水稻抗白葉枯病基因Xa7的克隆研究
發(fā)布時(shí)間:2021-02-07 20:00
水稻抗白葉枯病基因Xa7是一個(gè)顯性抗病基因,具有廣譜、持久、高抗的抗性,并且在水稻全生育期都保持優(yōu)良的抗性。對(duì)Xa7基因的克隆,將為闡明其調(diào)控的抗病分子機(jī)理打下堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ),同時(shí)通過(guò)發(fā)掘其抗病功能,能夠在水稻抗病分子育種中展現(xiàn)出重要的應(yīng)用價(jià)值。通過(guò)對(duì)Xa7的定位區(qū)間內(nèi)基因組序列進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),與其他水稻品種相比存在較大差別,序列較為復(fù)雜。無(wú)法通過(guò)圖位克隆的方法將Xa7基因克隆。因此本實(shí)驗(yàn)室前期通過(guò)對(duì)含有Xa7基因的水稻品種鎮(zhèn)恢084進(jìn)行輻射誘變,篩選到在Xa7定位區(qū)間染色體缺失106 kb片段的感病突變體,與之前120 kb的定位區(qū)間有25 kb的重疊區(qū),由此將Xa7定位在25 kb的區(qū)間內(nèi)。為了克隆Xa7基因,本研究利用構(gòu)建亞克隆載體的方法對(duì)Xa7基因進(jìn)行進(jìn)一步克隆。通過(guò)利用1個(gè)覆蓋25 kb定位區(qū)間的陽(yáng)性單克隆,通過(guò)PCR的方法獲得覆蓋這25 kb區(qū)間的四個(gè)亞克隆片段(P1、P2、P3、P4),并將得到的片段連接到載體pCAMBIA1300上,構(gòu)建了覆蓋Xa7定位區(qū)間的4個(gè)亞克隆載體,然后將其轉(zhuǎn)基因到感病品種中花11中。通過(guò)對(duì)轉(zhuǎn)基因苗進(jìn)行引物鑒定和對(duì)陽(yáng)性轉(zhuǎn)基因植株進(jìn)行接菌PXO86驗(yàn)證...
【文章來(lái)源】:浙江師范大學(xué)浙江省
【文章頁(yè)數(shù)】:62 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
植物對(duì)細(xì)菌抗性進(jìn)化模型[22]
第一章文獻(xiàn)綜述7需要將內(nèi)桿與內(nèi)膜環(huán)相結(jié)合,并通過(guò)“套筒”狀的結(jié)構(gòu)來(lái)實(shí)現(xiàn)。針頭會(huì)穿過(guò)病原物的細(xì)胞表面到達(dá)外界,在一些T3SSs中被SctA針尖復(fù)合體覆蓋。尖端復(fù)合物有助于轉(zhuǎn)運(yùn)子SctE和SctB在宿主細(xì)胞膜上組裝易位孔;這在細(xì)菌胞質(zhì)和宿主細(xì)胞胞質(zhì)之間建立了一個(gè)管道,從而實(shí)現(xiàn)效應(yīng)蛋白的直接傳遞。針頭的長(zhǎng)度由SctP蛋白控制,SctU和SctW調(diào)節(jié)分泌層次,這是蛋白質(zhì)底物分泌的時(shí)間順序[38-41]。此外,許多分泌蛋白質(zhì)需要同源伴侶來(lái)分泌[42,43]。一種有功能性的T3SS,包含基底體和針,也被稱為“針復(fù)合體”,相當(dāng)于鞭毛的彎鉤基體復(fù)合物(HBB)。整個(gè)T3SS裝置也被稱為“注射體”(圖1.2)。而效應(yīng)蛋白最終將通過(guò)這個(gè)注射體侵染進(jìn)入植物細(xì)胞,從而擾亂植物的防御系統(tǒng)。圖1.2細(xì)菌三型分泌系統(tǒng)模式圖[44]Figure1.2BacterialtypeIIIsecretionsystemsmodel1.2.3白葉枯病菌的相關(guān)效應(yīng)因子根據(jù)結(jié)構(gòu)和產(chǎn)物的不同,目前細(xì)菌的無(wú)毒基因可以分avrBs3/pthA家族和avrRxv/yopJ家族這兩個(gè)家族,而發(fā)現(xiàn)的大部分的無(wú)毒基因都是屬于avrBs3/pthA家族,因此也把a(bǔ)vrBs3/pthA家族稱為avr/pth家族或avrBs3家族[23]。同時(shí)研究發(fā)現(xiàn)pthA基因家族的結(jié)構(gòu)與avrBs3基因家族的結(jié)構(gòu)存在著很高的相似性,正是由于存在這種相似度,顯示avrBs3/pthA家族成員中無(wú)毒基因和有毒性基因是并存的。
