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鹽土微生物菌群分析及其中新的纖維素酶基因的挖掘

發(fā)布時間:2020-12-15 03:52
  高鹽生態(tài)系統(tǒng)如鹽湖,鹽田,鹽泉等廣泛分布于全球各地。但是,關(guān)于鹽湖等高鹽環(huán)境微生物的研究大部分集中于鹽湖水和湖底的沉積物中,鹽土微生物菌群的分布狀況還不清楚。極端鹽環(huán)境中蘊(yùn)藏有豐富的嗜鹽微生物,這些嗜鹽微生物以及其分泌的各種耐鹽酶類資源具有廣闊的工業(yè)應(yīng)用前景。本研究使用高通量測序技術(shù)對青海察爾汗鹽湖沿岸高鹽土壤中的微生物菌群進(jìn)行了調(diào)查研究。首先,本研究闡明了影響鹽土微生物菌群分布的主要環(huán)境因素:土壤總有機(jī)碳含量是影響表層鹽土(0-10 cm)菌群分布的最主要環(huán)境因素,pH是影響深層鹽土(15-30 cm)菌群分布的最主要因素;同時闡明了鹽度對鹽環(huán)境微生物菌群的影響:相比淺層鹽土,鹽度對深層鹽土菌群分布的影響更大,相比鹽湖水和湖底沉積物,鹽度對鹽土菌群分布的影響要更小一些。接著,本研究優(yōu)化了鹽土DNA提取流程并分析了不同土壤DNA提取方法引起的16S rRNA基因擴(kuò)增子數(shù)據(jù)的偏差。雖然DNA提取方法會引起微生物多樣性和菌群組成上的一定偏差,一些門或綱的相對豐度甚至有五倍以上的變化,但是土壤類型仍然是決定整個菌群分布的最主要因素。對于使用常規(guī)流程無法得到足量DNA的高鹽土壤,我們推薦增加鹽... 

【文章來源】:天津大學(xué)天津市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:113 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

鹽土微生物菌群分析及其中新的纖維素酶基因的挖掘


嗜鹽微生物在生命的三個域中的分布,標(biāo)紅的分類單元包含了不止一種嗜鹽微生物[21]

酶基因,外切葡聚糖酶,纖維素酶,生物燃料


11圖 1-2 宏基因組的方法在新的酶基因挖掘中的應(yīng)用[64]Figure 1-2 An overview of the metagenomic methods in novel enzyme gene discovery1.4.3 新的纖維素酶基因研究現(xiàn)狀能源短缺已經(jīng)成為了一個全球性的問題 使用能再生的生物能源進(jìn)行生物燃料的生產(chǎn)是一個不可避免的趨勢,纖維素是自然界中存在的最為豐富的可再生資源,其是由 D-吡喃葡萄糖經(jīng) β-1,4-糖苷鍵連接而成,纖維素常被用作生產(chǎn)重要的工業(yè)化學(xué)品,如可溶性糖和生物燃料[75] 具有新的特性的纖維素酶的缺乏已經(jīng)成為了有效利用纖維素資源的瓶頸所在[76] 纖維素酶主要包括內(nèi)切葡聚糖酶,外切葡聚糖酶和 β-葡萄糖苷酶,其中內(nèi)切葡聚糖酶τEC 3.2.1.4υ可將纖維素分解為纖維二糖或者纖維寡糖;外切葡聚糖酶τEC3.2.1.91,EC3.2.1.176υ可從纖維素的還原性末端或者非還原性末端分解糖鏈,釋放出纖維二糖;β-葡萄糖苷酶τEC

樣本采集,鹽土,策略


圖 2-1 鹽土樣本采集策略Figure 2-1 The sampling strategy of saline soil samples化性質(zhì)的測定壤樣本風(fēng)干,經(jīng)2mm的篩子過濾后再進(jìn)行土壤理化水比例 1:2.5 混合后測定;土壤電導(dǎo)率用來表示土壤的:5 混合后測定 將新鮮土壤在 105oC 的烘箱中烘至土含水量的計算 碳含量采用重鉻酸鉀氧化法[83]測定:向 0.1 g 土壤鉀溶液和 5 ml 濃硫酸,搖勻后在 220oC 的電熱板上非羅琳指示劑,溶液中剩余的重鉻酸鉀用硫酸亞鐵標(biāo)色由橙黃變?yōu)榫G色再變成棕紅色即為終點(diǎn),經(jīng)計算得理化性質(zhì)測定重復(fù)兩次,最后取平均值 DNA 的提取


本文編號:2917604

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