目的從五味子中克隆木脂素生物合成途徑松脂醇-落葉松脂素還原酶（Pinoresinol-lariciresinol reductases,PLR）基因及其啟動子序列,并進行生物信息學與表達分析。方法根據(jù)轉錄組PLR測序序列設計特異性引物,克隆ScPLR并進行生物信息學分析;采用TAIL-PCR對Sc PLR啟動子序列擴增,并進行序列分析;采用實時熒光定量PCR（q RT-PCR）分析果實不同發(fā)育時期ScPLR的表達。結果 Sc PLR基因開放閱讀框（ORF）全長837bp,編碼278個氨基酸;ScPLR蛋白相對分子質量31419.85,理論等電點8.97;具有跨膜結構,無信號肽,為穩(wěn)定性疏水蛋白,主要由α-螺旋和無規(guī)卷曲構成;亞細胞定位預測Sc PLR主要定位于細胞質;系統(tǒng)進化顯示Sc PLR與蓖麻PLR親緣關系較近�？寺〉絊c PLR基因啟動子長994bp,具有TATA-box、CAAT-box基本元件、光調控、生長素響應、厭氧誘導、防御和應激反應的多種調控元件;qRT-PCR結果顯示ScPLR表達量呈現(xiàn)果實膨大期快速增加而進入著色期迅速降低的變化趨勢。結論獲得了Sc PLR基因及其啟... 

【文章來源】：中草藥. 2020,51(18)北大核心

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

五味子ScPLR核苷酸序列及其氨基酸序列

圖1 五味子ScPLR核苷酸序列及其氨基酸序列利用SOMPA預測ScPLR蛋白質二級結構（圖3），其中α-螺旋所占比例最大，為38.85%，無規(guī)則卷曲為34.89%，延伸鏈為18.35%，β-轉角為7.91%，由此可見，ScPLR為混合型蛋白，α-螺旋和無規(guī)卷曲是其主要的結構元件。運用Phyre2數(shù)據(jù)庫預測分析ScPLR蛋白質三級結構，運用Rasmol軟件分析Sc PLR基因編碼的蛋白質產(chǎn)物三級結構，跨膜螺旋預測顯示蛋白有跨膜結構，這與跨膜結構分析結果相一致，序列相似度為56%，三級結構預測結果與二級結構相符（圖4）。

利用SOMPA預測ScPLR蛋白質二級結構（圖3），其中α-螺旋所占比例最大，為38.85%，無規(guī)則卷曲為34.89%，延伸鏈為18.35%，β-轉角為7.91%，由此可見，ScPLR為混合型蛋白，α-螺旋和無規(guī)卷曲是其主要的結構元件。運用Phyre2數(shù)據(jù)庫預測分析ScPLR蛋白質三級結構，運用Rasmol軟件分析Sc PLR基因編碼的蛋白質產(chǎn)物三級結構，跨膜螺旋預測顯示蛋白有跨膜結構，這與跨膜結構分析結果相一致，序列相似度為56%，三級結構預測結果與二級結構相符（圖4）。圖4 五味子ScPLR基因編碼蛋白質產(chǎn)物的三級結構


本文編號：2992089