粘蟲對氯蟲苯甲酰胺抗性相關(guān)細(xì)胞色素P450的鑒定
發(fā)布時間:2021-01-27 11:44
粘蟲Mythimna separata(Walker)是一種遷飛性、多食性、暴發(fā)性的世界性害蟲,其已對多種殺蟲劑產(chǎn)生了抗性。本文以玉米粘蟲為研究對象,經(jīng)過氯蟲苯甲酰胺或氟蟲腈處理粘蟲3齡幼蟲24 h后,構(gòu)建轉(zhuǎn)錄組測序文庫并進(jìn)行Illumina RNA-seq測序,運用實時熒光定量PCR(qPCR)篩選出不同條件下最佳的內(nèi)參基因及差異性表達(dá)的P450基因,并通過RNA干擾(RNAi)技術(shù)確定對殺蟲劑具有解毒代謝功能的主效P450基因。具體研究結(jié)果如下:1.采用葉片浸漬法測定氯蟲苯甲酰胺或氟蟲腈對粘蟲的毒力。結(jié)果表明氯蟲苯甲酰胺或氟蟲腈對粘蟲3齡幼蟲致死中濃度LC50分別為0.45和18.72 mg/L,對粘蟲3齡幼蟲的10%致死濃度LC10分別為0.15和13.66 mg/L。2.分別用氯蟲苯甲酰胺(LC10)或氟蟲腈(LC10)處理粘蟲3齡幼蟲24 h后,通過構(gòu)建轉(zhuǎn)錄組測序文庫并進(jìn)行Illumina RNA-seq測序。結(jié)果表明,氯蟲苯甲酰胺處理粘蟲后,共有29個P450基因表達(dá)量上調(diào),27個P45...
【文章來源】:河南科技學(xué)院河南省
【文章頁數(shù)】:64 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
Unigenes長度分布柱狀圖
第三章粘蟲轉(zhuǎn)錄組測序及P450基因篩選15Unigenes,總長度為97934563bp,最小長度為201bp,最大長度為30776bp,平均長度為806bp,拼接所得轉(zhuǎn)錄本長度分布如圖3-1,圖3-2。圖3-1Unigenes長度分布柱狀圖Fig3-1Unigeneslengthbar圖3-2Unigenes長度頻率分布圖Fig3-2ThegraphofUnigeneslengthfrenquency將粘蟲轉(zhuǎn)錄組拼接得到的Unigenes通過蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫NR與家蠶(Bombyxmori)、小家鼠(Musmusculus)、黑脈金斑蝶(Danausplexippus)、棉鈴蟲(Helicoverpaarmigera)和小菜蛾(Plutellaxylostella)進(jìn)行比對,Unigenes的同源相似比例分別為43.3%、15.9%、2.3%和15.1%(圖3-3)。
粘蟲對氯蟲苯甲酰胺抗性相關(guān)細(xì)胞色素P450的鑒定16圖3-3Unigene的同源基因百分比Fig3-3ThepercentageofhomologousgenesofUnigene將粘蟲得到的Unigenes與NR、NT、PFAM、KOG、Swiss-Prot、KO和GO七大數(shù)據(jù)庫分別進(jìn)行蛋白序列、核酸序列、蛋白結(jié)構(gòu)域、直系同源關(guān)系、表達(dá)產(chǎn)物代謝途徑及功能注釋,注釋所占比例分別為43.01%、21.76%、33.55%、17.91%、30.49%、18.47%和33.87%(圖3-4)。圖3-4Unigenes的七大數(shù)據(jù)庫注釋比例Fig3-4TheratesofUnigenesannotationwithsevendatabases將被七大數(shù)據(jù)庫注釋后的Unigenes進(jìn)行基因差異表達(dá)分析,其中橫坐標(biāo)是指基因在不同實驗組中/不同樣品中表達(dá)倍數(shù)變化,縱坐標(biāo)指基因表達(dá)量變化的顯著程度,qvalue
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]西花薊馬不同RNA干擾技術(shù)比較研究[J]. 李恒,周知恩,陳勇,陸承聰,張祥琴,王諒,陳藝欣,田厚軍,林碩,張潔,游泳,魏輝. 福建農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2019(10)
[2]劍麻內(nèi)參基因篩選與穩(wěn)定表達(dá)分析[J]. 張燕梅,王瑞芳,楊子平,鹿志偉,李俊峰,趙艷龍,陸軍迎,周文釗. 熱帶作物學(xué)報. 2019(11)