第一章文獻(xiàn)綜述9定位于植物細(xì)胞核[50]。而NLSs對(duì)于AvrBs3同系物的重要性也得到了證實(shí),例如白葉枯病菌中的AvrXa7。事實(shí)上,AD的突變和缺失都會(huì)使蛋白質(zhì)失去活性,并且AD部分地功能可以被單純皰疹病毒VP16的異源AD所取代,這也證明了該結(jié)構(gòu)域的功能重要性(圖1.3)[1,51,52]。圖1.3AvrBs3蛋白組成[1]Figure1.3CompositionofAvrBs3protein2水稻中抗白葉枯病基因2.1已克隆的抗白葉枯病基因據(jù)報(bào)道,目前國(guó)際挖掘鑒定的抗白葉枯病基因有40多個(gè)[53,54]。分析發(fā)現(xiàn)顯性基因?yàn)橹。這些水稻白葉枯抗病基因中,Xa1、Xa3/Xa26、Xa4、xa5、Xa10、xa13、Xa21、Xa23、xa25、Xa27和xa41(t)這11個(gè)基因已成功被克隆,并有相關(guān)報(bào)道[55,56]。這些已克隆的抗性基因中除了Xa1基因編碼的蛋白是NB-LRR類型,其他抗病基因都編碼很多不同類型的蛋白質(zhì),這表明水稻抗白葉枯病基因在功能上是變化多樣的(如表1.1)。表1.1已克隆的11個(gè)水稻白葉枯病抗性基因Table1.1ElevenclonedriceblightresistancegenesGeneCommentsClassCognateElicitor/EffectorReferencesXa21Extracellular,membrane,andintracellulardomains;kinase;broadresistanceRLKAx21[57,58]
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]我國(guó)水稻白葉枯病菌致病型劃分和水稻抗病育種中應(yīng)注意的問(wèn)題[J]. 陳功友,徐正銀,楊陽(yáng)陽(yáng),鄒麗芳,朱勃. 上海交通大學(xué)學(xué)報(bào)(農(nóng)業(yè)科學(xué)版). 2019(01)
[2]近30年國(guó)家和湖南省審定的水稻品種白葉枯病抗性分析[J]. 高杜娟,唐善軍,陳友德,李友榮. 中國(guó)稻米. 2017(01)
[3]水稻抗病功能基因組研究進(jìn)展[J]. 張海濤,王石平. 生命科學(xué). 2016(10)
[4]水稻Xa1基因啟動(dòng)子的克隆及功能分析[J]. 牟少亮,官德義,林琳,賴燕,何水林. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2012(05)
[5]中國(guó)雜交水稻白葉枯病抗性的遺傳改良[J]. 章琦. 中國(guó)水稻科學(xué). 2009(02)
[6]水稻白葉枯病抗性基因鑒定進(jìn)展及其利用[J]. 章琦. 中國(guó)水稻科學(xué). 2005(05)
[7]水稻白葉枯病抗性基因的研究與分子育種[J]. 翟文學(xué),朱立煌. 生物工程進(jìn)展. 1999(06)
本文編號(hào):3022749
【文章來(lái)源】:浙江師范大學(xué)浙江省
【文章頁(yè)數(shù)】:62 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
植物對(duì)細(xì)菌抗性進(jìn)化模型[22]
第一章文獻(xiàn)綜述7需要將內(nèi)桿與內(nèi)膜環(huán)相結(jié)合,并通過(guò)“套筒”狀的結(jié)構(gòu)來(lái)實(shí)現(xiàn)。針頭會(huì)穿過(guò)病原物的細(xì)胞表面到達(dá)外界,在一些T3SSs中被SctA針尖復(fù)合體覆蓋。尖端復(fù)合物有助于轉(zhuǎn)運(yùn)子SctE和SctB在宿主細(xì)胞膜上組裝易位孔;這在細(xì)菌胞質(zhì)和宿主細(xì)胞胞質(zhì)之間建立了一個(gè)管道,從而實(shí)現(xiàn)效應(yīng)蛋白的直接傳遞。針頭的長(zhǎng)度由SctP蛋白控制,SctU和SctW調(diào)節(jié)分泌層次,這是蛋白質(zhì)底物分泌的時(shí)間順序[38-41]。此外,許多分泌蛋白質(zhì)需要同源伴侶來(lái)分泌[42,43]。