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多重實(shí)時(shí)PCR技術(shù)用于Ph-like急性淋巴細(xì)胞白血病融合基因檢測(cè)的研究

發(fā)布時(shí)間:2020-12-08 06:30
  Ph-like ALL(Philadelphia chromosome-like Acute Lymphoblastic Leukemia)為最新報(bào)道的一種ALL亞型,在ALL中約占20%。表達(dá)譜聚類分析發(fā)現(xiàn)其基因表達(dá)與BCR-ABL1陽(yáng)性ALL(Ph+ALL)相似,臨床預(yù)后也相似,但不存在BCR-ABL1融合基因。Ph-like ALL涉及激酶信號(hào)通路異;罨鸵幌盗屑(xì)胞因子受體基因異常,并常伴有淋系發(fā)育相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子異常。近幾年研究發(fā)現(xiàn),基于Ph-like ALL分子遺傳學(xué)異常,使用相應(yīng)的酪氨酸激酶抑制劑(TKIs)聯(lián)合化療可以顯著改善Ph-like ALL的療效。因此,檢測(cè)Ph-like ALL相關(guān)的分子遺傳學(xué)異常具有重要的臨床意義。本研究采用實(shí)時(shí)PCR技術(shù)平臺(tái),以Ph-like ALL相關(guān)的32種融合基因和一項(xiàng)獨(dú)立預(yù)后因素為檢測(cè)對(duì)象,結(jié)合媒介探針技術(shù)和HAND系統(tǒng)(Homo-Tag Assisted Non-Dimer),建立四管多重實(shí)時(shí)PCR的檢測(cè)方法,可檢測(cè)與Ph-like ALL相關(guān)的32種融合基因(42種以上的融合形式)和一項(xiàng)獨(dú)立預(yù)后因素。首先通過(guò)文獻(xiàn)調(diào)研確認(rèn)每種融合基因... 

【文章來(lái)源】:廈門大學(xué)福建省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:79 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

多重實(shí)時(shí)PCR技術(shù)用于Ph-like急性淋巴細(xì)胞白血病融合基因檢測(cè)的研究


圖1-2?COG的Ph-like?ALL診斷方案丨66丨??Figurel-2?Diagnostic?algorithm?for?identifying?Ph-like?ALL.??

原理圖,媒介,探針技術(shù),分子信標(biāo)探針


起到封閉作用,防止其結(jié)合到靶DNA后延伸;另一條是通用檢測(cè)探針??(Universal?detection?probe),為分子信標(biāo)其5'端標(biāo)記熒光基團(tuán)和3'端標(biāo)記萍??滅基團(tuán),其中分子信標(biāo)的莖序列的3'區(qū)有一段序列為媒介子雜交區(qū)域(圖1-??3?A)。??基于分子信標(biāo)媒介探針技術(shù)的工作流程如下:(1)引物和媒介探針退火結(jié)合。??在PCR過(guò)程中的變性步驟,模板的DNA雙鏈分開,上下游引物和媒介探針??的靶特異序列分別與模板的DNA相應(yīng)的鏈雜交(圖1-3?B1);?(2)引物延伸??和媒介探針被切。引物在延伸過(guò)程中,由于媒介探針5'區(qū)媒介子不與靶DNA??匹配,因此媒介子被具有5'—3'外切酶活性的DNA聚合酶切斷(該酶切位點(diǎn)??主要是在媒介探針上靶結(jié)合序列與靶互補(bǔ)的第一個(gè)和第二個(gè)堿基中間切斷)??[75,76],從而使媒介子被切下并暴露出3f-0H,而與靶互補(bǔ)的探針則被消化成??碎片[76](圖1-3B2);?(3)媒介子的退火和延伸。再下一輪的PCR退火過(guò)程,??暴露出3f-OH的媒介子雜交在分子信標(biāo)通用檢測(cè)探針的環(huán)序列上并延伸,打??開分子信標(biāo)的莖序列

示意圖,探針設(shè)計(jì),融合基因,斷裂點(diǎn)


(__032682.5),其中,別7戶2/4-/451/存在3種融合形式(圖2-1八)。具體的??斷裂點(diǎn)見圖2-1。J5Z7的斷裂點(diǎn)有exon2、exon3和exon4,考慮到擴(kuò)增子的長(zhǎng)??度不能太長(zhǎng),所以上設(shè)計(jì)了兩條下游引物和兩條媒介探針,斷裂點(diǎn)ex〇n2??和exon?3共用下游引物和媒介探針。媒介探針和其他上游引物的設(shè)計(jì)位點(diǎn)如圖??2-1?B所示。??A??ETV6-ABLl(e5?2)?RCSDJ-ABLl(e2-e4)??i?5?I?i21?一3?i?mfm?丨4一?|5|??NUPm-ABLHen-.D^l)?(e34-e3)?5,V^-.?I/(e3-e4)????32?|?33?|?34]?I?2?I?3? ̄I?I?2?| ̄*3?Vf???? ̄I ̄I?■■一、??ZXHZl-ABLJ(e\S-e2)??32?32?2?3?一?—????r^n? ̄ ̄????RTI ̄17?I?18丨?2?3 ̄??32?33?34?3?4???????????????FOXPJ-ABLJ(e[9-e4)??R.4NB

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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碩士論文
[1]流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)兒童白血病細(xì)胞磷酸化信號(hào)蛋白的初步研究[D]. 李華梅.廣州醫(yī)學(xué)院 2011
[2]多色實(shí)時(shí)PCR用于食源性致病菌的廣譜檢測(cè)與識(shí)別[D]. 張佳峰.廈門大學(xué) 2007



本文編號(hào):2904629

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