[3]基于RNA干擾的臺灣乳白蟻纖維素酶活抑制效果分析[J]. 候亞會,畢可可,孫龍華,谷岱霏,李志強(qiáng). 環(huán)境昆蟲學(xué)報. 2019(04)
[4]美國白蛾幾丁質(zhì)酶細(xì)菌表達(dá)的RNA干擾載體構(gòu)建及其介導(dǎo)的RNA干擾[J]. 王越,張?zhí)K芳,徐瑤,方加興,孔祥波,劉福,張真. 林業(yè)科學(xué)研究. 2019(02)
[5]灰飛虱對殺蟲劑的抗性分子機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 徐鹿,趙鈞,趙春青,徐德進(jìn),徐廣春,許小龍,張亞楠,張月亮,韓召軍,顧中言. 農(nóng)藥學(xué)學(xué)報. 2018(02)
[6]桉樹焦枯病菌內(nèi)參基因的篩選[J]. 陳慧潔,馮麗貞,李慧敏,楊澤慧,丁奕,郭朦朦. 森林與環(huán)境學(xué)報. 2018(01)
[7]中國陜晉兩省部分地區(qū)粘蟲田間種群的抗藥性[J]. 趙玉玉,李帥,李怡萍,許向利,成衛(wèi)寧,王熠,仵均祥. 農(nóng)藥學(xué)學(xué)報. 2017(02)
[8]蔬菜蚜蟲抗藥性現(xiàn)狀及抗性治理策略[J]. 湯秋玲,馬康生,高希武. 植物保護(hù). 2016(06)
[9]粘蟲蛾飛行過程中體溫及呼吸強(qiáng)度變化[J]. 江幸福,張蕾,程云霞,羅禮智. 植物保護(hù)學(xué)報. 2015(06)
[10]昆蟲對植物次生物質(zhì)的代謝適應(yīng)機(jī)制及其對昆蟲抗藥性的意義[J]. 陳澄宇,康志嬌,史雪巖,高希武. 昆蟲學(xué)報. 2015(10)
博士論文
[1]CYP6BG1和UGT33AA4介導(dǎo)的小菜蛾對氯蟲苯甲酰胺抗性的分子機(jī)制[D]. 李秀霞.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
碩士論文
[1]利用轉(zhuǎn)基因RNAi技術(shù)沉默稻縱卷葉螟膜結(jié)合型海藻糖酶基因[D]. 王爽.貴州大學(xué) 2017
[2]斯氏艾美耳球蟲TaqMan實時熒光定量PCR檢測方法的建立[D]. 樊翀宇.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]西花薊馬的實時熒光定量PCR檢測方法的建立及花薊馬線粒體全基因組序列的測定與分析[D]. 湯云霞.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[4]家蠶常用內(nèi)參基因的穩(wěn)定性分析及兩種實時熒光定量PCR方法比較[D]. 彭然.蘇州大學(xué) 2012
[5]家蠶和二化螟兩個乙酰膽堿酯酶的RNA干擾及功能分析[D]. 楊麗雯.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
本文編號:3002992
【文章來源】:河南科技學(xué)院河南省
【文章頁數(shù)】:64 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
Unigenes長度分布柱狀圖
第三章粘蟲轉(zhuǎn)錄組測序及P450基因篩選15Unigenes,總長度為97934563bp,最小長度為201bp,最大長度為30776bp,平均長度為806bp,拼接所得轉(zhuǎn)錄本長度分布如圖3-1,圖3-2。圖3-1Unigenes長度分布柱狀圖Fig3-1Unigeneslengthbar圖3-2Unigenes長度頻率分布圖Fig3-2ThegraphofUnigeneslengthfrenquency將粘蟲轉(zhuǎn)錄組拼接得到的Unigenes通過蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫NR與家蠶(Bombyxmori)、小家鼠(Musmusculus)、黑脈金斑蝶(Danausplexippus)、棉鈴蟲(Helicoverpaarmigera)和小菜蛾(Plutellaxylostella)進(jìn)行比對,Unigenes的同源相似比例分別為43.3%、15.9%、2.3%和15.1%(圖3-3)。
