ZNF750基因啟動子異常甲基化在食管鱗癌發(fā)病中的作用研究
發(fā)布時間:2021-02-07 21:35
目的:研究鋅指蛋白750(zinc finger protein 750,ZNF750)基因啟動子的異常甲基化對其表達(dá)的改變及甲基化抑制劑對食管鱗癌細(xì)胞生物學(xué)行為的影響,并初步探討其調(diào)控機(jī)制。方法:運(yùn)用癌癥基因組圖譜計劃(The Cancer Genome Atlas,TCGA)食管癌數(shù)據(jù)庫分析ZNF750基因表達(dá)與其甲基化程度的相關(guān)性;通過University of California at Santa Cruz(UCSC)基因組數(shù)據(jù)庫及CpG Island Prediction預(yù)測ZNF750基因啟動子甲基化位點(diǎn);亞硫酸氫鹽測序PCR(bisulfite sequencing PCR,BSP)方法檢測不同食管鱗癌細(xì)胞系中ZNF750啟動子區(qū)的甲基化水平,并采用反轉(zhuǎn)錄定量PCR(Reverse transcription quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR)法檢測不同食管鱗癌細(xì)胞系中ZNF750基因的表達(dá);篩選高甲基化的食管鱗癌細(xì)胞系KYSE140和KYSE150,甲基化抑制劑5-氮雜-2’-脫氧胞苷(5-Aza-2’-de...
【文章來源】:山西醫(yī)科大學(xué)山西省
【文章頁數(shù)】:59 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
英文摘要
常用縮寫詞中英文對照表
前言
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
2 結(jié)果
2.1 生物信息學(xué)預(yù)測ZNF750基因啟動子區(qū)存在CpG島甲基化位點(diǎn)
2.2 食管鱗癌細(xì)胞中ZNF750基因啟動子甲基化程度與其表達(dá)呈負(fù)相關(guān)
2.3 5-Aza-dC誘導(dǎo)食管鱗癌細(xì)胞中ZNF750基因的表達(dá)
2.4 5-Aza-dC對食管鱗癌細(xì)胞生物學(xué)行為的影響
2.5 5-Aza-dC對食管鱗癌細(xì)胞凋亡及周期相關(guān)蛋白表達(dá)的影響
2.6 成功構(gòu)建pGL3-Basic-P600、pGL3-Basic-P600-HpaII、pGL3-Basic-P600-Hha熒光報告載體
2.7 DNA甲基化抑制ZNF750基因啟動子的轉(zhuǎn)錄活性
3 討論
4 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
致謝
在學(xué)期間承擔(dān)/參與的科研課題與研究成果
個人簡歷
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]腫瘤微環(huán)境中的甲基化調(diào)節(jié)機(jī)制(英文)[J]. Meng-wen ZHANG,Kenji FUJIWARA,Xu CHE,Shu ZHENG,Lei ZHENG. Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology). 2017(05)
[2]Hospital type- and volume-outcome relationships in esophageal cancer patients receiving non-surgical treatments[J]. Po-Kuei Hsu,Hui-Shan Chen,Bing-Yen Wang,Shiao-Chi Wu,Chao-Yu Liu,Chih-Hsun Shih,Chia-Chuan Liu. World Journal of Gastroenterology. 2015(04)
[3]Epidemiology of esophageal cancer[J]. Yuwei Zhang. World Journal of Gastroenterology. 2013(34)
[4]利用補(bǔ)丁甲基化技術(shù)構(gòu)建特殊報告載體檢測DNA甲基化對FCER1G基因啟動子的調(diào)控活性[J]. 梁云生,趙明,梁功平,尹恒,陸前進(jìn). 中南大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版). 2013(02)
[5]癌表觀遺傳調(diào)控與癌癥治療[J]. 劉志堅,孫英麗. 中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報. 2011(04)
本文編號:3022861
【文章來源】:山西醫(yī)科大學(xué)山西省
【文章頁數(shù)】:59 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
英文摘要
常用縮寫詞中英文對照表
前言
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
2 結(jié)果
2.1 生物信息學(xué)預(yù)測ZNF750基因啟動子區(qū)存在CpG島甲基化位點(diǎn)
2.2 食管鱗癌細(xì)胞中ZNF750基因啟動子甲基化程度與其表達(dá)呈負(fù)相關(guān)
2.3 5-Aza-dC誘導(dǎo)食管鱗癌細(xì)胞中ZNF750基因的表達(dá)
2.4 5-Aza-dC對食管鱗癌細(xì)胞生物學(xué)行為的影響
2.5 5-Aza-dC對食管鱗癌細(xì)胞凋亡及周期相關(guān)蛋白表達(dá)的影響
2.6 成功構(gòu)建pGL3-Basic-P600、pGL3-Basic-P600-HpaII、pGL3-Basic-P600-Hha熒光報告載體
2.7 DNA甲基化抑制ZNF750基因啟動子的轉(zhuǎn)錄活性
3 討論
4 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
致謝
在學(xué)期間承擔(dān)/參與的科研課題與研究成果
個人簡歷
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]腫瘤微環(huán)境中的甲基化調(diào)節(jié)機(jī)制(英文)[J]. Meng-wen ZHANG,Kenji FUJIWARA,Xu CHE,Shu ZHENG,Lei ZHENG. Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology). 2017(05)
[2]Hospital type- and volume-outcome relationships in esophageal cancer patients receiving non-surgical treatments[J]. Po-Kuei Hsu,Hui-Shan Chen,Bing-Yen Wang,Shiao-Chi Wu,Chao-Yu Liu,Chih-Hsun Shih,Chia-Chuan Liu. World Journal of Gastroenterology. 2015(04)
[3]Epidemiology of esophageal cancer[J]. Yuwei Zhang. World Journal of Gastroenterology. 2013(34)
[4]利用補(bǔ)丁甲基化技術(shù)構(gòu)建特殊報告載體檢測DNA甲基化對FCER1G基因啟動子的調(diào)控活性[J]. 梁云生,趙明,梁功平,尹恒,陸前進(jìn). 中南大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版). 2013(02)
[5]癌表觀遺傳調(diào)控與癌癥治療[J]. 劉志堅,孫英麗. 中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報. 2011(04)
本文編號:3022861
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