粘蟲(chóng)對(duì)氯蟲(chóng)苯甲酰胺抗性相關(guān)細(xì)胞色素P450的鑒定
發(fā)布時(shí)間:2021-01-27 11:44
粘蟲(chóng)Mythimna separata(Walker)是一種遷飛性、多食性、暴發(fā)性的世界性害蟲(chóng),其已對(duì)多種殺蟲(chóng)劑產(chǎn)生了抗性。本文以玉米粘蟲(chóng)為研究對(duì)象,經(jīng)過(guò)氯蟲(chóng)苯甲酰胺或氟蟲(chóng)腈處理粘蟲(chóng)3齡幼蟲(chóng)24 h后,構(gòu)建轉(zhuǎn)錄組測(cè)序文庫(kù)并進(jìn)行Illumina RNA-seq測(cè)序,運(yùn)用實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qPCR)篩選出不同條件下最佳的內(nèi)參基因及差異性表達(dá)的P450基因,并通過(guò)RNA干擾(RNAi)技術(shù)確定對(duì)殺蟲(chóng)劑具有解毒代謝功能的主效P450基因。具體研究結(jié)果如下:1.采用葉片浸漬法測(cè)定氯蟲(chóng)苯甲酰胺或氟蟲(chóng)腈對(duì)粘蟲(chóng)的毒力。結(jié)果表明氯蟲(chóng)苯甲酰胺或氟蟲(chóng)腈對(duì)粘蟲(chóng)3齡幼蟲(chóng)致死中濃度LC50分別為0.45和18.72 mg/L,對(duì)粘蟲(chóng)3齡幼蟲(chóng)的10%致死濃度LC10分別為0.15和13.66 mg/L。2.分別用氯蟲(chóng)苯甲酰胺(LC10)或氟蟲(chóng)腈(LC10)處理粘蟲(chóng)3齡幼蟲(chóng)24 h后,通過(guò)構(gòu)建轉(zhuǎn)錄組測(cè)序文庫(kù)并進(jìn)行Illumina RNA-seq測(cè)序。結(jié)果表明,氯蟲(chóng)苯甲酰胺處理粘蟲(chóng)后,共有29個(gè)P450基因表達(dá)量上調(diào),27個(gè)P45...
【文章來(lái)源】:河南科技學(xué)院河南省
【文章頁(yè)數(shù)】:64 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
Unigenes長(zhǎng)度分布柱狀圖
第三章粘蟲(chóng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及P450基因篩選15Unigenes,總長(zhǎng)度為97934563bp,最小長(zhǎng)度為201bp,最大長(zhǎng)度為30776bp,平均長(zhǎng)度為806bp,拼接所得轉(zhuǎn)錄本長(zhǎng)度分布如圖3-1,圖3-2。圖3-1Unigenes長(zhǎng)度分布柱狀圖Fig3-1Unigeneslengthbar圖3-2Unigenes長(zhǎng)度頻率分布圖Fig3-2ThegraphofUnigeneslengthfrenquency將粘蟲(chóng)轉(zhuǎn)錄組拼接得到的Unigenes通過(guò)蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)NR與家蠶(Bombyxmori)、小家鼠(Musmusculus)、黑脈金斑蝶(Danausplexippus)、棉鈴蟲(chóng)(Helicoverpaarmigera)和小菜蛾(Plutellaxylostella)進(jìn)行比對(duì),Unigenes的同源相似比例分別為43.3%、15.9%、2.3%和15.1%(圖3-3)。
粘蟲(chóng)對(duì)氯蟲(chóng)苯甲酰胺抗性相關(guān)細(xì)胞色素P450的鑒定16圖3-3Unigene的同源基因百分比Fig3-3ThepercentageofhomologousgenesofUnigene將粘蟲(chóng)得到的Unigenes與NR、NT、PFAM、KOG、Swiss-Prot、KO和GO七大數(shù)據(jù)庫(kù)分別進(jìn)行蛋白序列、核酸序列、蛋白結(jié)構(gòu)域、直系同源關(guān)系、表達(dá)產(chǎn)物代謝途徑及功能注釋,注釋所占比例分別為43.01%、21.76%、33.55%、17.91%、30.49%、18.47%和33.87%(圖3-4)。圖3-4Unigenes的七大數(shù)據(jù)庫(kù)注釋比例Fig3-4TheratesofUnigenesannotationwithsevendatabases將被七大數(shù)據(jù)庫(kù)注釋后的Unigenes進(jìn)行基因差異表達(dá)分析,其中橫坐標(biāo)是指基因在不同實(shí)驗(yàn)組中/不同樣品中表達(dá)倍數(shù)變化,縱坐標(biāo)指基因表達(dá)量變化的顯著程度,qvalue
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]西花薊馬不同RNA干擾技術(shù)比較研究[J]. 李恒,周知恩,陳勇,陸承聰,張祥琴,王諒,陳藝欣,田厚軍,林碩,張潔,游泳,魏輝. 福建農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2019(10)