一種有功能性的T3SS,包含基底體和針,也被稱為“針復(fù)合體”,相當(dāng)于鞭毛的彎鉤基體復(fù)合物(HBB)。整個(gè)T3SS裝置也被稱為“注射體”(圖1.2)。而效應(yīng)蛋白最終將通過(guò)這個(gè)注射體侵染進(jìn)入植物細(xì)胞,從而擾亂植物的防御系統(tǒng)。圖1.2細(xì)菌三型分泌系統(tǒng)模式圖[44]Figure1.2BacterialtypeIIIsecretionsystemsmodel1.2.3白葉枯病菌的相關(guān)效應(yīng)因子根據(jù)結(jié)構(gòu)和產(chǎn)物的不同,目前細(xì)菌的無(wú)毒基因可以分avrBs3/pthA家族和avrRxv/yopJ家族這兩個(gè)家族,而發(fā)現(xiàn)的大部分的無(wú)毒基因都是屬于avrBs3/pthA家族,因此也把a(bǔ)vrBs3/pthA家族稱為avr/pth家族或avrBs3家族[23]。同時(shí)研究發(fā)現(xiàn)pthA基因家族的結(jié)構(gòu)與avrBs3基因家族的結(jié)構(gòu)存在著很高的相似性,正是由于存在這種相似度,顯示avrBs3/pthA家族成員中無(wú)毒基因和有毒性基因是并存的。
第一章文獻(xiàn)綜述9定位于植物細(xì)胞核[50]。而NLSs對(duì)于AvrBs3同系物的重要性也得到了證實(shí),例如白葉枯病菌中的AvrXa7。事實(shí)上,AD的突變和缺失都會(huì)使蛋白質(zhì)失去活性,并且AD部分地功能可以被單純皰疹病毒VP16的異源AD所取代,這也證明了該結(jié)構(gòu)域的功能重要性(圖1.3)[1,51,52]。圖1.3AvrBs3蛋白組成[1]Figure1.3CompositionofAvrBs3protein2水稻中抗白葉枯病基因2.1已克隆的抗白葉枯病基因據(jù)報(bào)道,目前國(guó)際挖掘鑒定的抗白葉枯病基因有40多個(gè)[53,54]。分析發(fā)現(xiàn)顯性基因?yàn)橹。這些水稻白葉枯抗病基因中,Xa1、Xa3/Xa26、Xa4、xa5、Xa10、xa13、Xa21、Xa23、xa25、Xa27和xa41(t)這11個(gè)基因已成功被克隆,并有相關(guān)報(bào)道[55,56]。這些已克隆的抗性基因中除了Xa1基因編碼的蛋白是NB-LRR類型,其他抗病基因都編碼很多不同類型的蛋白質(zhì),這表明水稻抗白葉枯病基因在功能上是變化多樣的(如表1.1)。表1.1已克隆的11個(gè)水稻白葉枯病抗性基因Table1.1ElevenclonedriceblightresistancegenesGeneCommentsClassCognateElicitor/EffectorReferencesXa21Extracellular,membrane,andintracellulardomains;kinase;broadresistanceRLKAx21[57,58]
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]我國(guó)水稻白葉枯病菌致病型劃分和水稻抗病育種中應(yīng)注意的問(wèn)題[J]. 陳功友,徐正銀,楊陽(yáng)陽(yáng),鄒麗芳,朱勃. 上海交通大學(xué)學(xué)報(bào)(農(nóng)業(yè)科學(xué)版). 2019(01)
[2]近30年國(guó)家和湖南省審定的水稻品種白葉枯病抗性分析[J]. 高杜娟,唐善軍,陳友德,李友榮. 中國(guó)稻米. 2017(01)
[3]水稻抗病功能基因組研究進(jìn)展[J]. 張海濤,王石平. 生命科學(xué). 2016(10)
[4]水稻Xa1基因啟動(dòng)子的克隆及功能分析[J]. 牟少亮,官德義,林琳,賴燕,何水林. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2012(05)
[5]中國(guó)雜交水稻白葉枯病抗性的遺傳改良[J]. 章琦. 中國(guó)水稻科學(xué). 2009(02)
[6]水稻白葉枯病抗性基因鑒定進(jìn)展及其利用[J]. 章琦. 中國(guó)水稻科學(xué). 2005(05)
[7]水稻白葉枯病抗性基因的研究與分子育種[J]. 翟文學(xué),朱立煌. 生物工程進(jìn)展. 1999(06)
本文編號(hào):3022749
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