梨小食心蟲CYP6家族基因的分子特性及其對殺蟲劑的響應(yīng)
發(fā)布時間:2021-02-12 15:47
梨小食心蟲的危害歷史悠久,是世界性的蛀果類害蟲,目前防治梨小食心蟲最有效的手段是化學(xué)防治。由于化學(xué)農(nóng)藥的大量重復(fù)使用,梨小食心蟲對化學(xué)農(nóng)藥產(chǎn)生了抗性。細(xì)胞色素P450是昆蟲體內(nèi)代謝殺蟲劑和植物次生代謝物質(zhì)的重要代謝酶系,解毒代謝增強(qiáng)是昆蟲產(chǎn)生抗性的主要原因,現(xiàn)在已經(jīng)有許多實驗證明昆蟲細(xì)胞色素P450 CYP6家族的功能與昆蟲代謝殺蟲劑有關(guān)。本文利用生物信息學(xué)方法分析梨小食心蟲細(xì)胞色素P450 CYP6家族基因的分子特性,推測其可能的功能,從分子水平揭示不同農(nóng)藥對CYP6家族基因的誘導(dǎo)特性,主要研究結(jié)果如下:1.利用生物信息學(xué)的方法對8條梨小食心蟲細(xì)胞色素P450基因進(jìn)行分析,分別命名為CYP6B74、CYP6AB112、CYP6AB113、CYP6AB114、CYP6AB115、CYP6AB116、CYP6AB117、CYP6AN35,cDNA全長為1566 bp1957 bp,編碼498530個氨基酸,均為親水性;多序列比對顯示梨小食心蟲細(xì)胞色素P450存在昆蟲細(xì)胞色素P450的保守域;系統(tǒng)發(fā)育顯示梨小食心蟲細(xì)胞色素P450在種內(nèi)和種間均有...
【文章來源】:山西農(nóng)業(yè)大學(xué)山西省
【文章頁數(shù)】:53 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
梨小食心蟲細(xì)胞CYP6AB117
22區(qū)的“A/GGXD/ETT/S”序列[87]。將新得到的基因蛋白序列與已知功能的蛋白序列進(jìn)行比對,可以根據(jù)已知蛋白的功能預(yù)測出新蛋白序列可能具有的結(jié)構(gòu)和功能。通過多序列比對基因的特征序列使我們可以對蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)可以進(jìn)行合理的預(yù)測,對于三維結(jié)構(gòu)的構(gòu)建提供了重要依據(jù)。3.1.8梨小食心蟲細(xì)胞色素P450s的三級結(jié)構(gòu)預(yù)測在SWISS-MODEL在線網(wǎng)址進(jìn)行梨小食心蟲P450s蛋白質(zhì)的同源建模(圖3)。蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)是在二級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上借助各種次級鍵卷曲折疊成特定的球狀分子結(jié)構(gòu)的構(gòu)象。在蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)中,α螺旋、β折疊、β轉(zhuǎn)角和無規(guī)則卷曲等結(jié)構(gòu)元件相對二級結(jié)構(gòu)進(jìn)一步卷曲或者折疊,肽鏈中的原子均會重新排列,使蛋白質(zhì)呈現(xiàn)更高級的空間結(jié)構(gòu)。從梨小食心蟲P450s的SWISS-MODEL同源建模結(jié)果來看,CYP6AB112、CYP6AB113、CYP6AB114、CYP6AB115、CYP6AB116、CYP6AB117、CYP6AN35的蛋白三級結(jié)構(gòu)很相似,可能行使著相同或相似的功能;CYP6B74基因和其余7個基因不屬于同一亞家族,可能是由于蛋白三級結(jié)構(gòu)與其它基因的結(jié)構(gòu)不同。CYP6B74CYP6AB112CYP6AB113CYP6AB114
23圖3梨小食心蟲細(xì)胞色素P450s三級結(jié)構(gòu)預(yù)測Fig.3ThetertiarystructurepredictionofP450sGrapholitamolesta(busck)注:圖中紅色表示α螺旋,黃色表示β折疊,綠色表示無規(guī)則卷曲,紫色表示血紅素結(jié)合區(qū)Note:Inthefigure,theredisAlphahelix;yellowisβ-fold,thegreenisRandomcoil,andpurpleisheme-bindingregion.3.1.9梨小食心蟲細(xì)胞色素P450s的聚類分析利用MEGA7.0軟件,采用鄰接法,對3個目八種昆蟲的39個細(xì)胞色素P450s氨基酸序列進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析,Bootstrap進(jìn)行1000次重復(fù)(圖4)。CYP6AB115CYP6AB116CYP6AB117CYP6AN35
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]灰飛虱對殺蟲劑的抗性分子機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 徐鹿,趙鈞,趙春青,徐德進(jìn),徐廣春,許小龍,張亞楠,張月亮,韓召軍,顧中言. 農(nóng)藥學(xué)學(xué)報. 2018(02)
