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miRNA-210-3p在大腸癌細胞遷移侵襲中的促進作用及其靶基因的生物信息學分析

發(fā)布時間:2021-01-10 22:41
  目的探討miR-210-3p在大腸癌細胞遷移、侵襲中的作用,并利用生物信息學方法預測其靶基因及信號通路。方法采用dbDEMC和OncomiR數(shù)據(jù)庫分析miR-210-3p在大腸癌中的表達情況,通過熒光定量PCR法驗證miR-210-3p在大腸癌細胞系中的表達;通過轉染miRNA模擬物、抑制劑上調(diào)和下調(diào)大腸癌細胞內(nèi)miR-210-3p的表達量,Transwell法檢測轉染后大腸癌細胞的遷移和侵襲能力變化;通過miRDB、TargetScan7.2、starBase和miRPathDB數(shù)據(jù)庫預測miR-210-3p靶基因,利用DAVID數(shù)據(jù)庫進行GO分析及信號通路的富集分析,利用GEPIA數(shù)據(jù)庫分析關鍵基因在大腸癌組織中的表達。結果dbDEMC和OncomiR數(shù)據(jù)庫顯示miR-210-3p在大腸癌組織中高表達,并與腫瘤轉移和患者預后相關。熒光定量PCR驗證miR-210-3p在高轉移性結腸癌細胞系HCT-116、LoVo中的表達量高于中轉移性細胞系SW480和低轉移性細胞系CL187、HCT-8。過表達miR-210-3p能明顯增強SW480細胞遷移和侵襲能力;下調(diào)miR-210-3p的表... 

【文章來源】:醫(yī)學研究雜志. 2020,49(09)

【文章頁數(shù)】:6 頁

【文章目錄】:
材料與方法
    1.細胞系及主要試劑:
    2.細胞培養(yǎng)及轉染:
    3.miRNA的提取及實時熒光定量PCR實驗:
    4.Transwell遷移、侵襲實驗:
    5.生物信息學分析:
    6. 統(tǒng)計學方法:
結 果
    1.miR-210-3p在大腸癌組織和癌細胞中的表達:
    2.miR-210-3p模擬物、抑制劑轉染對大腸癌細胞遷移、侵襲能力的影響:
    3.miR-210-3p靶基因的預測和分析:
    4.關鍵靶基因驗證:
討 論



本文編號:2969550

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