研究背景胃癌（Gastric cancer）起源于胃黏膜上皮,是世界范圍內(nèi)最常見(jiàn)的惡性腫瘤之一,其死亡率居于惡性腫瘤的第二位,發(fā)病率居于第四位。胃癌包括多種組織學(xué)類型,其中胃腺癌是最常見(jiàn)的組織學(xué)類型。在胃癌高發(fā)的國(guó)家中我國(guó)排在前列,每年新發(fā)的胃癌病例數(shù)量約40萬(wàn)例,死亡病例數(shù)量約35萬(wàn)例,新發(fā)病例和死亡病例數(shù)量均占全世界胃癌總病例數(shù)量的40%左右。早期胃癌的癥狀較少,因此經(jīng)常被診斷為晚期,難以治愈。進(jìn)展期胃癌通常進(jìn)行以外科手術(shù)為主的綜合治療,即便如此,5年生存率仍然低于30%。究其原因,缺少胃癌早期診斷和檢測(cè)的特異性標(biāo)志物是主要原因。轉(zhuǎn)錄組學(xué)這門(mén)學(xué)科是近年來(lái)興起的從整體水平上研究某一時(shí)刻某一細(xì)胞中基因的全部轉(zhuǎn)錄本種類、結(jié)構(gòu)和功能以及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律的學(xué)科,它能快速并且全面地獲取物種在某一狀態(tài)下特定細(xì)胞或組織的表達(dá)情況。對(duì)胃癌進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析可能為其特異標(biāo)志物的篩選以及早期診斷提供新的方向。目的通過(guò)轉(zhuǎn)錄組分析來(lái)發(fā)現(xiàn)與胃腺癌相關(guān)的重要的分子標(biāo)記物,miRNAs和相關(guān)通路。研究方法選取5對(duì)胃腺癌組織和正常組織樣本進(jìn)行測(cè)序,隨后對(duì)測(cè)序獲得的原始數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理,篩選出癌組織與正常組織間的差異表達(dá)基因... 

【文章來(lái)源】：山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】：65 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖２?Ｎｏｒｍａｌｉｚｅ前后表達(dá)值分布箱線圖??

基于方法部分所述的閾值，我們?cè)诎┌Y組得到顯著上調(diào)的基因１４７７個(gè)，顯??著下調(diào)的基因２８２個(gè)。圖２為ＴＭＭ?Ｎｏｒｍａｌｉｚｅ前后的基因表達(dá)分布，可見(jiàn)經(jīng)過(guò)??校正后各個(gè)樣本基因表達(dá)值基本相當(dāng)，具有可比性。圖３為差異基因火山圖和聚??類熱圖，聚類結(jié)果說(shuō)明，、異基因可以將不同組的樣本很好地區(qū)分幵。??Ａ．?Ｕｎｎｏｒｍａｌｉｚｅｄ?ｄａｔａ?Ｂ．Ｎｏｒｍａｌｉｚｅｄ?ｄａｔａ??：：ｊｉ）ｉｉｍｌｉｇ｜??」ｌ?５?－?■日白ｇ＿?Ｉ?５?－日＿￥＿０■自白白＿??０?—?？?？?Ｉ?ｊ?Ｊ?？?Ｉ?｜?？?！??＿５?＿?ｓ?ｉ?ｉ?ｉ?ｓ?ｓ?ｉ１?ｓ?ｓ?＿５?ｊ?丄?“?“?§?丄“??ＯＯＯＯＯＯＯＯＯＯ?ｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏ??￣Ｉ￣Ｉ￣Ｉ￣Ｉ￣Ｉ￣Ｉ￣Ｉ￣Ｉ￣Ｉ￣Ｉ￣?￣Ｉ￣Ｉ￣Ｉ￣Ｉ￣Ｉ￣Ｉ￣Ｉ￣Ｉ￣Ｉ￣Ｉ￣??（Ｕ?〇（Ｄ〇Ｃ〇〇〇｝〇（Ｄ〇?〇３?ｏａｊｏ＾ｏａｊｏａｊｏ??圖２?Ｎｏｒｍａｌｉｚｅ前后表達(dá)值分布箱線圖??１９??

圖４?ＧＯ－ＢＰ和ＫＥＧＧ通路富集結(jié)果；橫坐標(biāo)為所富集的基因個(gè)數(shù)，顏色代表??富集顯著性ｐ值??

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
[1]Hsa-miR-506-3p靶向ERK-2/ETS-1抑制胃癌血管新生及侵襲轉(zhuǎn)移的功能及機(jī)制研究[D]. 李真.南方醫(yī)科大學(xué) 2016
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碩士論文
[1]長(zhǎng)鏈非編碼RNA MEG3在胃癌中的表達(dá)及其影響細(xì)胞周期的作用機(jī)制研究[D]. 楊曉敏.山東大學(xué) 2016
[2]TET1表觀修飾BCL6B調(diào)控胃癌進(jìn)展的機(jī)制[D]. 馬飛.福建醫(yī)科大學(xué) 2016
[3]miR-506抑制胃癌轉(zhuǎn)移的機(jī)制研究[D]. 王瑩.昆明醫(yī)科大學(xué) 2013
[4]microRNA-9通過(guò)靶定NF-κB1調(diào)節(jié)胃腺癌細(xì)胞增殖[D]. 郭利敏.天津醫(yī)科大學(xué) 2009
[5]microRNA-27a通過(guò)靶定prohibitin調(diào)節(jié)胃腺癌細(xì)胞增殖[D]. 劉濤.天津醫(yī)科大學(xué) 2008



本文編號(hào)：3014937