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基于全基因組數(shù)據(jù)對(duì)丹參普遍脅迫蛋白基因的研究

發(fā)布時(shí)間:2021-03-08 19:39
  丹參(Salvia miltiorrhiza Bunge)是唇形科鼠尾草屬植物,其藥用部位根和根莖中含有多種活性成分,被廣泛應(yīng)用于心血管類疾病的治療。丹參具有外源基因轉(zhuǎn)化體系成熟、基因組小等優(yōu)勢,被認(rèn)為是一種“模式藥用植物”。隨著全球氣候變暖、土壤鹽漬化等環(huán)境問題加重,人工種植丹參的產(chǎn)量越來越受到各種逆境脅迫的制約。普遍脅迫蛋白(USP)是一種能廣泛響應(yīng)多種脅迫,提高微生物和植物抗逆能力的蛋白,目前在丹參中對(duì)該類蛋白的研究非常有限。本實(shí)驗(yàn)基于丹參基因組數(shù)據(jù)庫,利用擬南芥中的UspA保守結(jié)構(gòu)域序列在丹參的數(shù)據(jù)庫中檢索并確認(rèn)了 32個(gè)含有UspA結(jié)構(gòu)域的丹參普遍脅迫蛋白基因(SmUSP)家族成員,利用生物信息學(xué)方法研究了 32個(gè)成員的基本性質(zhì)以及它們的進(jìn)化關(guān)系。然后,通過qRT-PCR技術(shù)研究了 32個(gè)成員在丹參的根、莖、葉、花和種子中的表達(dá)模式,以及它們對(duì)鹽、熱、鹽和熱的共同脅迫的響應(yīng)情況。最后,從克隆得到的9個(gè)成員中選擇了 3個(gè)構(gòu)建到原核表達(dá)載體中,檢測過表達(dá)SmUSP基因的大腸桿菌對(duì)鹽、熱以及它們的共同脅迫的抵御能力。本研究為深入研究SmUSP基因的功能,培育抗逆能力強(qiáng)的丹參新品種提... 

【文章來源】:陜西師范大學(xué)陜西省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:74 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

基于全基因組數(shù)據(jù)對(duì)丹參普遍脅迫蛋白基因的研究


不同脅迫共同作用對(duì)植物造成的影響總結(jié)}syFigI-2Summaryofeffectsforvariousstresscombinationsonplants.

示意圖,二級(jí)結(jié)構(gòu),示意圖,蛋白


第1章文獻(xiàn)綜述述??構(gòu)是由一系列a螺旋和p折疊組成,這些結(jié)構(gòu)都跟USP蛋白的ATP結(jié),如圖1-3[63]。隨后,Sousa等對(duì)流感嗜血桿菌中的USP蛋白(1JMV)究,發(fā)現(xiàn)其序列與大腸桿菌中UspA蛋白具有68%的一致性,但和MJ0的是,1JMV蛋白不能結(jié)合ATP[67]。這些證據(jù)表明,UspA結(jié)構(gòu)域可以一種可以結(jié)合ATP,以MJ0577蛋白為代表;另一種不能結(jié)合ATP,以為代表[68]。Zarembinski等人通過對(duì)MJ0577及其亞家族中其他UspA對(duì)比發(fā)現(xiàn),UspA蛋白的空間結(jié)構(gòu)與人的電子轉(zhuǎn)運(yùn)黃素蛋白、DNA光酰tRNA合成酶空間結(jié)構(gòu)十分相似%],Aravind等人的進(jìn)化分析也發(fā)現(xiàn)在進(jìn)化上的親緣關(guān)系,于是他們提出,UspA家族是-個(gè)功能分化程度族[69]。??

丹參,脅迫蛋白,擬南芥,基因


擬南芥基因6個(gè),丹參基因6個(gè)。C組中有9個(gè)成員,其中擬南芥基因4個(gè),丹參??基因5個(gè)。B組最少,共有2個(gè)成員,擬南芥和丹參中各1個(gè)。??對(duì)丹參中32個(gè)USP家族成員進(jìn)行保守基序分析結(jié)果如圖2-2:??100[??StnUSP4???—?———??A'jl?'??SmUSP13??M??1?Sn,USP20.????SmUSP14???100>??SmUSP31???*-J.?I?SmUSPIS*?__??StnUSPO????A1???SmUSP24???***??1001??SmUSP25??—?—?—???SmUSP23???■?--???—?SmUSP”??.?-SmUSPB*?**?*?1??w??—?I?1001??Sm〇SP19??f^3C5r:^^*??[?I?SmUSP26??■■■■??_〇s|?I??SmUSP27??______??1?'?<tm ̄|?!??SmUSPIB*?■■■■??lOO?>?SmU8P32??■■■■■■■■■??.?SmUSPIO*?_____?????—I????SmUSP2???麵^^^*??hd,— ̄?smusps.?—?■^■圓???〇〇[-^\—?Sn

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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博士論文
[1]基于聯(lián)合測序技術(shù)的丹參活性成分生物合成及調(diào)控機(jī)制研究[D]. 徐志超.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2016

碩士論文
[1]水楊酸誘導(dǎo)的丹參轉(zhuǎn)錄組測序[D]. 張曉茹.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[2]基于EST技術(shù)的丹參大規(guī);蚩寺〖捌渫庠椿蜣D(zhuǎn)化技術(shù)研究[D]. 閆亞平.陜西師范大學(xué) 2005



本文編號(hào):3071562

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