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西瓜噬酸菌bamC、bamE和hrcS基因功能分析

發(fā)布時(shí)間:2021-01-25 11:39
  瓜類細(xì)菌性果斑病(bacterial fruit blotch,BFB)是一種給葫蘆科作物造成全球范圍種植產(chǎn)業(yè)嚴(yán)重經(jīng)濟(jì)損失的重要種傳病害,其病原菌為西瓜噬酸菌(Acidovorax citrulli)。該病害由于缺乏抗性品種,防治手段仍舊是較為傳統(tǒng)的植保措施,為了更好的開發(fā)非抗生素類的靶向藥劑,研究西瓜噬酸菌致病機(jī)理勢在必行。Ⅲ型分泌系統(tǒng)(type secretion systemⅢ,T3SS)參與西瓜噬酸菌致病性的調(diào)控,基因hrcS是T3SS中hrp-hrc-hpa基因簇中的重要組成,與T3SS中重要的調(diào)控基因相調(diào)控。bam基因簇編碼的Bam復(fù)合體(β-barrel assembly machinery)為西瓜噬酸菌的脂多糖運(yùn)輸系統(tǒng)中的重要組成,它的缺失直接影響病原菌細(xì)胞外膜的合成。本試驗(yàn)以西瓜噬酸菌Ⅱ型菌株Aac-5為研究對(duì)象,探究基因hrcS、bamC、bamE在西瓜噬酸菌中的生物學(xué)功能,分析基因的功能:(1)西瓜噬酸菌中基因hrcS、bamC、bamE的相關(guān)生物學(xué)信息基因hrcS在T3SS注射裝置中進(jìn)行信息處理及信號(hào)傳導(dǎo),產(chǎn)物蛋白具有兩個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域;bamC為Bam復(fù)合體的外膜... 

【文章來源】:吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)吉林省

【文章頁數(shù)】:72 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

西瓜噬酸菌bamC、bamE和hrcS基因功能分析


瓜類細(xì)菌性果斑病侵染循環(huán)示意圖[20]

示意圖,示意圖,西瓜,蛋白


ipopolysaccharide,LPS)在野油菜黃單胞菌中也是致病因子[77],這些致病相關(guān)系統(tǒng)在西瓜噬酸菌中尚未得到充分研究。1.3Ⅲ型分泌系統(tǒng)Ⅲ型分泌系統(tǒng)對(duì)西瓜噬酸菌的致病性有著重要的影響,病原菌與寄主接觸時(shí)T3SS臨時(shí)啟動(dòng),T3SS缺失或不能正常表達(dá)時(shí)西瓜噬酸菌不具有致病性。T3SS由20多個(gè)亞單元組成,是西瓜噬酸菌中最復(fù)雜的分泌系統(tǒng)。T3SS是一個(gè)“注射針”狀結(jié)構(gòu),可以幫助細(xì)菌定植在宿主細(xì)胞胞膜上并運(yùn)送毒性蛋白直接進(jìn)入宿主細(xì)胞,導(dǎo)致致病菌對(duì)宿主進(jìn)行黏附并侵入,實(shí)現(xiàn)對(duì)寄主的侵染致病[45]。其結(jié)構(gòu)模擬如圖1.2所示。圖1.2T3SS結(jié)構(gòu)示意圖Fig.1.2SketchmapofT3SSapparatusT3SS的運(yùn)作的過程為尖端接觸寄主時(shí)將運(yùn)輸信號(hào)至內(nèi)部分泌裝置激活,激活后基座進(jìn)行裝配,然后桿部和針狀結(jié)構(gòu)組裝,最后完成效應(yīng)蛋白的分泌及運(yùn)輸。T3SS組分蛋白質(zhì)有四類:(1)轉(zhuǎn)位效應(yīng)子蛋白(translocatedeffectorproteins);(2)裝置蛋白(apparatusproteins);(3)分子伴侶蛋白(chaperonesproteins);(4)調(diào)節(jié)蛋白(regulationprotein)[46]。在革蘭氏陰性菌中,不同菌株T3SS裝置略有不同[47]:如鼠傷寒沙門氏菌(Salmonellatyphimurium)、志賀氏菌(Shigella)中具有兩套T3SS[48,49],但基本結(jié)構(gòu)大致相似,具有基座、針狀結(jié)構(gòu)和外置組分[50]。在革蘭氏陰性菌中,針對(duì)T3SS致病機(jī)理篩選藥用抑制劑已經(jīng)在合成類化合物和天然產(chǎn)物方面得到了較好的開發(fā)[51]。合成類化合物有亞水楊基酰腈類(alicylideneacylhydrazides)[52]、對(duì)羥基肉桂酸[53]等,其中亞水楊基酰肼類衍生物INP0007影響Yop

