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兩類合成基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的動(dòng)力學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2021-01-23 22:19
  本文研究了兩類合成基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的動(dòng)力學(xué)行為:一類以由壓制振動(dòng)子和基于延遲的松弛振子整合而成的組合振子為核心元件,分析了振子之間參數(shù)的失諧對(duì)于系統(tǒng)群體動(dòng)力學(xué)的影響;另一類以壓制振動(dòng)子為核心元件,考察了細(xì)胞內(nèi)外信號(hào)整合(即組合調(diào)控)對(duì)系統(tǒng)群體行為的影響.主要取得了如下成果:(1)研究了參數(shù)失諧對(duì)多細(xì)胞通訊系統(tǒng)的多穩(wěn)性和多節(jié)律性的效果.其中,單個(gè)系統(tǒng)是組合振子,振子之間通過(guò)群體感應(yīng)機(jī)制相互耦合.以最大轉(zhuǎn)錄率為分叉參數(shù),通過(guò)分岔分析和數(shù)值模擬,發(fā)現(xiàn):當(dāng)系統(tǒng)由同質(zhì)振子組成到失諧,并且失諧程度逐漸增加時(shí),系統(tǒng)的穩(wěn)定穩(wěn)態(tài)解和穩(wěn)定周期解的特征發(fā)生了顯著的變化:同質(zhì)平衡態(tài)被新的異質(zhì)平衡態(tài)所取代,兩個(gè)異質(zhì)平衡態(tài)共存形成雙穩(wěn),同相周期1振動(dòng)變成擬同相周期1或不對(duì)稱周期1振動(dòng);穩(wěn)定周期2解的左右兩分支存在區(qū)間縮小,乃至右邊完全消失;失諧增大到一定程度時(shí),出現(xiàn)穩(wěn)定的周期4解,穩(wěn)定穩(wěn)態(tài)解和穩(wěn)定周期解的共存方式也發(fā)生了變化.我們的結(jié)果為理解多細(xì)胞系統(tǒng)的群體行為奠定了基礎(chǔ).(2)研究了細(xì)胞內(nèi)外信號(hào)整合對(duì)多細(xì)胞通訊系統(tǒng)群體行為的影響.壓制振動(dòng)子之間通過(guò)群體感應(yīng)機(jī)制耦合.以順式調(diào)控輸入函數(shù)中的參數(shù)v為分叉參數(shù),通過(guò)數(shù)值模... 

【文章來(lái)源】:江西師范大學(xué)江西省

【文章頁(yè)數(shù)】:46 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

兩類合成基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的動(dòng)力學(xué)分析


圖2.1:組合振子的示意圖??

周期,同相,反相,振子


?期的相位振動(dòng),是對(duì)稱的反相周期2振動(dòng),這是一種反相同步的現(xiàn)象.但是在分??支三上,振動(dòng)都是松弛型振動(dòng)(見圖2.3右邊(a)和(b)),在分支四上,當(dāng)aiW逐漸增大??時(shí),振動(dòng)由松弛振動(dòng)變成較光滑的振動(dòng)(見圖2.3右邊(c)和(d)).??<ilAAAAAAAAAA>a;?^MWVVVVV;??1.6?1?1?'?'?1?1?^?'?1?'?'????1950?1960?1970?1980?1990?2000?1950?1960?1970?1980?1990?2000??1??1?1?1?1?1?1?'?'?'?1?1?1??1950?1960?1970?1980?1990?2000?1950?1960?1970?1980?1990?2000??'X/WWVN!’?25^/WWW^/)??1950?1960?1970?1980?1990?2000?1950?1960?1970?1980?1990?2000??25kAAAAAAA;??2.3?'?1?'?1?'?2?'?'?1?1?'?1??1950?1960?1970?1980?1990?2000?1950?1960?1970?1980?1990?2000??t?t??圖2.3:當(dāng)rf12?=?l,?變化時(shí),兩個(gè)耦合的組合振子展示的同相周期1振動(dòng)和反相周期2振??動(dòng).左圖是同相周期1振動(dòng):(a)?o^1)?=?2.35;?(b)?cePW;?(c)?(d)?右圖是反相??周期2振動(dòng):(a)?(b)?(c)?(^)=16.3;?(d)??接下來(lái)我們展示參數(shù)失諧

局部放大圖,分叉圖,局部放大,異質(zhì)


?1930?1940?^1950?1960?1970?1980?1990?2000??圖2.5:當(dāng)心2?=0.97,?變化時(shí),兩個(gè)耦合的組合振子展示的穩(wěn)定周期1振動(dòng)和穩(wěn)定周期2振??動(dòng)和0^=3的周期1振動(dòng);(cHejo^Mi?時(shí)的周期2振動(dòng);??(〇〇^(1)=18.2的周期1振動(dòng).??最后,我們說(shuō)明參數(shù)失諧對(duì)于動(dòng)力學(xué)狀態(tài)共存的影響.通過(guò)分叉分析和數(shù)??值模擬,我們發(fā)現(xiàn):參數(shù)失諧也使得動(dòng)力學(xué)共存的情況發(fā)生了變化.在這里,我??們主要是關(guān)注穩(wěn)定平衡態(tài)(同質(zhì)或異質(zhì))與穩(wěn)定周期解之間的共存.從圖2.2(a)可??見,不存在參數(shù)失諧時(shí),周期解和平衡態(tài)可以呈現(xiàn)以下幾種共存狀態(tài):穩(wěn)定周??期2解可與穩(wěn)定的異質(zhì)平衡態(tài)共存(共存于7/?2與8?1之間),或與穩(wěn)定的同質(zhì)平衡??態(tài)和異質(zhì)平衡態(tài)共存(共存于BP,與/>£>2之間),穩(wěn)定周期1解可與同質(zhì)和異質(zhì)平衡??態(tài)同時(shí)共存.參數(shù)存在較小的失諧時(shí),穩(wěn)定周期2解可以和異質(zhì)平衡態(tài)完全共??存;穩(wěn)定周期1解可以和兩個(gè)異質(zhì)平衡態(tài)共存,但是其共存的

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]XPPAUT在系統(tǒng)生物學(xué)中的應(yīng)用[J]. 孔維旺,易奇志.  計(jì)算機(jī)與應(yīng)用化學(xué). 2015(08)
[2]系統(tǒng)規(guī)模對(duì)群體行為的效果[J]. 易奇志,杜焰,周天壽.  物理學(xué)報(bào). 2013(11)
[3]三類基因振子和它們的基本動(dòng)力學(xué)[J]. 周天壽,胡長(zhǎng)春.  江西師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2008(01)
[4]基于Matlab的非線性動(dòng)力學(xué)系統(tǒng)分析[J]. 孟艷麗,王素秋,韓晶.  物理實(shí)驗(yàn). 2005(08)

碩士論文
[1]多振子協(xié)調(diào)同步及其應(yīng)用研究[D]. 李琰琰.河南理工大學(xué) 2012



本文編號(hào):2996022

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