[2]劍麻內(nèi)參基因篩選與穩(wěn)定表達(dá)分析[J]. 張燕梅,王瑞芳,楊子平,鹿志偉,李俊峰,趙艷龍,陸軍迎,周文釗. 熱帶作物學(xué)報(bào). 2019(11)
[3]基于RNA干擾的臺(tái)灣乳白蟻纖維素酶活抑制效果分析[J]. 候亞會(huì),畢可可,孫龍華,谷岱霏,李志強(qiáng). 環(huán)境昆蟲(chóng)學(xué)報(bào). 2019(04)
[4]美國(guó)白蛾幾丁質(zhì)酶細(xì)菌表達(dá)的RNA干擾載體構(gòu)建及其介導(dǎo)的RNA干擾[J]. 王越,張?zhí)K芳,徐瑤,方加興,孔祥波,劉福,張真. 林業(yè)科學(xué)研究. 2019(02)
[5]灰飛虱對(duì)殺蟲(chóng)劑的抗性分子機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 徐鹿,趙鈞,趙春青,徐德進(jìn),徐廣春,許小龍,張亞楠,張?jiān)铝?韓召軍,顧中言. 農(nóng)藥學(xué)學(xué)報(bào). 2018(02)
[6]桉樹(shù)焦枯病菌內(nèi)參基因的篩選[J]. 陳慧潔,馮麗貞,李慧敏,楊澤慧,丁奕,郭朦朦. 森林與環(huán)境學(xué)報(bào). 2018(01)
[7]中國(guó)陜晉兩省部分地區(qū)粘蟲(chóng)田間種群的抗藥性[J]. 趙玉玉,李帥,李怡萍,許向利,成衛(wèi)寧,王熠,仵均祥. 農(nóng)藥學(xué)學(xué)報(bào). 2017(02)
[8]蔬菜蚜蟲(chóng)抗藥性現(xiàn)狀及抗性治理策略[J]. 湯秋玲,馬康生,高希武. 植物保護(hù). 2016(06)
[9]粘蟲(chóng)蛾飛行過(guò)程中體溫及呼吸強(qiáng)度變化[J]. 江幸福,張蕾,程云霞,羅禮智. 植物保護(hù)學(xué)報(bào). 2015(06)
[10]昆蟲(chóng)對(duì)植物次生物質(zhì)的代謝適應(yīng)機(jī)制及其對(duì)昆蟲(chóng)抗藥性的意義[J]. 陳澄宇,康志嬌,史雪巖,高希武. 昆蟲(chóng)學(xué)報(bào). 2015(10)
博士論文
[1]CYP6BG1和UGT33AA4介導(dǎo)的小菜蛾對(duì)氯蟲(chóng)苯甲酰胺抗性的分子機(jī)制[D]. 李秀霞.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
碩士論文
[1]利用轉(zhuǎn)基因RNAi技術(shù)沉默稻縱卷葉螟膜結(jié)合型海藻糖酶基因[D]. 王爽.貴州大學(xué) 2017
[2]斯氏艾美耳球蟲(chóng)TaqMan實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立[D]. 樊翀宇.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]西花薊馬的實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立及花薊馬線粒體全基因組序列的測(cè)定與分析[D]. 湯云霞.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[4]家蠶常用內(nèi)參基因的穩(wěn)定性分析及兩種實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法比較[D]. 彭然.蘇州大學(xué) 2012
[5]家蠶和二化螟兩個(gè)乙酰膽堿酯酶的RNA干擾及功能分析[D]. 楊麗雯.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
本文編號(hào):3002992
【文章來(lái)源】:河南科技學(xué)院河南省
【文章頁(yè)數(shù)】:64 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
Unigenes長(zhǎng)度分布柱狀圖
第三章粘蟲(chóng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及P450基因篩選15Unigenes,總長(zhǎng)度為97934563bp,最小長(zhǎng)度為201bp,最大長(zhǎng)度為30776bp,平均長(zhǎng)度為806bp,拼接所得轉(zhuǎn)錄本長(zhǎng)度分布如圖3-1,圖3-2。圖3-1Unigenes長(zhǎng)度分布柱狀圖Fig3-1Unigeneslengthbar圖3-2Unigenes長(zhǎng)度頻率分布圖Fig3-2ThegraphofUnigeneslengthfrenquency將粘蟲(chóng)轉(zhuǎn)錄組拼接得到的Unigenes通過(guò)蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)NR與家蠶(Bombyxmori)、小家鼠(Musmusculus)、黑脈金斑蝶(Danausplexippus)、棉鈴蟲(chóng)(Helicoverpaarmigera)和小菜蛾(Plutellaxylostella)進(jìn)行比對(duì),Unigenes的同源相似比例分別為43.3%、15.9%、2.3%和15.1%(圖3-3)。
