST技術(shù)的丹參大規(guī);蚩寺〖捌渫庠椿蜣D(zhuǎn)化技術(shù)研究[D]. 閆亞平.陜西師范大學 2005



本文編號:3071562

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