蕓薹生鏈格孢轉(zhuǎn)錄因子基因Ab06986的克隆與功能研究
發(fā)布時(shí)間:2020-12-08 05:56
十字花科蔬菜黑斑病是由鏈格孢引起的世界性真菌病害,從20世紀(jì)90年代開(kāi)始,該種病害在我國(guó)北方發(fā)生嚴(yán)重,至今仍對(duì)十字花科蔬菜的生產(chǎn)存在較大威脅。蕓薹生鏈格孢(Alternaria brassicicola)為該病害主要病原之一。轉(zhuǎn)錄因子是參與病原菌生長(zhǎng)發(fā)育及致病性的重要調(diào)控因子,因此研究蕓薹生鏈格孢的致病相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子,有助于認(rèn)識(shí)其致病分子作用機(jī)制,對(duì)于防治蕓薹生鏈格孢引起的黑斑病至關(guān)重要。鋅指蛋白中的Zn2Cys6是真菌中特有的一類(lèi)轉(zhuǎn)錄因子,調(diào)控真菌的多種生理過(guò)程,包括真菌的生長(zhǎng)、產(chǎn)孢和侵染寄主的過(guò)程。該類(lèi)轉(zhuǎn)錄因子在蕓薹生鏈格孢菌種中尚未被系統(tǒng)的研究。本研究主要以蕓薹生鏈格孢(A.brassicicola)的一個(gè)Zn2Cys6轉(zhuǎn)錄因子基因Ab06986為研究對(duì)象,克隆了Ab06986基因,對(duì)Ab06986基因缺失突變體的生物學(xué)性狀進(jìn)行了研究,系統(tǒng)探索了Ab06986基因的生物功能。本研究共獲得了三株Ab06986基因缺失突變體,與野生菌、互補(bǔ)體的性狀功能對(duì)比結(jié)果如下:(1)Ab06986基因參與調(diào)控蕓...
【文章來(lái)源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁(yè)數(shù)】:65 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
Ab06986DNA與cDNA擴(kuò)增PCR產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳
圖 1 Ab06986 DNA 與 cDNA 擴(kuò)增 PCR 產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳1.DNAPCR 產(chǎn)物;2.cDNAPCR 產(chǎn)物;M.DNAMarker D2000Fig.1 Agarose gel electrophoresis of the PCR product from theAb06986 DNA and cDNA1.PCR product of DNA;2.PCR product of cDNA;M.DNAMarker D2000以蕓薹生鏈格孢基因組 DNA 及 cDNA 為模板,Ab06986-F 和 Ab06986-R 為引物擴(kuò)增并進(jìn)行電泳檢測(cè),結(jié)果如圖 1 所示。將目的條帶進(jìn)行 PCR 產(chǎn)物回收,并交由生工生物工程(上海)股份有限公司進(jìn)行測(cè)序。經(jīng)過(guò)分析發(fā)現(xiàn)蕓薹生鏈格孢中 Ab06986 基因大小為 1240 bp,RNA 為 1140 bp,其中內(nèi)含子 2 個(gè),分別位于基因的 58-108 處和 346-397處,編碼 379 個(gè)氨基酸。3.1.3Ab06986 基因的保守區(qū)分析將 Ab06986 基因預(yù)測(cè)蛋白進(jìn)行保守區(qū)序列分析,在 NCBI 上將基因 Ab06986 blast,顯示在 50bp-150 bp 之間存在 Zn2+結(jié)合域,如圖 2 所示:
圖 3 蕓薹生鏈格孢 Ab06986 基因與其他真菌同源基因相似性比對(duì)結(jié)果Fig.3 Comparison of genetic similarity between Alternaria alternataAb06986 gene and other fungi3.1.4Ab06986 基因的相似性比對(duì)利用 NCBI BLAST-protein 程序?qū)y(cè)序得到的 Ab06986 氨基酸序列與數(shù)據(jù)庫(kù)中其它真菌同源基因氨基酸序列進(jìn)行同源分析,并建立真菌系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)如圖 4 所示。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]NAC轉(zhuǎn)錄因子在水稻抗逆基因工程中的應(yīng)用進(jìn)展[J]. 段俊枝,李瑩,趙明忠,魏小春,任銀鈴. 中國(guó)稻米. 2017(06)