粘蟲(chóng)對(duì)氯蟲(chóng)苯甲酰胺抗性相關(guān)細(xì)胞色素P450的鑒定16圖3-3Unigene的同源基因百分比Fig3-3ThepercentageofhomologousgenesofUnigene將粘蟲(chóng)得到的Unigenes與NR、NT、PFAM、KOG、Swiss-Prot、KO和GO七大數(shù)據(jù)庫(kù)分別進(jìn)行蛋白序列、核酸序列、蛋白結(jié)構(gòu)域、直系同源關(guān)系、表達(dá)產(chǎn)物代謝途徑及功能注釋,注釋所占比例分別為43.01%、21.76%、33.55%、17.91%、30.49%、18.47%和33.87%(圖3-4)。圖3-4Unigenes的七大數(shù)據(jù)庫(kù)注釋比例Fig3-4TheratesofUnigenesannotationwithsevendatabases將被七大數(shù)據(jù)庫(kù)注釋后的Unigenes進(jìn)行基因差異表達(dá)分析,其中橫坐標(biāo)是指基因在不同實(shí)驗(yàn)組中/不同樣品中表達(dá)倍數(shù)變化,縱坐標(biāo)指基因表達(dá)量變化的顯著程度,qvalue
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]西花薊馬不同RNA干擾技術(shù)比較研究[J]. 李恒,周知恩,陳勇,陸承聰,張祥琴,王諒,陳藝欣,田厚軍,林碩,張潔,游泳,魏輝. 福建農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2019(10)
[2]劍麻內(nèi)參基因篩選與穩(wěn)定表達(dá)分析[J]. 張燕梅,王瑞芳,楊子平,鹿志偉,李俊峰,趙艷龍,陸軍迎,周文釗. 熱帶作物學(xué)報(bào). 2019(11)
[3]基于RNA干擾的臺(tái)灣乳白蟻纖維素酶活抑制效果分析[J]. 候亞會(huì),畢可可,孫龍華,谷岱霏,李志強(qiáng). 環(huán)境昆蟲(chóng)學(xué)報(bào). 2019(04)
[4]美國(guó)白蛾幾丁質(zhì)酶細(xì)菌表達(dá)的RNA干擾載體構(gòu)建及其介導(dǎo)的RNA干擾[J]. 王越,張?zhí)K芳,徐瑤,方加興,孔祥波,劉福,張真. 林業(yè)科學(xué)研究. 2019(02)
[5]灰飛虱對(duì)殺蟲(chóng)劑的抗性分子機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 徐鹿,趙鈞,趙春青,徐德進(jìn),徐廣春,許小龍,張亞楠,張?jiān)铝?韓召軍,顧中言. 農(nóng)藥學(xué)學(xué)報(bào). 2018(02)
[6]桉樹(shù)焦枯病菌內(nèi)參基因的篩選[J]. 陳慧潔,馮麗貞,李慧敏,楊澤慧,丁奕,郭朦朦. 森林與環(huán)境學(xué)報(bào). 2018(01)
[7]中國(guó)陜晉兩省部分地區(qū)粘蟲(chóng)田間種群的抗藥性[J]. 趙玉玉,李帥,李怡萍,許向利,成衛(wèi)寧,王熠,仵均祥. 農(nóng)藥學(xué)學(xué)報(bào). 2017(02)
[8]蔬菜蚜蟲(chóng)抗藥性現(xiàn)狀及抗性治理策略[J]. 湯秋玲,馬康生,高希武. 植物保護(hù). 2016(06)
[9]粘蟲(chóng)蛾飛行過(guò)程中體溫及呼吸強(qiáng)度變化[J]. 江幸福,張蕾,程云霞,羅禮智. 植物保護(hù)學(xué)報(bào). 2015(06)
[10]昆蟲(chóng)對(duì)植物次生物質(zhì)的代謝適應(yīng)機(jī)制及其對(duì)昆蟲(chóng)抗藥性的意義[J]. 陳澄宇,康志嬌,史雪巖,高希武. 昆蟲(chóng)學(xué)報(bào). 2015(10)
博士論文
[1]CYP6BG1和UGT33AA4介導(dǎo)的小菜蛾對(duì)氯蟲(chóng)苯甲酰胺抗性的分子機(jī)制[D]. 李秀霞.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
碩士論文
[1]利用轉(zhuǎn)基因RNAi技術(shù)沉默稻縱卷葉螟膜結(jié)合型海藻糖酶基因[D]. 王爽.貴州大學(xué) 2017
[2]斯氏艾美耳球蟲(chóng)TaqMan實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立[D]. 樊翀宇.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]西花薊馬的實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立及花薊馬線粒體全基因組序列的測(cè)定與分析[D]. 湯云霞.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[4]家蠶常用內(nèi)參基因的穩(wěn)定性分析及兩種實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法比較[D]. 彭然.蘇州大學(xué) 2012
[5]家蠶和二化螟兩個(gè)乙酰膽堿酯酶的RNA干擾及功能分析[D]. 楊麗雯.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
本文編號(hào):3002992
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