甚于全基因組甲基化芯片技術(shù)篩選和驗證結(jié)直腸癌相關(guān)基因異常甲基化研究
發(fā)布時間:2021-03-08 19:25
研究背景和目的結(jié)直腸癌(colorectal cancer,CRC)是威脅人類健康的最常見惡性腫瘤之一。2018年,全球結(jié)直腸癌發(fā)病例數(shù)約為180萬,結(jié)直腸癌死亡例數(shù)約為86萬。我國是上世紀的結(jié)直腸癌低發(fā)國家之一。然而,近年來隨著我國社會經(jīng)濟的高速發(fā)展,傳統(tǒng)的飲食結(jié)構(gòu)和生活方式被打破,居民的腫瘤發(fā)生率和腫瘤譜已發(fā)生明顯變化。結(jié)直腸癌發(fā)病率呈明顯上升趨勢,已成為威脅我國居民健康的重要公共衛(wèi)生問題。結(jié)直腸癌的發(fā)生發(fā)展是環(huán)境因素、遺傳因素和表觀遺傳因素共同參與下的多因素、多階段、多步驟過程,具有較長的癌前病變階段,F(xiàn)階段對于結(jié)直腸癌的遺傳變異因素研究已相對成熟,而表觀遺傳學研究則方興未艾。DNA甲基化是表觀遺傳學中最重要的調(diào)控機制之一,可通過調(diào)控編碼基因轉(zhuǎn)錄水平,參與胚胎發(fā)育、印記失活、細胞分化以及衰老等多種重要生物學過程。通過以往的候選基因分析以及表觀基因組關(guān)聯(lián)研究(epigenome-wide association study,EWAS),已識別出不少與結(jié)直腸癌發(fā)生相關(guān)的異常甲基化基因,并發(fā)現(xiàn)異常甲基化改變在癌前病變階段已經(jīng)存在。然而目前很少有研究系統(tǒng)性地定義腸上皮細胞惡性轉(zhuǎn)化過程中異...
【文章來源】:浙江大學浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:136 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
研究總體技術(shù)路線圖
浙江大學博士學位論文2材料與方法19表6樣本DNA提取質(zhì)量結(jié)果樣本編號濃度(ng/μl)體積(μl)總量(μg)A260/A280A260/A23001258.509023.271.902.2402138.609012.471.902.3803234.009021.061.912.4004298.309026.851.922.4005141.809012.761.912.4006108.90909.801.942.4507167.609015.081.922.4208301.509027.141.932.3909294.309026.491.922.4010326.109029.351.912.3711174.009015.661.902.4412262.109023.591.892.1313180.409016.241.902.3514226.609020.391.922.4215199.909017.991.912.371699.90908.991.922.4717270.809024.371.912.3718179.309016.141.932.411999.10908.921.892.4620115.709010.411.892.4021211.308016.901.912.1522263.209023.691.912.4123323.109029.081.902.2724404.709036.421.902.31圖3DNA完整性瓊脂凝膠電泳圖
浙江大學博士學位論文2材料與方法202.7.3焦磷酸測序質(zhì)量控制在焦磷酸測序?qū)嶒灥臏蕚潆A段,合成目標DNA序列完全未甲基化標準品(甲基化程度0%)和完全甲基化標準品(甲基化程度100%)。將0%甲基化標準品和100%甲基化標準品按比例稀釋為0%,25%,50%,75%和100%濃度,以5梯度標準品對焦磷酸測序進行質(zhì)量控制,評價檢測結(jié)果的準確性。如圖4所示,采用Pearson相關(guān)系數(shù)分析檢測結(jié)果顯示,檢測值與標準值之間的相關(guān)系數(shù)R大于0.99(P<0.001),表明焦磷酸測序檢測結(jié)果的準確度高。圖4焦磷酸測序檢測結(jié)果準確性分析圖
【參考文獻】:
期刊論文
[1]2015年中國惡性腫瘤流行情況分析[J]. 鄭榮壽,孫可欣,張思維,曾紅梅,鄒小農(nóng),陳茹,顧秀瑛,魏文強,赫捷. 中華腫瘤雜志. 2019 (01)
本文編號:3071544
【文章來源】:浙江大學浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:136 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
研究總體技術(shù)路線圖
浙江大學博士學位論文2材料與方法19表6樣本DNA提取質(zhì)量結(jié)果樣本編號濃度(ng/μl)體積(μl)總量(μg)A260/A280A260/A23001258.509023.271.902.2402138.609012.471.902.3803234.009021.061.912.4004298.309026.851.922.4005141.809012.761.912.4006108.90909.801.942.4507167.609015.081.922.4208301.509027.141.932.3909294.309026.491.922.4010326.109029.351.912.3711174.009015.661.902.4412262.109023.591.892.1313180.409016.241.902.3514226.609020.391.922.4215199.909017.991.912.371699.90908.991.922.4717270.809024.371.912.3718179.309016.141.932.411999.10908.921.892.4620115.709010.411.892.4021211.308016.901.912.1522263.209023.691.912.4123323.109029.081.902.2724404.709036.421.902.31圖3DNA完整性瓊脂凝膠電泳圖
浙江大學博士學位論文2材料與方法202.7.3焦磷酸測序質(zhì)量控制在焦磷酸測序?qū)嶒灥臏蕚潆A段,合成目標DNA序列完全未甲基化標準品(甲基化程度0%)和完全甲基化標準品(甲基化程度100%)。將0%甲基化標準品和100%甲基化標準品按比例稀釋為0%,25%,50%,75%和100%濃度,以5梯度標準品對焦磷酸測序進行質(zhì)量控制,評價檢測結(jié)果的準確性。如圖4所示,采用Pearson相關(guān)系數(shù)分析檢測結(jié)果顯示,檢測值與標準值之間的相關(guān)系數(shù)R大于0.99(P<0.001),表明焦磷酸測序檢測結(jié)果的準確度高。圖4焦磷酸測序檢測結(jié)果準確性分析圖
【參考文獻】:
期刊論文
[1]2015年中國惡性腫瘤流行情況分析[J]. 鄭榮壽,孫可欣,張思維,曾紅梅,鄒小農(nóng),陳茹,顧秀瑛,魏文強,赫捷. 中華腫瘤雜志. 2019 (01)
本文編號:3071544
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