[2]我國白紋伊蚊對三種擬除蟲菊酯類殺蟲劑抗性檢測診斷劑量的建立[J]. 高景鵬,陳翰明,馬雅軍. 昆蟲學(xué)報. 2018(01)
[3]稻縱卷葉螟雄蛾內(nèi)生殖系統(tǒng)形態(tài)指標(biāo)在性誘測報中的應(yīng)用[J]. 陳慶華,曾娟,曾偉,李慶,陳曉娟,鄒禹. 昆蟲學(xué)報. 2017(08)
[4]亞致死劑量氟啶蟲胺腈對灰飛虱細(xì)胞色素P450的影響[J]. 徐鹿,趙春青,徐德進(jìn),徐廣春,許小龍,顧中言. 植物保護(hù)學(xué)報. 2017(04)
[5]三種殺蟲劑及其混配使用對梨小食心蟲Grapholita molesta(Busck)卵的室內(nèi)觸殺效果[J]. 姜軍俠,趙玉玉,郭麗娜,朱點,李怡萍,仵均祥. 應(yīng)用昆蟲學(xué)報. 2017 (04)
[6]梨小食心蟲初孵幼蟲藥效測定方法研究[J]. 庾琴,封云濤,郭曉君,杜恩強(qiáng),郭貴明,張潤祥. 果樹學(xué)報. 2017(11)
[7]梨小食心蟲生物防治研究進(jìn)展[J]. 冉紅凡,路子云,劉文旭,馬愛紅,劉小俠,孫海鵬,李建成,張青文. 應(yīng)用昆蟲學(xué)報. 2016(05)
[8]有機(jī)磷類殺蟲劑對非靶標(biāo)水生動物的毒性機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 李勃,馬瑜,張育輝. 農(nóng)藥學(xué)學(xué)報. 2016(04)
[9]4種藥劑防治桃樹梨小食心蟲藥效比較和殘留分析初探[J]. 張怡,沈迎春,徐煒楓,陸彥,王科峰,潘斌,龔衛(wèi)良,王亞虹. 農(nóng)藥. 2016(03)
[10]三種殺蟲劑對梨小食心蟲和桃小食心蟲的殘效研究[J]. 宮慶濤,武海斌,張坤鵬,孫麗娜,孫瑞紅. 果樹學(xué)報. 2016(07)
博士論文
[1]飛蝗細(xì)胞色素P450基因的分子特性及功能研究[D]. 郭艷瓊.山西大學(xué) 2012
碩士論文
[1]粘蟲細(xì)胞色素P450的克隆和特性分析[D]. 劉月慶.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]甘藍(lán)夜蛾細(xì)胞色素P450基因的克隆及功能分析[D]. 周夏.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[3]灰飛虱對溴氰菊酯抗性相關(guān)解毒酶基因的功能分析[D]. 張萬方.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[4]寄主因子對梨小食心蟲的發(fā)生、生長發(fā)育及其產(chǎn)卵選擇性的影響[D]. 楊小凡.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[5]馬鈴薯甲蟲對有機(jī)磷類和氨基甲酸酯類殺蟲劑的抗藥性及其機(jī)理[D]. 王志田.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
本文編號:3031090
【文章來源】:山西農(nóng)業(yè)大學(xué)山西省
【文章頁數(shù)】:53 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
梨小食心蟲細(xì)胞CYP6AB117
22區(qū)的“A/GGXD/ETT/S”序列[87]。將新得到的基因蛋白序列與已知功能的蛋白序列進(jìn)行比對,可以根據(jù)已知蛋白的功能預(yù)測出新蛋白序列可能具有的結(jié)構(gòu)和功能。通過多序列比對基因的特征序列使我們可以對蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)可以進(jìn)行合理的預(yù)測,對于三維結(jié)構(gòu)的構(gòu)建提供了重要依據(jù)。3.1.8梨小食心蟲細(xì)胞色素P450s的三級結(jié)構(gòu)預(yù)測在SWISS-MODEL在線網(wǎng)址進(jìn)行梨小食心蟲P450s蛋白質(zhì)的同源建模(圖3)。蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)是在二級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上借助各種次級鍵卷曲折疊成特定的球狀分子結(jié)構(gòu)的構(gòu)象。在蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)中,α螺旋、β折疊、β轉(zhuǎn)角和無規(guī)則卷曲等結(jié)構(gòu)元件相對二級結(jié)構(gòu)進(jìn)一步卷曲或者折疊,肽鏈中的原子均會重新排列,使蛋白質(zhì)呈現(xiàn)更高級的空間結(jié)構(gòu)。從梨小食心蟲P450s的SWISS-MODEL同源建模結(jié)果來看,CYP6AB112、CYP6AB113、CYP6AB114、CYP6AB115、CYP6AB116、CYP6AB117、CYP6AN35的蛋白三級結(jié)構(gòu)很相似,可能行使著相同或相似的功能;CYP6B74基因和其余7個基因不屬于同一亞家族,可能是由于蛋白三級結(jié)構(gòu)與其它基因的結(jié)構(gòu)不同。CYP6B74CYP6AB112CYP6AB113CYP6AB114
