黎平雜邊禾矮桿小粒突變體dss1基因定位與克隆研究
發(fā)布時(shí)間:2020-12-14 22:54
水稻是世界上主要的糧食作物之一,世界上有超過(guò)50%的人口以大米為主食。株高是水稻重要的農(nóng)藝性狀,與水稻產(chǎn)量和品質(zhì)密切相關(guān)。鑒定、研究和利用更多的株高及粒型性狀突變體資源,分離出更多的相關(guān)功能基因,對(duì)于深入闡明水稻生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)制和生產(chǎn)實(shí)踐具有重要意義。本課題組前期研究中以甲基磺酸乙酯(Ethylmethane Sulfonate,EMS)處理貴州地方品種黎平雜邊禾,獲得一份穩(wěn)定遺傳的矮稈小粒突變體dss1,本研究在前期對(duì)dss1突變體初定位的基礎(chǔ)上,構(gòu)建基因精細(xì)定位群體,利用MutMap技術(shù)對(duì)其進(jìn)行精細(xì)定位確定候選基因,并通過(guò)構(gòu)建基因超量表達(dá)載體遺傳轉(zhuǎn)化dss1突變體,以確定dss1突變體突變基因及其功能,主要取得了如下研究結(jié)果:1 dss1基因精細(xì)定位及候選基因篩選dss1突變體與野生型相比,主要表現(xiàn)為株型直立、植株矮化、葉色深綠、籽粒變小、第二節(jié)間嚴(yán)重縮短、穗長(zhǎng)增加等典型油菜素內(nèi)酯缺陷型突變體的性狀。利用MutMap技術(shù)將dss1基因進(jìn)行定位于3號(hào)染色體上,并且得到14個(gè)差異顯著的SNP多態(tài)性標(biāo)記位點(diǎn);測(cè)序結(jié)果表明,dss1候選基因?yàn)锽R合成途徑關(guān)鍵酶基因OsDWARF,dss1是由于...
【文章來(lái)源】:貴州大學(xué)貴州省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:78 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
建庫(kù)測(cè)序流程
圖 2.2 dss1 突變體及野生型表型A:植株 B:莖稈 C:籽粒 D:苗 E:穗子Fig.2.2 The phenotype of of dss1 mutant and wild typeA:Plant B:Stalk C:Seed D:Seeding E:Fringe表 2-2 dss1與野生型農(nóng)藝性狀比較Table2-2 The agronomic characters of dss1 mutant and wild typegronomic character) 野生型 (wild type) dss1ant height (cm) 166.46±7.51 93.82±6.83 *Flag leaf length (cm) 28.25±1.83 29.37±2.08Flag leaf width (cm) 1.72±0.45 2.24±0.38*Flag leaf angle(°) 94.10±11.13 10.98±2.27**nicle length (cm) 27.33±1.49 42.27±2.25**hulled seed length (mm) 7.12±0.14 5.89±0.21*hulled seed width (mm) 3.54±0.10 3.14±0.15hulled seed thickness(mm) 2.66±0.08 2.51±0.161000-grain weight (g) 30.90±0.25 20.32±0.10**
圖 2.3 dss1 突變體與野生型節(jié)間長(zhǎng)度 n=20Fig.2.3 The internode lengths of dss1 mutant and wild typeap 技術(shù)的基因定位狀分析發(fā)現(xiàn) dss1 突變體與野生型在表型上有顯基因或多個(gè)基因的突變引起 dss1 突變體與野生是是哪一個(gè)基因又是怎樣進(jìn)行調(diào)控,為了揭示這對(duì)該目標(biāo)基因進(jìn)行定位和克隆研究。質(zhì)量分析代及兩親本 DNA 進(jìn)行測(cè)序,共得到原始數(shù)據(jù) R凈數(shù)據(jù) Clean data 40.922G, 各樣本的原始數(shù)712.943 M 之間, 測(cè)序質(zhì)量高(Q20 ≥ 94.5%、Q55%~47.88%之間(表 2-3)。所有樣本的數(shù)據(jù)量
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]油菜素甾醇類(lèi)激素的生物合成、代謝及信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)[J]. 孫超,黎家. 植物生理學(xué)報(bào). 2017(03)
[2]水稻矮稈多分蘗突變體bf370的遺傳分析和基因定位[J]. 胡運(yùn)高,楊國(guó)濤,郭連安,欽鵬,陳永軍,李仕貴. 中國(guó)水稻科學(xué). 2015(04)
[3]貴州地方稻種來(lái)攏黃葉突變體yl-1光合特性研究[J]. 曾昭松,曾曉芳,趙德剛. 分子植物育種. 2014(05)
[4]水稻株高基因克隆及功能分析的研究進(jìn)展[J]. 張?jiān)戚x,張所兵,林靜,汪迎節(jié),方先文. 中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2014(12)
[5]貴州地方水稻種質(zhì)資源秈-粳遺傳分化的InDel分子標(biāo)記研究[J]. 冼俊龍,曾曉芳,趙德剛. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2013(04)
[6]水稻功能基因組研究進(jìn)展與發(fā)展展望[J]. 肖景華,吳昌銀,張啟發(fā). 中國(guó)農(nóng)業(yè)科技導(dǎo)報(bào). 2013(02)
[7]水稻矮稈突變體dtl1的分離鑒定及其突變基因的精細(xì)定位[J]. 張帆濤,方軍,孫昌輝,李潤(rùn)寶,羅向東,謝建坤,鄧曉建,儲(chǔ)成才. 遺傳. 2012(01)
[8]水稻突變體庫(kù)研究進(jìn)展[J]. 楊松濤,張濤,鄭家奎. 中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2010(19)
