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腸癌基質(zhì)浸潤(rùn)強(qiáng)度評(píng)分的建立、評(píng)估及基于CRISPR文庫(kù)的化療耐藥基因篩選及增敏策略探討

發(fā)布時(shí)間:2021-01-23 23:55
  微環(huán)境是腫瘤組織的重要組成部分。越來(lái)越多的證據(jù)已經(jīng)表明微環(huán)境細(xì)胞浸潤(rùn)模式與患者的預(yù)后及臨床治療獲益息息相關(guān)。在腸癌中,目前研究較成熟的微環(huán)境評(píng)價(jià)方式為Galon J提出的基于免疫組化染色的免疫評(píng)分模型。然而,這一評(píng)價(jià)方法僅觀察了 CD3與CD8兩個(gè)分子的表達(dá),缺乏對(duì)腫瘤微環(huán)境中基質(zhì)細(xì)胞浸潤(rùn)強(qiáng)度的評(píng)價(jià)。我們前期研究已發(fā)現(xiàn),基質(zhì)細(xì)胞的浸潤(rùn)影響腸癌患者的預(yù)后及化療獲益。因此,本研究的目的是:(1)構(gòu)建可用于評(píng)估腸癌患者微環(huán)境基質(zhì)浸潤(rùn)強(qiáng)度的新型評(píng)分模型;(2)探討新型評(píng)分模型在預(yù)測(cè)預(yù)后以及治療獲益中的作用;(3)基于CRISPR文庫(kù)篩選探索聯(lián)系基質(zhì)浸潤(rùn)與化療耐藥的分子機(jī)制。取得的主要結(jié)果如下:1.建立新型腸癌患者腫瘤微環(huán)境全景分型。基于GEO數(shù)據(jù)庫(kù)腸癌芯片的基因表達(dá)譜解析微環(huán)境浸潤(rùn)數(shù)據(jù),運(yùn)用無(wú)監(jiān)督層次聚類分析發(fā)現(xiàn)腸癌患者存在三種微環(huán)境分型(TMECS1,TMECS2,TMECS3)。不同分型間患者的復(fù)發(fā)與死亡風(fēng)險(xiǎn)存在顯著差異。此外,三種分型中僅有TMECS3患者可從輔助化療中顯著獲益。2.基質(zhì)浸潤(rùn)強(qiáng)度評(píng)分(SIIS)模型可預(yù)測(cè)非轉(zhuǎn)移型腸癌患者預(yù)后及化療獲益。以新型微環(huán)境分型為目標(biāo)特征,運(yùn)用自抽... 

【文章來(lái)源】:南方醫(yī)科大學(xué)廣東省

【文章頁(yè)數(shù)】:150 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:博士

【部分圖文】:

腸癌基質(zhì)浸潤(rùn)強(qiáng)度評(píng)分的建立、評(píng)估及基于CRISPR文庫(kù)的化療耐藥基因篩選及增敏策略探討


圖1-1腸癌患者微環(huán)境分型

分型,腸癌,患者,微環(huán)境


及野生型BRAF患者顯著增多。桑吉圖結(jié)果顯示,??TMECS1型患者主要集中在C4、C6及CMS4三種表征間質(zhì)表型的分子亞型上,??而TMECS2型患者主要分布在C2、CMSl、CMS2?種表征免疫浸潤(rùn)表沏及上??皮表型的業(yè)型。TMECS3則明顯富集于C5、CMS2與CMS3。??A?B??m?TMECS1?m?TMECS2?m?TMECS3??(%)??flllHIi?:?:i?I??1?:|l?B?881!?^?f?%-:;??MMR?CIMP?CIN?BRAF??圖1-2腸癌患者微環(huán)境分型與分子特征的相關(guān)性。(A)堆積柱狀圖展示TMECS分型在不??N分f特征患f!?的分布情況;(B?)!╅w展承不N?TMECS分型患者在其他分子分型的分??布情況。??Fig.?1-2?The?correlation?between?tumor?microenvironment?cell?subtyping?and?molecular??characteristic.?(A)?Bar?charts?summarizing?TMECS?proportions?within?and?across?molecular??characteristic?subgroups;?(B)?Sankey?chart?displaying?the?distribution?of?the?TMECS?in?C1-C6??subtypes?and?CMS?subtypes.?TMECS.?tumor?microenvironment?cell?subtype;MMR.?mismatch?repair;??CIMP,?CpG?island?methyl

微環(huán)境,腸癌,分型,患者


圖1-3腸癌微環(huán)境分型與患者生存、化療獲益的相關(guān)性分析


本文編號(hào):2996161

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