23圖3梨小食心蟲細(xì)胞色素P450s三級結(jié)構(gòu)預(yù)測Fig.3ThetertiarystructurepredictionofP450sGrapholitamolesta(busck)注:圖中紅色表示α螺旋,黃色表示β折疊,綠色表示無規(guī)則卷曲,紫色表示血紅素結(jié)合區(qū)Note:Inthefigure,theredisAlphahelix;yellowisβ-fold,thegreenisRandomcoil,andpurpleisheme-bindingregion.3.1.9梨小食心蟲細(xì)胞色素P450s的聚類分析利用MEGA7.0軟件,采用鄰接法,對3個目八種昆蟲的39個細(xì)胞色素P450s氨基酸序列進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析,Bootstrap進(jìn)行1000次重復(fù)(圖4)。CYP6AB115CYP6AB116CYP6AB117CYP6AN35
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]灰飛虱對殺蟲劑的抗性分子機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 徐鹿,趙鈞,趙春青,徐德進(jìn),徐廣春,許小龍,張亞楠,張月亮,韓召軍,顧中言. 農(nóng)藥學(xué)學(xué)報. 2018(02)
[2]我國白紋伊蚊對三種擬除蟲菊酯類殺蟲劑抗性檢測診斷劑量的建立[J]. 高景鵬,陳翰明,馬雅軍. 昆蟲學(xué)報. 2018(01)
[3]稻縱卷葉螟雄蛾內(nèi)生殖系統(tǒng)形態(tài)指標(biāo)在性誘測報中的應(yīng)用[J]. 陳慶華,曾娟,曾偉,李慶,陳曉娟,鄒禹. 昆蟲學(xué)報. 2017(08)
[4]亞致死劑量氟啶蟲胺腈對灰飛虱細(xì)胞色素P450的影響[J]. 徐鹿,趙春青,徐德進(jìn),徐廣春,許小龍,顧中言. 植物保護(hù)學(xué)報. 2017(04)
[5]三種殺蟲劑及其混配使用對梨小食心蟲Grapholita molesta(Busck)卵的室內(nèi)觸殺效果[J]. 姜軍俠,趙玉玉,郭麗娜,朱點,李怡萍,仵均祥. 應(yīng)用昆蟲學(xué)報. 2017 (04)
[6]梨小食心蟲初孵幼蟲藥效測定方法研究[J]. 庾琴,封云濤,郭曉君,杜恩強(qiáng),郭貴明,張潤祥. 果樹學(xué)報. 2017(11)
[7]梨小食心蟲生物防治研究進(jìn)展[J]. 冉紅凡,路子云,劉文旭,馬愛紅,劉小俠,孫海鵬,李建成,張青文. 應(yīng)用昆蟲學(xué)報. 2016(05)
[8]有機(jī)磷類殺蟲劑對非靶標(biāo)水生動物的毒性機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 李勃,馬瑜,張育輝. 農(nóng)藥學(xué)學(xué)報. 2016(04)
[9]4種藥劑防治桃樹梨小食心蟲藥效比較和殘留分析初探[J]. 張怡,沈迎春,徐煒楓,陸彥,王科峰,潘斌,龔衛(wèi)良,王亞虹. 農(nóng)藥. 2016(03)
[10]三種殺蟲劑對梨小食心蟲和桃小食心蟲的殘效研究[J]. 宮慶濤,武海斌,張坤鵬,孫麗娜,孫瑞紅. 果樹學(xué)報. 2016(07)
博士論文
[1]飛蝗細(xì)胞色素P450基因的分子特性及功能研究[D]. 郭艷瓊.山西大學(xué) 2012
碩士論文
[1]粘蟲細(xì)胞色素P450的克隆和特性分析[D]. 劉月慶.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]甘藍(lán)夜蛾細(xì)胞色素P450基因的克隆及功能分析[D]. 周夏.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[3]灰飛虱對溴氰菊酯抗性相關(guān)解毒酶基因的功能分析[D]. 張萬方.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[4]寄主因子對梨小食心蟲的發(fā)生、生長發(fā)育及其產(chǎn)卵選擇性的影響[D]. 楊小凡.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[5]馬鈴薯甲蟲對有機(jī)磷類和氨基甲酸酯類殺蟲劑的抗藥性及其機(jī)理[D]. 王志田.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
本文編號:3031090
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/3031090.html
最近更新
教材專著