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柑橘大實(shí)蠅NPC2基因的序列分析和組織表達(dá)模式

發(fā)布時(shí)間:2021-01-21 23:22
  柑橘大實(shí)蠅是柑橘上的重要害蟲,主要為害柑橘果實(shí)。NPC2是一種小分子蛋白,參與了脊椎動物的脂質(zhì)代謝,最近有研究表明,NPC2有著類似于昆蟲氣味結(jié)合蛋白的功能,參與了昆蟲的化學(xué)通訊。為了明確NPC2基因在柑橘大實(shí)蠅成蟲組織中的分布,本研究從柑橘大實(shí)蠅轉(zhuǎn)錄組中,鑒定了NPC2基因,命名為BminNPC2。通過生物信息學(xué)方法分析了該基因序列特征并構(gòu)建了系統(tǒng)進(jìn)化樹,采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)研究了BminNPC2基因在柑橘大實(shí)蠅成蟲組織中的表達(dá)模式。結(jié)果表明:BminNPC2基因開放閱讀框?yàn)?56 bp,編碼151個(gè)氨基酸,等電點(diǎn)為6.10,分子量大小為16.66 kD,含有6個(gè)半胱氨酸。BminNPC2基因在柑橘大實(shí)蠅頭部(去掉觸角)和腹部表達(dá)量最高。據(jù)此結(jié)果我們在文中對BminNPC2基因功能進(jìn)行了簡要討論。 

【文章來源】:植物保護(hù). 2020,46(04)北大核心

【文章頁數(shù)】:5 頁

【部分圖文】:

柑橘大實(shí)蠅NPC2基因的序列分析和組織表達(dá)模式


柑橘大實(shí)蠅NPC2的核苷酸序列及推導(dǎo)的氨基酸序列

氨基酸序列,氨基酸序列,昆蟲,柑橘


BminNPC2與其他昆蟲NPC2s的氨基酸序列比對

氨基酸序列,柑橘,昆蟲,氨基酸序列


利用BLAST對BminNPC2的同源蛋白進(jìn)行搜索,搜索結(jié)果進(jìn)行氨基酸序列的多重比對(圖2),同時(shí)構(gòu)建了NPC2s系統(tǒng)進(jìn)化樹(圖3),結(jié)果表明,柑橘大實(shí)蠅NPC2蛋白氨基酸與黑腹果蠅Drosophila melanogaster NPC-2a蛋白氨基酸序列一致性最高(71.97%),與其他的NPC2蛋白氨基酸序列一致性為(22%~57%)。2.3 BminNPC2 組織表達(dá)模式


本文編號:2992076

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