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超敏肽核酸鉗制PCR技術檢測結直腸癌患者血漿PIK3CA基因突變

發(fā)布時間:2020-11-13 17:20
   研究背景:結直腸癌(Colorectal cancer CRC)是全球常見的消化道惡性腫瘤之一,近幾年其發(fā)病率和死亡率呈上升趨勢,已成為嚴重威脅我國人民健康的主要腫瘤之一。PIK3CA基因突變(phosphatidylinositol-4 5-bisphosphate 3-kinase,催化亞基α)已被證明與CRC的發(fā)生、發(fā)展和預后有相關性。然而,由于目前臨床的檢測方法靈敏度低,操作過程繁瑣,使得PIK3CA基因突變的檢測受到限制。方法:我們建立了一個超敏感的肽核酸鉗制PCR技術(PNA-PCR技術)去檢測血液游離DNA中PIK3CA基因在第9、20外顯子發(fā)生的突變。而且,使用這種技術檢測128位結直腸癌患者血液PIK3CA基因突變狀態(tài),與Sanger測序法對比,確定該技術的準確度。此外,隨訪了6名接受靶向治療的CRC患者監(jiān)測PIK3CA基因突變狀態(tài)。結果:PNA-PCR技術的敏感度高,在檢測第9和20外顯子時分別為0.1%和0.2%。當128名結直腸癌患者的血液PIK3CA基因突變狀態(tài)由PNA-PCR聯(lián)合Sanger測序進行檢測時,共有33名檢測到E545K位點突變,29名檢測到H1047R位點突變,這些病人中有13名是E545K和H1047R位點突變雙陽性的,79位是兩突變位點雙陰性?偠灾,共有38.3%(49/128)的CRC患者發(fā)現(xiàn)E545K位點或H1047R位點至少一個位點存在突變;颊叩呐R床參數(shù),年齡(P=0.358),性別(P=0.622),疾病分期(P=0.353),疾病位置(P=0.307)及CEA狀態(tài)(P=0.414)等都與PIK3CA基因突變狀態(tài)沒有相關性。在連續(xù)監(jiān)測研究中,發(fā)現(xiàn)血液循環(huán)PIK3CA基因突變狀況是可以預測EGFR單抗療效的生物學標志物。因此,在CRC患者治療過程中連續(xù)監(jiān)測PIK3CA基因突變情況,能夠指導患者正確的臨床用藥,使患者最大獲益。當PIK3CA基因突變狀態(tài)只由PNA-PCR方法確定時,ΔCp值與突變DNA占DNA總量比率之間有良好的線性關系。PNA-PCR與“金標準”測序相比,其準確性分別為93.75%和92.25%,當設定第9、20外顯子ΔCp值的cut-off值分別為9.0和8.0時。結論:經過上述研究,開發(fā)了一種簡單的、非侵入性的、超敏感的PNA-PCR技術,此技術尤其適用于含微量腫瘤DNA的血液樣本檢測。動態(tài)監(jiān)測患者腫瘤基因突變狀態(tài)是可以預測EGFR單抗療效的生物學標志物。
【學位單位】:濟南大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2016
【中圖分類】:R735.34
【文章目錄】:
摘要
Abstract
主要符號表
第一章 緒論
第二章 材料和方法
    2.1 臨床標本收集及處理
    2.2 材料與試劑
    2.3 實驗方法
第三章 結果
    3.1 DLD-1、HCT116和A549細胞PI3KCA基因的突變分析
    3.2 PIK3CA基因E545K和H1047R位點突變的檢測限度
    3.3 PNA-PCR聯(lián)合Sanger測序法檢測血液循環(huán)PI3KCA基因突變
    3.4 血液循環(huán)PIK3CA基因突變與結直腸病人臨床參數(shù)的相關性
    3.5 PNA-PCR技術直接檢測血液循環(huán)PIK3CA基因突變
第四章 討論
第五章 結論
參考文獻
攻讀學位期間取得的研究成果
致謝

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