藥西瓜UDP-糖基轉(zhuǎn)移酶基因克隆與原核表達分析
發(fā)布時間:2020-12-10 03:52
葫蘆素是藥西瓜中重要的藥用活性成分,具有抗炎、保肝、抗癌、提高機體免疫力等多種生物活性功能。植物體內(nèi)葫蘆素配糖體與葫蘆素的含量相當(dāng),已有研究表明葫蘆素E配糖體(CuE-Glu)是決定藥西瓜苦味的主要因素。UDP-糖基轉(zhuǎn)移酶是催化葫蘆素形成葫蘆素配糖體的關(guān)鍵酶。本研究以藥西瓜“WM9”品種葉片為材料,成功克隆了兩個UDP-糖基轉(zhuǎn)移酶基因的cDNA序列,并對其進行了原核表達分析。本實驗采用RT-PCR法,成功獲得1,546 bp和1,559 bp的基因全長序列,分別命名為UDP-E1和UDP-E2。對擴增獲得的編碼序列進行生物學(xué)信息分析,確定UDP-E1基因的完整開放閱讀框(ORF)為1314bp,可編碼氨基酸437個,蛋白質(zhì)命名為:UDP-E1,理論分子量為49.02kDa,等電點為5.99,屬于穩(wěn)定蛋白質(zhì)。UDP-E2基因的ORF為846bp,可編碼氨基酸281個,蛋白質(zhì)命名為:UDP-E2,理論分子量為32.78 kDa,等電點為5.23,屬不穩(wěn)定蛋白質(zhì),這兩個基因?qū)儆谔腔D(zhuǎn)移酶超家族。通過分析發(fā)現(xiàn)這兩個基因的氨基酸序列均不具有跨膜結(jié)構(gòu),不具有信號肽結(jié)構(gòu)。蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)表明,蛋白UD...
【文章來源】:延邊大學(xué)吉林省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:63 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
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?SKXXrCTG-CXXCAJ*ak_KKTOCTCGT?TXTTXXTOCXTXC.aCJWXTTtiCTX.CCJCrraJvXTOGiXOGrraCi^T?XAJCTTJ^TGC?X:TXCrr*J4jkC??G?TT?AjOT?JtUTCCC?JkTCCC?AC?CTX?TT?CTTACTii?TC??圖2.3:藥西瓜基因的編碼區(qū)核酸序列及推導(dǎo)氨基酸序列??Fig?2.3?Encoding?nucleic?acid?sequence?and?deduced?amino?acid?sequence?of?Medicine??watermelon?UDP?-?E2?gene??2.?2.4.?2蛋白保守區(qū)預(yù)測結(jié)果??在NCBI網(wǎng)站上利用Conserved?Domain工具中的CD-search進行功能域分??析
延邊大學(xué)碩士畢業(yè)論文??.?2.?4.?3蛋白的親水性預(yù)測結(jié)果??使用ProtScale軟件對蛋白質(zhì)親水性進行分析,結(jié)果顯示蛋白UDP-E1的疏水性為2.067,位于第238位點;最小值是-2.344,位于第74位點,總平水性指數(shù)為-0.009,依據(jù)氨基酸分值越低親水性越強反之亦然的規(guī)律可預(yù)測UDP-E1整體表現(xiàn)為親水性(見圖2.6)?〇??蛋白UDP-E2的最大疏水性為2.156,位于第16位點;最小值是-2.867,第180位點,總平均親水性指數(shù)為-0.280,依據(jù)氨基酸分值越低親水性越強亦然的規(guī)律可預(yù)測蛋白UDP-E2整體表現(xiàn)為親水性(見圖2.7)。??ProtScale?output?for?user_sequence??
