SQUA啟動子結(jié)合蛋白-box （SQUAMOSA PROMOTER BINDING PROTEIN box, SBP-box）基因家族編碼一類植物特有的SBP轉(zhuǎn)錄因子,在植物界分布廣泛,參與植物生長、發(fā)育、繁衍等多方面調(diào)控,包括胚胎發(fā)生、次生產(chǎn)物合成、脅迫應(yīng)答等,在作物改良方面具有價值。本研究主要通過生物信息學(xué)以及實時熒光定量PCR （quantitative real-time PCR, qRT-PCR）方法,對高粱（Sorghum bicolor） SbSBP15基因進(jìn)行克隆和表達(dá)分析。研究結(jié)果顯示,該基因CDS全長1 227 bp （GenBank No. MT634207）,編碼408個氨基酸。SbSBP15蛋白含有1個典型SBP結(jié)構(gòu)域,相對分子質(zhì)量為42.19 kD,等電點為8.87;與玉米（Zea mays）相應(yīng)的同源基因親緣關(guān)系最近;亞細(xì)胞定位主要在細(xì)胞核;具較強(qiáng)的親水性;蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析表明,SbSBP15可與蛋白激酶相互作用。qRT-PCR分析表明,SbSBP15在高粱莖中表達(dá)量最高,受干旱和鹽脅迫誘導(dǎo)表達(dá);植物激素吲哚乙酸（indole-3-acetic acid... 

【文章來源】：農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2020,28(09)北大核心

【文章頁數(shù)】：13 頁

【部分圖文】：

SbSBP15基因的組織特異性表達(dá)

SbSBP15基因在模擬干旱及鹽脅迫條件下的表達(dá)分析

利用Plantcare網(wǎng)站預(yù)測順勢作用元件顯示，SbSBP15不僅存在較豐富的CAT框、CAAT框及TATA框、種子特異性表達(dá)元件A-box、分生組織特異性表達(dá)元件CCGTCC-motif，還存在豐富的生物或非生物抗性的順勢作用元件，包括脅迫響應(yīng)元件(stress response element,STRE)、傷害響應(yīng)元件as-1及WRE3 (Wnt response element 3)、光響應(yīng)元件G-box、脫落酸響應(yīng)元件(ABA response element,ABRE)、MYB蛋白結(jié)合位點的CCAAT框和Myb-binding、低溫響應(yīng)因子Unnamed＿4、干旱響應(yīng)元件MYB、參與茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,MeJA)反應(yīng)的順式作用調(diào)控元件CGTCA-motif及TGACG-motif。上述結(jié)果提示，SbSBP15基因可能參與高粱應(yīng)對脅迫的反應(yīng)。2.3.2 SbSBP15基因組織表達(dá)分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]基于PCR的兩步法絲狀真菌基因敲除方法[J]. 謝鑫,蔣君梅,王勇,任明見.  種子. 2019(04)
[2]釀酒高粱研究芻議[J]. 季樹太,王佐民,郭書剛.  釀酒. 2019(02)
[3]影響植物葉片衰老因素的研究進(jìn)展[J]. 初夢圓,于延沖.  生命科學(xué). 2019(02)
[4]SbSBP5基因參與高粱對干旱脅迫的響應(yīng)[J]. 常建忠,董春林,張正,楊睿,蔣丹,張一中,張彥琴,楊麗莉,閆鳳霞.  植物遺傳資源學(xué)報. 2019(05)
[5]小麥SBP基因家族生物信息學(xué)分析[J]. 呂亮杰,陳希勇,胡夢蕓,劉玉平,孫麗靜,馬樂,李輝.  華北農(nóng)學(xué)報. 2018(06)
[6]桃ERF轉(zhuǎn)錄因子家族生物信息學(xué)分析及芽萌發(fā)相關(guān)基因篩選[J]. 趙雪惠,王慶杰,李晨,陳修德,肖偉,高東升,付喜玲.  植物學(xué)報. 2018(05)
[7]菜豆SBP-box基因家族的分子特征與進(jìn)化分析[J]. 胡利宗,王俊生,劉紅占,趙錦慧,王秋霞,紀(jì)秀娥.  分子植物育種. 2018(14)
[8]葡萄SBP-box轉(zhuǎn)錄因子家族的生物信息學(xué)分析及其應(yīng)答激素調(diào)控葡萄果實成熟的作用[J]. 崔夢杰,王晨,冷翔鵬,吳偉民,湯崴,張文穎,朱旭東,賈海鋒,沈文飚,房經(jīng)貴.  南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2018(03)
[9]毛竹SBP轉(zhuǎn)錄因子基因的全基因組鑒定和表達(dá)分析[J]. 孫化雨,楊意宏,婁永峰,李利超,趙韓生,王思寧,高志民.  基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2017(10)
[10]運(yùn)用TMHMM軟件對水稻水通道蛋白OsPIP2:6跨膜結(jié)構(gòu)的分析[J]. 姚清國.  河南農(nóng)業(yè). 2017(29)



本文編號：3032914