[2]轉(zhuǎn)錄因子研究方法進(jìn)展[J]. 劉相蓮,喬芳,黃德玉,袁宗輝,王旭. 生理科學(xué)進(jìn)展. 2017(01)
[3]植物逆境相關(guān)C2H2型鋅指蛋白的研究進(jìn)展[J]. 趙麗娟,易小婭,曾幼玲. 分子植物育種. 2016(03)
[4]Ste12基因?qū)τ衩状蟀卟【鷿B透脅迫的調(diào)控作用[J]. 張運(yùn)峰,張淑紅,范永山,董金皋. 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(02)
[5]煙草C2H2鋅指蛋白轉(zhuǎn)錄因子家族成員的鑒定與表達(dá)分析[J]. 楊明磊,晁江濤,王大偉,胡軍華,吳華,龔達(dá)平,劉貫山. 遺傳. 2016(04)
[6]Involvement of C2H2 zinc finger proteins in the regulation of epidermal cell fate determination in Arabidopsis[J]. An Yan,Minjie Wu,Yongqin Zhao,Aidong Zhang,Bohan Liu,John Schiefelbein,Yinbo Gan. Journal of Integrative Plant Biology. 2014(12)
[7]白菜黑斑病抗性鑒定及QTL定位[J]. 陳瑩,柳李旺,謝學(xué)文,孟霖,劉博,王曉武,李寶聚,武劍. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(24)
[8]植物病原鏈格孢屬真菌的致病機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 康子騰,姜黎明,羅義勇,柳陳堅(jiān),李曉然. 生命科學(xué). 2013(09)
[9]茉莉酸和真菌病原誘導(dǎo)的水稻W(wǎng)RKY30轉(zhuǎn)錄因子基因的分離及表達(dá)特征[J]. 彭喜旭,胡耀軍,唐新科,周平蘭,鄧小波,王海華. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(12)
[10]植物C2H2型鋅指蛋白的研究進(jìn)展[J]. 宋冰,洪洋,王武,王賀,付永平,丁孝營(yíng). 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2010(06)
博士論文
[1]擬南芥鋅指蛋白ZAT18參與響應(yīng)干旱脅迫機(jī)制的研究[D]. 殷明珠.中國(guó)科學(xué)院武漢植物園 2017
[2]梨樹(shù)腐爛病菌的轉(zhuǎn)錄組分析及兩個(gè)轉(zhuǎn)錄因子的功能研究[D]. 何鋒.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[3]稻瘟病菌Zn2Cys6和bHLH家族轉(zhuǎn)錄因子功能分析[D]. 曹慧娟.浙江大學(xué) 2015
[4]大豆C2H2型鋅指蛋白基因SCTF-1、STF-2、STF-3的克隆及功能分析[D]. 宋冰.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[5]大豆疫霉MAP kinase PsSAK1信號(hào)途徑及MYB轉(zhuǎn)錄因子基因家族的功能分析[D]. 張萌.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[6]鋅指轉(zhuǎn)錄因子ZNF580相互作用蛋白的篩選與鑒定[D]. 羅玉玉.天津醫(yī)科大學(xué) 2011
[7]大豆疫霉轉(zhuǎn)錄因子PsCZF1、PsHSF1和PsMAD1的功能研究[D]. 王永林.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[8]水稻鋅指蛋白基因RZF5和RZF71的克隆與功能分析[D]. 郭書(shū)巧.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
碩士論文
[1]轉(zhuǎn)錄因子和染色質(zhì)特征的分布特點(diǎn)及其關(guān)聯(lián)[D]. 劉艷玲.內(nèi)蒙古大學(xué) 2017
[2]蕓薹生鏈格孢轉(zhuǎn)錄因子ZnCys_Ab0012基因功能研究[D]. 劉偉陽(yáng).山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[3]轉(zhuǎn)錄因子和組蛋白修飾的分布特征以及高低表達(dá)基因的識(shí)別[D]. 薛高高.內(nèi)蒙古大學(xué) 2016
[4]蕓薹生鏈格孢AbPbs2基因功能及下游MAPK錨定作用位點(diǎn)的研究[D]. 祝春曉.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[5]BjC-P啟動(dòng)子真菌誘導(dǎo)核心元件的互作轉(zhuǎn)錄因子篩選及鑒定[D]. 賈雙偉.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2014