【參考文獻】:
期刊論文
[1]發(fā)菜中糖基轉(zhuǎn)移酶基因的克隆及原核表達[J]. 陳雪峰,蔡國強,范華,劉歡. 陜西科技大學(xué)學(xué)報. 2018(01)
[2]葫蘆素B對脂多糖誘導(dǎo)小鼠肺泡巨噬細胞炎癥反應(yīng)的影響[J]. 周康,張永為,陸新建,馬春芳. 預(yù)防醫(yī)學(xué). 2017(07)
[3]煙草糖基轉(zhuǎn)移酶基因NtGT3的克隆與生物信息學(xué)分析[J]. 任學(xué)良,李立芹,許力,郭玉雙,魯黎明. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2017(01)
[4]發(fā)現(xiàn)蔬果的“苦味”秘密[J]. 吳佩. 農(nóng)藥市場信息. 2017(02)
[5]苦蕎糖基轉(zhuǎn)移酶基因的克隆及活性鑒定[J]. 李茂菲,周婧,姚攀鋒,趙學(xué)榮,李成磊,吳琦. 西北植物學(xué)報. 2016(12)
[6]基于ITS2條形碼鑒定維藥藥西瓜及其誤用品[J]. 何江,程波,徐元,姚松伯,楊偉俊. 中國現(xiàn)代中藥. 2016(10)
[7]葫蘆素E抑制多發(fā)性骨髓瘤細胞增殖及與阿霉素的協(xié)同效應(yīng)[J]. 楊瑪麗,肖翠,魏榕,伍忠軍,曹小華,王莎莎,陽泰,李敏惠,劉進. 成都醫(yī)學(xué)院學(xué)報. 2016(02)
[8]葫蘆素E誘導(dǎo)肝癌細胞凋亡及其機制[J]. 沈杭,陳宗科,錢葉本. 臨床與實驗病理學(xué)雜志. 2015(12)
[9]葫蘆素E誘導(dǎo)結(jié)腸癌細胞凋亡[J]. 隨何歡,李麗,王虎,周運江,黃家君. 第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報. 2016(05)
[10]葫蘆素B抑制神經(jīng)母細胞瘤SH-SY5Y細胞增殖機制的初步研究[J]. 鄭倩,宋冠華,張斌. 實用藥物與臨床. 2015(07)
博士論文
[1]葫蘆科蔬菜苦味物質(zhì)的代謝研究[D]. 周淵.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2016
[2]葫蘆素E抑制人白血病和肝癌細胞增殖作用及機制研究[D]. 李艷春.沈陽藥科大學(xué) 2010
[3]葫蘆素B治療喉鱗狀細胞癌的實驗研究[D]. 劉亭彥.中國醫(yī)科大學(xué) 2008
[4]葫蘆素B的保肝作用及其機制的研究[D]. 昌友權(quán).吉林大學(xué) 2006
碩士論文
[1]藥西瓜蔓中葫蘆素B提取及其固體脂質(zhì)納米粒制備與功能特性研究[D]. 劉鈺瑩.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]葫蘆素E通過PI3K/Akt/NF-κB信號通路抑制TNF-α誘導(dǎo)的MH7A細胞炎癥因子的分泌[D]. 賈慶運.山東中醫(yī)藥大學(xué) 2015
[3]葫蘆素E誘導(dǎo)HeLa細胞發(fā)生自噬的分子機制研究[D]. 張曉鈺.暨南大學(xué) 2015
[4]葫蘆素B對食管鱗癌細胞放射敏感性影響的相關(guān)研究[D]. 潘丁龍.福建醫(yī)科大學(xué) 2015
[5]葫蘆素B對于結(jié)腸癌細胞生長與增殖抑制作用的研究[D]. 黃琛.河北醫(yī)科大學(xué) 2015
[6]葫蘆素E對脂多糖誘導(dǎo)的小鼠巨噬細胞RAW264.7炎癥反應(yīng)的抑制作用及其機制研究[D]. 喬靜.暨南大學(xué) 2013
[7]苦瓜提取物及其抗蟲抑菌效果[D]. 羅宏.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
本文編號:2908036
【文章來源】:延邊大學(xué)吉林省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:63 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2.1?pcr擴增udp-糖基轉(zhuǎn)移酶基因??
?SKXXrCTG-CXXCAJ*ak_KKTOCTCGT?TXTTXXTOCXTXC.aCJWXTTtiCTX.CCJCrraJvXTOGiXOGrraCi^T?XAJCTTJ^TGC?X:TXCrr*J4jkC??G?TT?AjOT?JtUTCCC?JkTCCC?AC?CTX?TT?CTTACTii?TC??圖2.3:藥西瓜基因的編碼區(qū)核酸序列及推導(dǎo)氨基酸序列??Fig?2.3?Encoding?nucleic?acid?sequence?and?deduced?amino?acid?sequence?of?Medicine??watermelon?UDP?-?E2?gene??2.?2.4.?2蛋白保守區(qū)預(yù)測結(jié)果??在NCBI網(wǎng)站上利用Conserved?Domain工具中的CD-search進行功能域分??析
延邊大學(xué)碩士畢業(yè)論文??.?2.?4.?3蛋白的親水性預(yù)測結(jié)果??使用ProtScale軟件對蛋白質(zhì)親水性進行分析,結(jié)果顯示蛋白UDP-E1的疏水性為2.067,位于第238位點;最小值是-2.344,位于第74位點,總平水性指數(shù)為-0.009,依據(jù)氨基酸分值越低親水性越強反之亦然的規(guī)律可預(yù)測UDP-E1整體表現(xiàn)為親水性(見圖2.6)?〇??蛋白UDP-E2的最大疏水性為2.156,位于第16位點;最小值是-2.867,第180位點,總平均親水性指數(shù)為-0.280,依據(jù)氨基酸分值越低親水性越強亦然的規(guī)律可預(yù)測蛋白UDP-E2整體表現(xiàn)為親水性(見圖2.7)。??ProtScale?output?for?user_sequence??