粘蟲對氯蟲苯甲酰胺抗性相關(guān)細(xì)胞色素P450的鑒定16圖3-3Unigene的同源基因百分比Fig3-3ThepercentageofhomologousgenesofUnigene將粘蟲得到的Unigenes與NR、NT、PFAM、KOG、Swiss-Prot、KO和GO七大數(shù)據(jù)庫分別進(jìn)行蛋白序列、核酸序列、蛋白結(jié)構(gòu)域、直系同源關(guān)系、表達(dá)產(chǎn)物代謝途徑及功能注釋,注釋所占比例分別為43.01%、21.76%、33.55%、17.91%、30.49%、18.47%和33.87%(圖3-4)。圖3-4Unigenes的七大數(shù)據(jù)庫注釋比例Fig3-4TheratesofUnigenesannotationwithsevendatabases將被七大數(shù)據(jù)庫注釋后的Unigenes進(jìn)行基因差異表達(dá)分析,其中橫坐標(biāo)是指基因在不同實驗組中/不同樣品中表達(dá)倍數(shù)變化,縱坐標(biāo)指基因表達(dá)量變化的顯著程度,qvalue
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]西花薊馬不同RNA干擾技術(shù)比較研究[J]. 李恒,周知恩,陳勇,陸承聰,張祥琴,王諒,陳藝欣,田厚軍,林碩,張潔,游泳,魏輝. 福建農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2019(10)
[2]劍麻內(nèi)參基因篩選與穩(wěn)定表達(dá)分析[J]. 張燕梅,王瑞芳,楊子平,鹿志偉,李俊峰,趙艷龍,陸軍迎,周文釗. 熱帶作物學(xué)報. 2019(11)
[3]基于RNA干擾的臺灣乳白蟻纖維素酶活抑制效果分析[J]. 候亞會,畢可可,孫龍華,谷岱霏,李志強(qiáng). 環(huán)境昆蟲學(xué)報. 2019(04)
[4]美國白蛾幾丁質(zhì)酶細(xì)菌表達(dá)的RNA干擾載體構(gòu)建及其介導(dǎo)的RNA干擾[J]. 王越,張?zhí)K芳,徐瑤,方加興,孔祥波,劉福,張真. 林業(yè)科學(xué)研究. 2019(02)
[5]灰飛虱對殺蟲劑的抗性分子機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 徐鹿,趙鈞,趙春青,徐德進(jìn),徐廣春,許小龍,張亞楠,張月亮,韓召軍,顧中言. 農(nóng)藥學(xué)學(xué)報. 2018(02)
[6]桉樹焦枯病菌內(nèi)參基因的篩選[J]. 陳慧潔,馮麗貞,李慧敏,楊澤慧,丁奕,郭朦朦. 森林與環(huán)境學(xué)報. 2018(01)
[7]中國陜晉兩省部分地區(qū)粘蟲田間種群的抗藥性[J]. 趙玉玉,李帥,李怡萍,許向利,成衛(wèi)寧,王熠,仵均祥. 農(nóng)藥學(xué)學(xué)報. 2017(02)
[8]蔬菜蚜蟲抗藥性現(xiàn)狀及抗性治理策略[J]. 湯秋玲,馬康生,高希武. 植物保護(hù). 2016(06)
[9]粘蟲蛾飛行過程中體溫及呼吸強(qiáng)度變化[J]. 江幸福,張蕾,程云霞,羅禮智. 植物保護(hù)學(xué)報. 2015(06)
[10]昆蟲對植物次生物質(zhì)的代謝適應(yīng)機(jī)制及其對昆蟲抗藥性的意義[J]. 陳澄宇,康志嬌,史雪巖,高希武. 昆蟲學(xué)報. 2015(10)
博士論文
[1]CYP6BG1和UGT33AA4介導(dǎo)的小菜蛾對氯蟲苯甲酰胺抗性的分子機(jī)制[D]. 李秀霞.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
碩士論文
[1]利用轉(zhuǎn)基因RNAi技術(shù)沉默稻縱卷葉螟膜結(jié)合型海藻糖酶基因[D]. 王爽.貴州大學(xué) 2017
[2]斯氏艾美耳球蟲TaqMan實時熒光定量PCR檢測方法的建立[D]. 樊翀宇.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]西花薊馬的實時熒光定量PCR檢測方法的建立及花薊馬線粒體全基因組序列的測定與分析[D]. 湯云霞.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[4]家蠶常用內(nèi)參基因的穩(wěn)定性分析及兩種實時熒光定量PCR方法比較[D]. 彭然.蘇州大學(xué) 2012
[5]家蠶和二化螟兩個乙酰膽堿酯酶的RNA干擾及功能分析[D]. 楊麗雯.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
本文編號:3002992
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