脂蛋白脂酶（lipoprotein lipase,LPL）具有調(diào)控動物機體脂肪沉積的功能,但在小型地方豬種中LPL基因分子遺傳機制研究鮮有報道。為探究LPL基因調(diào)控功能,揭示其對從江香豬（Sus scrofa）肉質(zhì)性狀的影響,本研究以從江香豬為實驗動物,利用RT-PCR技術(shù)克隆從江香豬LPL基因CDS區(qū)（Gen Bank No.1994531）,生物信息學(xué)軟件預(yù)測蛋白理化性質(zhì)及結(jié)構(gòu)特征,通過限制性片段長度多態(tài)性聚合酶鏈反應(yīng)（polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP）技術(shù)對從江香豬LPL基因第5內(nèi)含子AfaⅠ位點進行遺傳效應(yīng)分析,運用q RT-PCR技術(shù)分析不同月齡階段從江香豬背最長肌組織中LPL mRNA表達發(fā)育規(guī)律,并研究其與肌內(nèi)脂肪（intramuscular fat,IMF）含量相關(guān)性。結(jié)果表明,從江香豬LPL基因CDS區(qū)全序列長1 437 bp,共編碼478個氨基酸,構(gòu)成具有PLAT/LH2結(jié)構(gòu)域的穩(wěn)定親水性蛋白。不同品種豬間氨基酸序列的同源性很高,其中從江香豬與挪威長... 

【文章來源】：農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2017,25(04)北大核心

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

Smartv6.0程序?qū)慕阖iLPL蛋白結(jié)構(gòu)域分析

699.299.699.899.899.6298.799.299.499.499.6398.798.998.998.7499.499.499.2599.699.4699.47表2不同品種豬種間LPL蛋白氨基酸同源相似度(%)分析Table2AminoacidhomologyanalysisofLPLproteinfordifferentswinebreeds1：從江香豬；2：杜洛克；3：貴州白香豬；4：大白豬；5：陸川豬；6：挪威長白豬；7：清平豬1:Congjiangxiang;2:DurocAY559454.1;3:Guizhoubaixi-angHQ699490.1;4:LargewhiteAY686761.1;5:Luchuan;6:NorwegianLandraceX62984.1;7:QingpingAY559452.1圖3不同品種豬LPL氨基酸系統(tǒng)進化樹Figure3TheaminoacidphylogenetictreeofLPLofdifferentswinebreeds從江香豬LPL基因克壟多態(tài)及時序表達圖譜構(gòu)建Cloning,PolymorphismsandTissueExpressionProfileofLPLGeneinCongjiangPigs(Susscrofa)603

臣〕?度)存在極顯著相關(guān)，已將其作為調(diào)控豬胴體性能的重要候選位點(Leietal.,2004)。為探究LPL基因內(nèi)含子5中AfaⅠ位點是否可作為肉質(zhì)性狀的分子遺傳標記來利用，本實驗通過對從江香豬AfaⅠ位點遺傳效應(yīng)分析發(fā)現(xiàn)，該群體中G等位基因頻率為0.6495，高于C等位基因頻率，該結(jié)果與王剛等(2007)報道國內(nèi)脂肪型萊蕪豬LPL基因內(nèi)含子5中AfaⅠ位點A型等位基因頻率較高，而國外瘦肉型大白豬B型等位基因頻率較高相一致。關(guān)聯(lián)性分析顯示，從江香豬群體中CC基因型皮厚顯著高于CG型，且CC型個體間背膘厚、眼肌面積和肌內(nèi)脂圖4LPL基因PCR產(chǎn)物電泳(A)和內(nèi)含子5擴增產(chǎn)物AfaⅠ酶切結(jié)果(B)Figure4ImageofPCRproductsofLPLgene(A)andbandpatternsofintron5ofLPLgenedigestedwithAfaⅠ(B)M：DL2000DNA分子量標準；2：CC型；3、4和6：CG型；1和5：GG型M:DL2000DNAmarker;2:CC;3,4and6:CG;1and5:GGM12345620001000750500250100bp336bpbpM123456bp20001000750500250100336232104AB圖5PCR產(chǎn)物測序驗證結(jié)果Figure5ThesequencingoftheverificationresultsofPCRproductsGTACTGAGTACTGAGTAGTGACCCGGG基因型GenotypeCCCGGG皮厚(ST)/mmSkinthickness4.60±0.37a3.74±0.69b4.11±0.59ab背膘厚(BFT)/mmBackfatthickness24.34±5.1521.99±5.3122.49±5.52眼肌面積(LMA)/cm2Lioneyearea17.67±1.4217.29±3.7616.43±2.45眼肌深度(LMD)/mmLioneyedepth36.35±2.4237.07±5.0236.97±4.54肌內(nèi)脂肪(IMF)/%Intramuscularfat3.27±0.923.18±1.032.97±0.77表4AfaⅠ位點與肉質(zhì)指標關(guān)聯(lián)性分析Table4AssociationbetweendifferentgenotypeandmeatqualitytraitsofAfaⅠl

【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3008856