【參考文獻】:
期刊論文
[1]發(fā)菜中糖基轉(zhuǎn)移酶基因的克隆及原核表達[J]. 陳雪峰,蔡國強,范華,劉歡. 陜西科技大學(xué)學(xué)報. 2018(01)
[2]葫蘆素B對脂多糖誘導(dǎo)小鼠肺泡巨噬細胞炎癥反應(yīng)的影響[J]. 周康,張永為,陸新建,馬春芳. 預(yù)防醫(yī)學(xué). 2017(07)
[3]煙草糖基轉(zhuǎn)移酶基因NtGT3的克隆與生物信息學(xué)分析[J]. 任學(xué)良,李立芹,許力,郭玉雙,魯黎明. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2017(01)
[4]發(fā)現(xiàn)蔬果的“苦味”秘密[J]. 吳佩. 農(nóng)藥市場信息. 2017(02)
[5]苦蕎糖基轉(zhuǎn)移酶基因的克隆及活性鑒定[J]. 李茂菲,周婧,姚攀鋒,趙學(xué)榮,李成磊,吳琦. 西北植物學(xué)報. 2016(12)
[6]基于ITS2條形碼鑒定維藥藥西瓜及其誤用品[J]. 何江,程波,徐元,姚松伯,楊偉俊. 中國現(xiàn)代中藥. 2016(10)
[7]葫蘆素E抑制多發(fā)性骨髓瘤細胞增殖及與阿霉素的協(xié)同效應(yīng)[J]. 楊瑪麗,肖翠,魏榕,伍忠軍,曹小華,王莎莎,陽泰,李敏惠,劉進. 成都醫(yī)學(xué)院學(xué)報. 2016(02)
[8]葫蘆素E誘導(dǎo)肝癌細胞凋亡及其機制[J]. 沈杭,陳宗科,錢葉本. 臨床與實驗病理學(xué)雜志. 2015(12)
[9]葫蘆素E誘導(dǎo)結(jié)腸癌細胞凋亡[J]. 隨何歡,李麗,王虎,周運江,黃家君. 第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報. 2016(05)
[10]葫蘆素B抑制神經(jīng)母細胞瘤SH-SY5Y細胞增殖機制的初步研究[J]. 鄭倩,宋冠華,張斌. 實用藥物與臨床. 2015(07)
博士論文
[1]葫蘆科蔬菜苦味物質(zhì)的代謝研究[D]. 周淵.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2016
[2]葫蘆素E抑制人白血病和肝癌細胞增殖作用及機制研究[D]. 李艷春.沈陽藥科大學(xué) 2010
[3]葫蘆素B治療喉鱗狀細胞癌的實驗研究[D]. 劉亭彥.中國醫(yī)科大學(xué) 2008
[4]葫蘆素B的保肝作用及其機制的研究[D]. 昌友權(quán).吉林大學(xué) 2006
碩士論文
[1]藥西瓜蔓中葫蘆素B提取及其固體脂質(zhì)納米粒制備與功能特性研究[D]. 劉鈺瑩.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]葫蘆素E通過PI3K/Akt/NF-κB信號通路抑制TNF-α誘導(dǎo)的MH7A細胞炎癥因子的分泌[D]. 賈慶運.山東中醫(yī)藥大學(xué) 2015
[3]葫蘆素E誘導(dǎo)HeLa細胞發(fā)生自噬的分子機制研究[D]. 張曉鈺.暨南大學(xué) 2015
[4]葫蘆素B對食管鱗癌細胞放射敏感性影響的相關(guān)研究[D]. 潘丁龍.福建醫(yī)科大學(xué) 2015
[5]葫蘆素B對于結(jié)腸癌細胞生長與增殖抑制作用的研究[D]. 黃琛.河北醫(yī)科大學(xué) 2015
[6]葫蘆素E對脂多糖誘導(dǎo)的小鼠巨噬細胞RAW264.7炎癥反應(yīng)的抑制作用及其機制研究[D]. 喬靜.暨南大學(xué) 2013
[7]苦瓜提取物及其抗蟲抑菌效果[D]. 羅宏.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
本文編號:2908036
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