中國水仙FOMT家族基因的克隆及FOMT2基因的調(diào)控因子篩選
發(fā)布時間:2021-02-08 01:11
植物的O-甲基轉(zhuǎn)移酶(OMTs)被認為參與了植物次生代謝產(chǎn)物的甲基化,尤其是在苯丙烷類和類黃酮化合物合成途徑,而類黃酮代謝途徑生物合成過程中的酶促反應(yīng)受到轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控,有關(guān)中國水仙(Narcissustazettavar.chinensis)轉(zhuǎn)錄因子與花色基因的相互作用鮮有報道。本文重點克隆了中國水仙FOMTs(Flavonol-O-Methyltransferases,類黃酮O-甲基轉(zhuǎn)移酶)基因并進行生物信息學(xué)分析與熒光定量PCR分析,探討了 NtFOMTs基因的特征,并利用酵母單雜交技術(shù)(Yeast-One-Hybrid)建立中國水仙酵母單雜交文庫,通過酵母單雜交實驗篩選出對其有轉(zhuǎn)錄調(diào)控作用的轉(zhuǎn)錄因子,對轉(zhuǎn)錄因子進行分析,以期為研究中國水仙花色基因提供新的借鑒。主要研究結(jié)果如下:1.分離了類黃酮生物合成途徑相關(guān)基因FOMTs:根據(jù)RNA-seq數(shù)據(jù)庫篩選差異表達的中國水仙FOMT基因,共獲得3條基因,采用RT-PCR與RACE技術(shù)相結(jié)合,從水仙中成功克隆出3條FOMTs基因的 cDNA 全長,分別為NtF MT1,NtFOMT2,NtFOMT3,NtFOMT;騝DNA全長為1...
【文章來源】:福建農(nóng)林大學(xué)福建省
【文章頁數(shù)】:93 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-1?R2R3-MYB對類黃酮生物合成的調(diào)控[68,70,71]??Fig?1-1.?R2R3-MYB?regulation?of?the?flavonoid?biosyntheti?
??MR^/T2基因cDNA全長為1404?bp,其中5'?UTR長度為33?bp?J?UTR長??度為279bp,?ORF為1092bp,編碼363個氨基酸(圖2-3)。??MFOM73基因cDNA全長為1206?bp,其中YUTR長度為117?bp,ORF為??1089?bp
以中國水仙花瓣基因組DNA為模板,擴増得到MFOMD的基因組序列,與??cDNA序列進行比較后,去除內(nèi)含子部分,克隆得到了類黃酮合成途徑相關(guān)基因??FOMT?的5’端調(diào)控序列(圖3-1?)。??M?1??750?■??圖3-1:?基因5’端調(diào)控序列的克隆??M:?2000?Maker;?1:?MFOMT2基因5’端調(diào)控序列的PCR產(chǎn)物??Fig.?3-1?Cloning?of?the?regulatory?sequence?of?the?5'?terminal?in?NtF0MT2??M?:?2000?Maker;?1:?The?amplification?product?of?NtFOMT2?55?terminal??2.2?MFOMr2基因啟動子順式作用元件分析??將得到的5’端調(diào)控序列提交到在線軟件PlantCare上進行分析(見圖3-2),??結(jié)果表明中國水仙FOMT2基因啟動子序列除包含必需的起始轉(zhuǎn)錄位點??(txanscriptionstartsite,TSS)?TATA-box、CAAT增強子外,還有ATCT-motif,??ACE,?G-box,?Spl等多個光響應(yīng)元件。此外,該啟動子序列還含有真菌誘導(dǎo)子??響應(yīng)元件Box-Wl,表達分生組織相關(guān)元件CAT-box,參與茉莉酸甲酯響應(yīng)的順??式調(diào)控元件CGTCA-motif、TGACG-motif,?MYB參與抗旱誘導(dǎo)的結(jié)合位點MBS??元件
本文編號:3023133
【文章來源】:福建農(nóng)林大學(xué)福建省
【文章頁數(shù)】:93 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-1?R2R3-MYB對類黃酮生物合成的調(diào)控[68,70,71]??Fig?1-1.?R2R3-MYB?regulation?of?the?flavonoid?biosyntheti?
??MR^/T2基因cDNA全長為1404?bp,其中5'?UTR長度為33?bp?J?UTR長??度為279bp,?ORF為1092bp,編碼363個氨基酸(圖2-3)。??MFOM73基因cDNA全長為1206?bp,其中YUTR長度為117?bp,ORF為??1089?bp
以中國水仙花瓣基因組DNA為模板,擴増得到MFOMD的基因組序列,與??cDNA序列進行比較后,去除內(nèi)含子部分,克隆得到了類黃酮合成途徑相關(guān)基因??FOMT?的5’端調(diào)控序列(圖3-1?)。??M?1??750?■??圖3-1:?基因5’端調(diào)控序列的克隆??M:?2000?Maker;?1:?MFOMT2基因5’端調(diào)控序列的PCR產(chǎn)物??Fig.?3-1?Cloning?of?the?regulatory?sequence?of?the?5'?terminal?in?NtF0MT2??M?:?2000?Maker;?1:?The?amplification?product?of?NtFOMT2?55?terminal??2.2?MFOMr2基因啟動子順式作用元件分析??將得到的5’端調(diào)控序列提交到在線軟件PlantCare上進行分析(見圖3-2),??結(jié)果表明中國水仙FOMT2基因啟動子序列除包含必需的起始轉(zhuǎn)錄位點??(txanscriptionstartsite,TSS)?TATA-box、CAAT增強子外,還有ATCT-motif,??ACE,?G-box,?Spl等多個光響應(yīng)元件。此外,該啟動子序列還含有真菌誘導(dǎo)子??響應(yīng)元件Box-Wl,表達分生組織相關(guān)元件CAT-box,參與茉莉酸甲酯響應(yīng)的順??式調(diào)控元件CGTCA-motif、TGACG-motif,?MYB參與抗旱誘導(dǎo)的結(jié)合位點MBS??元件
本文編號:3023133
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