柑橘大實蠅NPC2基因的序列分析和組織表達模式
發(fā)布時間:2021-01-21 23:22
柑橘大實蠅是柑橘上的重要害蟲,主要為害柑橘果實。NPC2是一種小分子蛋白,參與了脊椎動物的脂質代謝,最近有研究表明,NPC2有著類似于昆蟲氣味結合蛋白的功能,參與了昆蟲的化學通訊。為了明確NPC2基因在柑橘大實蠅成蟲組織中的分布,本研究從柑橘大實蠅轉錄組中,鑒定了NPC2基因,命名為BminNPC2。通過生物信息學方法分析了該基因序列特征并構建了系統(tǒng)進化樹,采用實時熒光定量PCR技術研究了BminNPC2基因在柑橘大實蠅成蟲組織中的表達模式。結果表明:BminNPC2基因開放閱讀框為456 bp,編碼151個氨基酸,等電點為6.10,分子量大小為16.66 kD,含有6個半胱氨酸。BminNPC2基因在柑橘大實蠅頭部(去掉觸角)和腹部表達量最高。據(jù)此結果我們在文中對BminNPC2基因功能進行了簡要討論。
【文章來源】:植物保護. 2020,46(04)北大核心
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
柑橘大實蠅NPC2的核苷酸序列及推導的氨基酸序列
BminNPC2與其他昆蟲NPC2s的氨基酸序列比對
利用BLAST對BminNPC2的同源蛋白進行搜索,搜索結果進行氨基酸序列的多重比對(圖2),同時構建了NPC2s系統(tǒng)進化樹(圖3),結果表明,柑橘大實蠅NPC2蛋白氨基酸與黑腹果蠅Drosophila melanogaster NPC-2a蛋白氨基酸序列一致性最高(71.97%),與其他的NPC2蛋白氨基酸序列一致性為(22%~57%)。2.3 BminNPC2 組織表達模式
本文編號:2992076
【文章來源】:植物保護. 2020,46(04)北大核心
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
柑橘大實蠅NPC2的核苷酸序列及推導的氨基酸序列
BminNPC2與其他昆蟲NPC2s的氨基酸序列比對
利用BLAST對BminNPC2的同源蛋白進行搜索,搜索結果進行氨基酸序列的多重比對(圖2),同時構建了NPC2s系統(tǒng)進化樹(圖3),結果表明,柑橘大實蠅NPC2蛋白氨基酸與黑腹果蠅Drosophila melanogaster NPC-2a蛋白氨基酸序列一致性最高(71.97%),與其他的NPC2蛋白氨基酸序列一致性為(22%~57%)。2.3 BminNPC2 組織表達模式
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