[9]一個(gè)水稻小粒突變體基因gw(t)的表型和遺傳分析[J]. 張濤,楊松濤,鄭家奎,蔣開(kāi)鋒,楊莉,楊乾華,萬(wàn)先齊,曹應(yīng)江,游書(shū)梅. 雜交水稻. 2010(S1)
[10]粳稻株高QTL與赤霉素和油菜素內(nèi)酯合成及信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)基因相關(guān)分析[J]. 姜樹(shù)坤,黃成,徐正進(jìn),陳溫福. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(14)
博士論文
[1]水稻突變體oscrd1和ospsf1的基因克隆及功能分析[D]. 王雪霞.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2017
[2]XIAO調(diào)控水稻器官大小的機(jī)理[D]. 江云鶴.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
碩士論文
[1]黎平雜邊禾dss-1突變體光合生理特性及基因定位研究[D]. 陳錫.貴州大學(xué) 2016
[2]水稻葉色突變體的光合和生理生化特性研究[D]. 呂典華.西南大學(xué) 2010
本文編號(hào):2917156
【文章來(lái)源】:貴州大學(xué)貴州省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:78 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
建庫(kù)測(cè)序流程
圖 2.2 dss1 突變體及野生型表型A:植株 B:莖稈 C:籽粒 D:苗 E:穗子Fig.2.2 The phenotype of of dss1 mutant and wild typeA:Plant B:Stalk C:Seed D:Seeding E:Fringe表 2-2 dss1與野生型農(nóng)藝性狀比較Table2-2 The agronomic characters of dss1 mutant and wild typegronomic character) 野生型 (wild type) dss1ant height (cm) 166.46±7.51 93.82±6.83 *Flag leaf length (cm) 28.25±1.83 29.37±2.08Flag leaf width (cm) 1.72±0.45 2.24±0.38*Flag leaf angle(°) 94.10±11.13 10.98±2.27**nicle length (cm) 27.33±1.49 42.27±2.25**hulled seed length (mm) 7.12±0.14 5.89±0.21*hulled seed width (mm) 3.54±0.10 3.14±0.15hulled seed thickness(mm) 2.66±0.08 2.51±0.161000-grain weight (g) 30.90±0.25 20.32±0.10**
圖 2.3 dss1 突變體與野生型節(jié)間長(zhǎng)度 n=20Fig.2.3 The internode lengths of dss1 mutant and wild typeap 技術(shù)的基因定位狀分析發(fā)現(xiàn) dss1 突變體與野生型在表型上有顯基因或多個(gè)基因的突變引起 dss1 突變體與野生是是哪一個(gè)基因又是怎樣進(jìn)行調(diào)控,為了揭示這對(duì)該目標(biāo)基因進(jìn)行定位和克隆研究。質(zhì)量分析代及兩親本 DNA 進(jìn)行測(cè)序,共得到原始數(shù)據(jù) R凈數(shù)據(jù) Clean data 40.922G, 各樣本的原始數(shù)712.943 M 之間, 測(cè)序質(zhì)量高(Q20 ≥ 94.5%、Q55%~47.88%之間(表 2-3)。所有樣本的數(shù)據(jù)量
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[5]貴州地方水稻種質(zhì)資源秈-粳遺傳分化的InDel分子標(biāo)記研究[J]. 冼俊龍,曾曉芳,趙德剛. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2013(04)
[6]水稻功能基因組研究進(jìn)展與發(fā)展展望[J]. 肖景華,吳昌銀,張啟發(fā). 中國(guó)農(nóng)業(yè)科技導(dǎo)報(bào). 2013(02)
[7]水稻矮稈突變體dtl1的分離鑒定及其突變基因的精細(xì)定位[J]. 張帆濤,方軍,孫昌輝,李潤(rùn)寶,羅向東,謝建坤,鄧曉建,儲(chǔ)成才. 遺傳. 2012(01)
[8]水稻突變體庫(kù)研究進(jìn)展[J]. 楊松濤,張濤,鄭家奎. 中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2010(19)
[9]一個(gè)水稻小粒突變體基因gw(t)的表型和遺傳分析[J]. 張濤,楊松濤,鄭家奎,蔣開(kāi)鋒,楊莉,楊乾華,萬(wàn)先齊,曹應(yīng)江,游書(shū)梅. 雜交水稻. 2010(S1)
[10]粳稻株高QTL與赤霉素和油菜素內(nèi)酯合成及信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)基因相關(guān)分析[J]. 姜樹(shù)坤,黃成,徐正進(jìn),陳溫福. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(14)
博士論文
[1]水稻突變體oscrd1和ospsf1的基因克隆及功能分析[D]. 王雪霞.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2017
[2]XIAO調(diào)控水稻器官大小的機(jī)理[D]. 江云鶴.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
碩士論文
[1]黎平雜邊禾dss-1突變體光合生理特性及基因定位研究[D]. 陳錫.貴州大學(xué) 2016
[2]水稻葉色突變體的光合和生理生化特性研究[D]. 呂典華.西南大學(xué) 2010
本文編號(hào):2917156
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