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吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文第一章引言5毒性蛋白的轉(zhuǎn)運(yùn),從而影響耶爾森菌(Yersinia)對(duì)HeLa細(xì)胞的侵染,并且不會(huì)影響宿主細(xì)胞的生長[54],十分適合做抑制劑;天然產(chǎn)物有nocazineD可以有效抑制毒性蛋白Sip分泌,且該抑制劑具有專一性,在抑制毒性蛋白分泌時(shí)不干擾鞭毛蛋白的分泌[55]。西瓜噬酸菌中已有的針對(duì)T3SS抑制劑為丙二腈肟醚類化合物[54]。但目前對(duì)于西瓜噬酸菌中T3SS的各基因功能尚未研究透徹,基因間的調(diào)控關(guān)系尚未得到清晰的研究,相應(yīng)的抑制劑也尚未得到充分開發(fā),因此對(duì)西瓜噬酸菌T3SS的研究仍是十分必要的。1.3.1hrc基因簇hrc基因(hypersensitiveresponse&pathogenicityconserved)為hrp基因(hypersensitiveresponse&pathogenicity)簇中高度保守的一類,且hrc基因編碼的Hrc蛋白與耶爾森菌的毒性蛋白Yop(Yersiniaouterprotein)具有同源性,在大多數(shù)革蘭氏陰性菌中都具有Hrc的同源蛋白,一般為9個(gè)[106],共同編碼T3SS核心組成部分[56]。每個(gè)hrc基因編碼的蛋白功能各不相同,有具有ATP結(jié)合基序的ATP酶[57]、橫跨內(nèi)外膜的脂蛋白[58]、構(gòu)成分泌通道的蛋白[59]等。hrp基因編碼組裝Ⅲ型分泌系統(tǒng),多數(shù)成簇存在并且彼此之間有調(diào)節(jié)關(guān)系,也有一些分散在染色體上[60],如野油菜黃單胞菌中的hrpG、hrpX。hrp基因簇根據(jù)基因結(jié)構(gòu)、序列分析和調(diào)控的不同,在植物病原菌中可以分為兩類:第一類包括丁香假單胞菌(Pseudomonas.syringae)和歐文氏菌屬(Erwiniaspp.),第二類包括黃單胞菌屬(Xanthomonasspp.)和青枯雷爾氏菌(Ralstoniasolanacearum)。西瓜噬酸菌中的hrp基因簇屬于第二類[61](圖1.3)。圖1.3hrp基因簇Ⅰ型與Ⅱ型結(jié)構(gòu)對(duì)比Fig.1.3ContradistinctionoftypeⅠwithⅡhrpgeneclusterstructure

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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博士論文
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[2]西瓜食酸菌(Acidovorax citrulli)Ⅲ型分泌系統(tǒng)抑制劑的高通量篩選[D]. 陳亮.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
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碩士論文
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[4]西瓜噬酸菌致病相關(guān)基因pyrG與hpaP的功能分析[D]. 高杜娟.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[5]瓜類細(xì)菌性果斑病菌hrp基因簇部分基因的克隆及功能研究[D]. 汪新.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[6]野油菜黃單胞菌hrp基因簇的功能鑒定和表達(dá)調(diào)控分析[D]. 姜伯樂.廣西大學(xué) 2004



本文編號(hào):2999155

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