[6]294個(gè)稻瘟病菌轉(zhuǎn)錄因子基因的敲除和功能分析[D]. 張莉林.浙江大學(xué) 2013
[7]稻瘟病菌轉(zhuǎn)錄因子Moswi6的功能研究[D]. 王琦.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[8]大豆C2H2型鋅指蛋白轉(zhuǎn)錄因子基因的克隆與鑒定[D]. 劉萌萌.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2007
本文編號(hào):2904580
【文章來(lái)源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁(yè)數(shù)】:65 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
Ab06986DNA與cDNA擴(kuò)增PCR產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳
圖 1 Ab06986 DNA 與 cDNA 擴(kuò)增 PCR 產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳1.DNAPCR 產(chǎn)物;2.cDNAPCR 產(chǎn)物;M.DNAMarker D2000Fig.1 Agarose gel electrophoresis of the PCR product from theAb06986 DNA and cDNA1.PCR product of DNA;2.PCR product of cDNA;M.DNAMarker D2000以蕓薹生鏈格孢基因組 DNA 及 cDNA 為模板,Ab06986-F 和 Ab06986-R 為引物擴(kuò)增并進(jìn)行電泳檢測(cè),結(jié)果如圖 1 所示。將目的條帶進(jìn)行 PCR 產(chǎn)物回收,并交由生工生物工程(上海)股份有限公司進(jìn)行測(cè)序。經(jīng)過(guò)分析發(fā)現(xiàn)蕓薹生鏈格孢中 Ab06986 基因大小為 1240 bp,RNA 為 1140 bp,其中內(nèi)含子 2 個(gè),分別位于基因的 58-108 處和 346-397處,編碼 379 個(gè)氨基酸。3.1.3Ab06986 基因的保守區(qū)分析將 Ab06986 基因預(yù)測(cè)蛋白進(jìn)行保守區(qū)序列分析,在 NCBI 上將基因 Ab06986 blast,顯示在 50bp-150 bp 之間存在 Zn2+結(jié)合域,如圖 2 所示:
圖 3 蕓薹生鏈格孢 Ab06986 基因與其他真菌同源基因相似性比對(duì)結(jié)果Fig.3 Comparison of genetic similarity between Alternaria alternataAb06986 gene and other fungi3.1.4Ab06986 基因的相似性比對(duì)利用 NCBI BLAST-protein 程序?qū)y(cè)序得到的 Ab06986 氨基酸序列與數(shù)據(jù)庫(kù)中其它真菌同源基因氨基酸序列進(jìn)行同源分析,并建立真菌系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)如圖 4 所示。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]NAC轉(zhuǎn)錄因子在水稻抗逆基因工程中的應(yīng)用進(jìn)展[J]. 段俊枝,李瑩,趙明忠,魏小春,任銀鈴. 中國(guó)稻米. 2017(06)
[2]轉(zhuǎn)錄因子研究方法進(jìn)展[J]. 劉相蓮,喬芳,黃德玉,袁宗輝,王旭. 生理科學(xué)進(jìn)展. 2017(01)
[3]植物逆境相關(guān)C2H2型鋅指蛋白的研究進(jìn)展[J]. 趙麗娟,易小婭,曾幼玲. 分子植物育種. 2016(03)
[4]Ste12基因?qū)τ衩状蟀卟【鷿B透脅迫的調(diào)控作用[J]. 張運(yùn)峰,張淑紅,范永山,董金皋. 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(02)
[5]煙草C2H2鋅指蛋白轉(zhuǎn)錄因子家族成員的鑒定與表達(dá)分析[J]. 楊明磊,晁江濤,王大偉,胡軍華,吳華,龔達(dá)平,劉貫山. 遺傳. 2016(04)
