廣東省屠宰場(chǎng)豬群PRRSV感染狀況調(diào)查及基因測(cè)序分析
發(fā)布時(shí)間:2021-01-07 03:32
為了解廣東省育肥豬群豬繁殖與呼吸綜合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)攜帶情況,2019年在廣東省43個(gè)生豬屠宰場(chǎng),采集臨床健康生豬淋巴結(jié)樣品840份,運(yùn)用商品化熒光定量RT-PCR試劑盒進(jìn)行PRRSV核酸檢測(cè)。設(shè)計(jì)PRRSV ORF5基因引物,選取部分陽性樣品進(jìn)行RT-PCR,測(cè)序后進(jìn)行基因序列分析。結(jié)果顯示:840份樣品的PRRSV陽性率為17.02%,其中美洲型為14.29%,歐洲型為2.73%;成功獲得15份樣品的ORF5基因序列,其中12株為美洲型,3株為歐洲型;美洲型毒株中包含:JXA1-like毒株5株,GM2-like毒株3株,NADC30-like和VR2332毒株各2株;美洲型毒株基因相似度為87.5%~99.6%,歐洲型為90.2%~90.4%。對(duì)美洲型毒株的ORF5基因編碼的氨基酸進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)檢測(cè)到的不同亞群毒株各個(gè)功能區(qū)存在廣泛的、顯著的變異。結(jié)果表明,廣東省屠宰場(chǎng)豬群的PRRSV隱性帶毒率較高,且毒株復(fù)雜多樣,以美洲型毒株為主,且已存在歐洲型毒株。建議落實(shí)并強(qiáng)化規(guī)模化...
【文章來源】:中國(guó)動(dòng)物檢疫. 2020,37(09)
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
PRRSV ORF5基因遺傳進(jìn)化分析結(jié)果
以VR2332為標(biāo)準(zhǔn)毒株,對(duì)檢測(cè)到的12株美洲型PRRSV的GP5蛋白信號(hào)肽、誘導(dǎo)表位、第一高變區(qū)、中和表位、第二高變區(qū)、跨膜區(qū)及細(xì)胞表位進(jìn)行氨基酸位點(diǎn)變異分析。由圖3可以看出,大部分檢測(cè)毒株信號(hào)肽區(qū)發(fā)生第3位(由E突變?yōu)镚)、第11位(由Y突變?yōu)镃)、第16位(由S突變?yōu)镕)等氨基酸位點(diǎn)變異;誘導(dǎo)表位中,有3株毒株發(fā)生1個(gè)氨基酸位點(diǎn)變異,1株發(fā)生2個(gè)氨基酸位點(diǎn)變異;高變區(qū)中,氨基酸變異位點(diǎn)較多,但也有1株毒株沒有發(fā)生變異;中和表位中,第38位氨基酸有3株毒株由H突變?yōu)閅,第39位有5株毒株由L突變?yōu)镮、2株突變?yōu)镾、1株突變?yōu)門;跨膜區(qū)主要發(fā)生第66位(由S突變?yōu)門/C)、第101位(由F突變?yōu)閅)、第102位(由V突變?yōu)閅/H/R)等氨基酸位點(diǎn)變異;細(xì)胞表位的變異主要有第121、127、161、185、189、200位等氨基酸位點(diǎn)的變異。第13位和151位氨基酸是與毒力相關(guān)的位點(diǎn),其中:第13位點(diǎn)中,有3株為Q,9株由Q突變?yōu)镽;第151位點(diǎn)中,有8株為R,4株由R突變?yōu)镵。圖3 PRRSV GP5氨基酸位點(diǎn)變異分析結(jié)果
PRRSV GP5氨基酸位點(diǎn)變異分析結(jié)果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]高致病性豬繁殖與呼吸綜合征病毒的分離鑒定及其分子流行病學(xué)分析[J]. 童光志,周艷君,郝曉芳,田志軍,仇華吉,彭金美,安同慶. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2007(05)
本文編號(hào):2961821
【文章來源】:中國(guó)動(dòng)物檢疫. 2020,37(09)
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
PRRSV ORF5基因遺傳進(jìn)化分析結(jié)果
以VR2332為標(biāo)準(zhǔn)毒株,對(duì)檢測(cè)到的12株美洲型PRRSV的GP5蛋白信號(hào)肽、誘導(dǎo)表位、第一高變區(qū)、中和表位、第二高變區(qū)、跨膜區(qū)及細(xì)胞表位進(jìn)行氨基酸位點(diǎn)變異分析。由圖3可以看出,大部分檢測(cè)毒株信號(hào)肽區(qū)發(fā)生第3位(由E突變?yōu)镚)、第11位(由Y突變?yōu)镃)、第16位(由S突變?yōu)镕)等氨基酸位點(diǎn)變異;誘導(dǎo)表位中,有3株毒株發(fā)生1個(gè)氨基酸位點(diǎn)變異,1株發(fā)生2個(gè)氨基酸位點(diǎn)變異;高變區(qū)中,氨基酸變異位點(diǎn)較多,但也有1株毒株沒有發(fā)生變異;中和表位中,第38位氨基酸有3株毒株由H突變?yōu)閅,第39位有5株毒株由L突變?yōu)镮、2株突變?yōu)镾、1株突變?yōu)門;跨膜區(qū)主要發(fā)生第66位(由S突變?yōu)門/C)、第101位(由F突變?yōu)閅)、第102位(由V突變?yōu)閅/H/R)等氨基酸位點(diǎn)變異;細(xì)胞表位的變異主要有第121、127、161、185、189、200位等氨基酸位點(diǎn)的變異。第13位和151位氨基酸是與毒力相關(guān)的位點(diǎn),其中:第13位點(diǎn)中,有3株為Q,9株由Q突變?yōu)镽;第151位點(diǎn)中,有8株為R,4株由R突變?yōu)镵。圖3 PRRSV GP5氨基酸位點(diǎn)變異分析結(jié)果
PRRSV GP5氨基酸位點(diǎn)變異分析結(jié)果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]高致病性豬繁殖與呼吸綜合征病毒的分離鑒定及其分子流行病學(xué)分析[J]. 童光志,周艷君,郝曉芳,田志軍,仇華吉,彭金美,安同慶. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2007(05)
本文編號(hào):2961821
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