發(fā)布時(shí)間：2021-02-26 19:20

　　第一部分:胰腺疾病的生物信息學(xué)分析目的:本課題組前期的蛋白質(zhì)組學(xué)研究篩選胰腺癌患者與胰腺良性腫瘤,慢性胰腺炎與正常胰腺組織之間的差異表達(dá)蛋白,探究胰腺癌的發(fā)病機(jī)制,為胰腺疾病的基因診斷和治療提供導(dǎo)向。方法:通過(guò)本課題組前期的蛋白質(zhì)組學(xué)分析得出的數(shù)據(jù),結(jié)合Uni Prot數(shù)據(jù)庫(kù)篩除反庫(kù)、污染庫(kù)、無(wú)定量值蛋白。使用R軟件對(duì)上述每組的差異蛋白分別進(jìn)行GO和Pathway的分析,通過(guò)交互基因檢索工具的數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò),結(jié)合Cytoscape處理模塊,統(tǒng)計(jì)蛋白Z-score。結(jié)果:篩出匹配蛋白3927個(gè),胰腺癌組差異蛋白有258個(gè),上調(diào)203個(gè),下調(diào)55個(gè),功能基因涉及106個(gè)相關(guān)term;良性胰腺腫瘤組差異蛋白有72個(gè),上調(diào)60個(gè),下調(diào)12個(gè),功能基因涉及涉及70個(gè)相關(guān)term;慢性胰腺炎組差異蛋白有205個(gè),上調(diào)161個(gè),下調(diào)44個(gè),功能基因涉及涉及106個(gè)相關(guān)term。結(jié)論:本文從生物信息學(xué)方向?qū)ふ乙认侔�、良性胰腺腫瘤、慢性胰腺炎的相干蛋白,鑒定了這些胰腺疾病在分子水平的差異表達(dá)和功能特征,為胰腺疾病的治療提供潛在的治療靶點(diǎn)。第二部分:胰腺導(dǎo)管腺癌中BCLAF1蛋白的表達(dá)及臨床意義目的... 

【文章來(lái)源】：安徽醫(yī)科大學(xué)安徽省

【文章頁(yè)數(shù)】：59 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

差異蛋白火山圖：X軸為差異蛋白質(zhì)的倍數(shù)（log2），Y軸為Pvalue（-log10值），深色點(diǎn)是不顯著蛋白質(zhì)，紅點(diǎn)為上調(diào)的蛋白質(zhì)，綠點(diǎn)為下調(diào)的蛋白質(zhì)

安徽醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文12圖2差異蛋白的GO富集分析：選取每個(gè)功能注釋本體前5個(gè)作圖，功能注釋本體代表富集的P值從小到大排列。左側(cè)為上調(diào)差異基因富集圖，右側(cè)為下調(diào)差異基因圖。三個(gè)圖從上至下依次對(duì)應(yīng)的為：PC，BPT，CP。紅色、綠色、藍(lán)色分別為生物學(xué)過(guò)程、細(xì)胞學(xué)組分、分子生物學(xué)功能。

安徽醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文13圖3差異蛋白參與的信號(hào)通路：圓圈的直徑為參與該通路的蛋白數(shù)；點(diǎn)的顏色代表則富集蛋白的顯著程度。圖ABC依次對(duì)應(yīng)為PC、BPT、CP上調(diào)的差異蛋白富集通路；圖DEF依次對(duì)應(yīng)為PC、BPT、CP下調(diào)的差異蛋白富集通路。結(jié)果顯示：胰腺癌高表達(dá)基因與41個(gè)BP、31個(gè)CC以及24個(gè)MF有關(guān)。其主要涉及蛋白靶向內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、共翻譯轉(zhuǎn)運(yùn)、翻譯起始、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激等過(guò)程；主要作用于核糖體，胞質(zhì)、細(xì)胞-基質(zhì)粘附連接、細(xì)胞-底物連接、細(xì)胞外基質(zhì)；分子功能主要包括與rRNA、嘌呤核苷、細(xì)胞外基質(zhì)等結(jié)合，影響轉(zhuǎn)氨酶、絲氨酸水解酶、谷胱甘肽過(guò)氧化物酶、金屬內(nèi)肽酶抑制劑活性。低表達(dá)基因與8個(gè)CC以及2個(gè)MF有關(guān)。通路分析發(fā)現(xiàn)，癌差異基因主要與SRP依賴的共翻譯蛋白靶向膜、真核翻譯延伸、肽鏈延伸等、補(bǔ)體級(jí)聯(lián)等調(diào)節(jié)有關(guān)。胰腺良性腫瘤高表達(dá)基因與27個(gè)BP、13個(gè)CC以及21個(gè)MF。其中包括血小板脫粒、一氧化氮調(diào)節(jié)的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、血管生成的調(diào)節(jié)過(guò)程等。低表達(dá)基因涉及9個(gè)BP。通路分析發(fā)現(xiàn)，高表達(dá)基因主要細(xì)胞外基質(zhì)、膠原鏈三聚化、整合素細(xì)胞表面相互作用有關(guān)。而低表達(dá)基因則與金屬硫蛋白、金屬離子的反應(yīng)有關(guān)慢性胰腺炎高表達(dá)基因與179個(gè)BP、63個(gè)CC以及40個(gè)MF有關(guān)。低表達(dá)基因與10個(gè)BP、2個(gè)CC以及4個(gè)MF有關(guān)。其中參與中性脂質(zhì)、甘油酸酯分


本文編號(hào)：3053050