[6]Involvement of C2H2 zinc finger proteins in the regulation of epidermal cell fate determination in Arabidopsis[J]. An Yan,Minjie Wu,Yongqin Zhao,Aidong Zhang,Bohan Liu,John Schiefelbein,Yinbo Gan. Journal of Integrative Plant Biology. 2014(12)
[7]白菜黑斑病抗性鑒定及QTL定位[J]. 陳瑩,柳李旺,謝學(xué)文,孟霖,劉博,王曉武,李寶聚,武劍. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(24)
[8]植物病原鏈格孢屬真菌的致病機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 康子騰,姜黎明,羅義勇,柳陳堅(jiān),李曉然. 生命科學(xué). 2013(09)
[9]茉莉酸和真菌病原誘導(dǎo)的水稻W(wǎng)RKY30轉(zhuǎn)錄因子基因的分離及表達(dá)特征[J]. 彭喜旭,胡耀軍,唐新科,周平蘭,鄧小波,王海華. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(12)
[10]植物C2H2型鋅指蛋白的研究進(jìn)展[J]. 宋冰,洪洋,王武,王賀,付永平,丁孝營(yíng). 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2010(06)
博士論文
[1]擬南芥鋅指蛋白ZAT18參與響應(yīng)干旱脅迫機(jī)制的研究[D]. 殷明珠.中國(guó)科學(xué)院武漢植物園 2017
[2]梨樹(shù)腐爛病菌的轉(zhuǎn)錄組分析及兩個(gè)轉(zhuǎn)錄因子的功能研究[D]. 何鋒.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[3]稻瘟病菌Zn2Cys6和bHLH家族轉(zhuǎn)錄因子功能分析[D]. 曹慧娟.浙江大學(xué) 2015
[4]大豆C2H2型鋅指蛋白基因SCTF-1、STF-2、STF-3的克隆及功能分析[D]. 宋冰.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[5]大豆疫霉MAP kinase PsSAK1信號(hào)途徑及MYB轉(zhuǎn)錄因子基因家族的功能分析[D]. 張萌.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[6]鋅指轉(zhuǎn)錄因子ZNF580相互作用蛋白的篩選與鑒定[D]. 羅玉玉.天津醫(yī)科大學(xué) 2011
[7]大豆疫霉轉(zhuǎn)錄因子PsCZF1、PsHSF1和PsMAD1的功能研究[D]. 王永林.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[8]水稻鋅指蛋白基因RZF5和RZF71的克隆與功能分析[D]. 郭書(shū)巧.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
碩士論文
[1]轉(zhuǎn)錄因子和染色質(zhì)特征的分布特點(diǎn)及其關(guān)聯(lián)[D]. 劉艷玲.內(nèi)蒙古大學(xué) 2017
[2]蕓薹生鏈格孢轉(zhuǎn)錄因子ZnCys_Ab0012基因功能研究[D]. 劉偉陽(yáng).山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[3]轉(zhuǎn)錄因子和組蛋白修飾的分布特征以及高低表達(dá)基因的識(shí)別[D]. 薛高高.內(nèi)蒙古大學(xué) 2016
[4]蕓薹生鏈格孢AbPbs2基因功能及下游MAPK錨定作用位點(diǎn)的研究[D]. 祝春曉.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[5]BjC-P啟動(dòng)子真菌誘導(dǎo)核心元件的互作轉(zhuǎn)錄因子篩選及鑒定[D]. 賈雙偉.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2014
[6]294個(gè)稻瘟病菌轉(zhuǎn)錄因子基因的敲除和功能分析[D]. 張莉林.浙江大學(xué) 2013
[7]稻瘟病菌轉(zhuǎn)錄因子Moswi6的功能研究[D]. 王琦.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[8]大豆C2H2型鋅指蛋白轉(zhuǎn)錄因子基因的克隆與鑒定[D]. 劉萌萌.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2007
本文編號(hào):2904580
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