下調(diào)FOXK1表達對結(jié)直腸癌細胞系SW480基因表達譜的影響
發(fā)布時間:2020-11-13 02:28
目的及意義結(jié)直腸癌的早期發(fā)現(xiàn)及早期治療可提高患者的遠期生存率及其生存質(zhì)量;但由于結(jié)直腸癌早期并無明顯的、特異性的臨床癥狀或體征,早期診治該疾病仍有困難。雖然目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)多種和結(jié)直腸癌相關(guān)的腫瘤標記物,仍難以用于診斷及靶向治療。此外結(jié)直腸癌的高死亡率主要是由于術(shù)后腫瘤復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移所導(dǎo)致的。因此對結(jié)直腸癌發(fā)生、侵襲和轉(zhuǎn)移的分子機制的深入研究給早期結(jié)直腸癌的發(fā)現(xiàn)及相關(guān)的靶向治療提供可能,進而提高患者的生存率及生存質(zhì)量。研究發(fā)現(xiàn)FOXK1能夠調(diào)控胚胎發(fā)育、維持代謝平衡,參與細胞代謝及生長,其與結(jié)直腸癌的發(fā)生發(fā)展有著密切的相關(guān)性。實驗研究表明其下調(diào)能抑制結(jié)直腸癌細胞的增殖、侵襲以及轉(zhuǎn)移。本課題主要通過基因芯片檢測技術(shù)了解下調(diào)FOXK1的表達對結(jié)直腸癌細胞系SW480基因表達譜的影響以讓課題組最終探究其下游基因及其相關(guān)機制,為未來開展對結(jié)直腸癌的新的靶向治療提供可能。實驗研究方法根據(jù)課題組前期實驗結(jié)果,本課題選取SW480細胞系進行實驗,將其分別設(shè)置為對照組及實驗組,實驗組轉(zhuǎn)染FOXK1-siRNA,對照組轉(zhuǎn)染Scrambled-siRNA,通過該RNA干擾技術(shù)在腸癌細胞系中靶向敲低癌基因FOXK1,利用蛋白質(zhì)免疫印跡試驗驗證轉(zhuǎn)染后的FOXK1表達情況,通過Nanodrop2000超微量分光光度計及Agilent 2100 Bioanalyzer對RNA進行質(zhì)檢,采用基因芯片技術(shù)了解下調(diào)FOXK1的表達對腸癌細胞系SW480基因表達譜的影響,以符合|Fold Change|大于2同時P-value小于0.05的條件作為顯著差異的篩選標準。結(jié)果結(jié)果顯示相對于對照組,實驗組中有888個基因有顯著差異表達,其中有491個基因的表達是上調(diào)的,有397個基因的表達是下調(diào)的。結(jié)論基因芯片結(jié)果提示相對于對照組,許多參與腫瘤發(fā)生發(fā)展的基因發(fā)生了改變。通過KEGG數(shù)據(jù)庫進行pathway分析提示FOXK1可能通過參與多條信號通路調(diào)控腫瘤細胞的發(fā)生發(fā)展。
【學(xué)位單位】:南方醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:R735.34
【部分圖文】:
28S/18S<0.7均考慮樣品存在部分降解,若2100RIN<=6.0則考慮樣品降解,故??質(zhì)檢標準為Agilent?2100?Bioanalyzer?RIN值大于等于7.0同時28S/18S比值大于??0.7,表3-1及圖3-2、3-3結(jié)果提示所檢測樣品均為合格的樣品,可進行下一步??的實驗。??26??
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【參考文獻】
本文編號:2881594
【學(xué)位單位】:南方醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:R735.34
【部分圖文】:
28S/18S<0.7均考慮樣品存在部分降解,若2100RIN<=6.0則考慮樣品降解,故??質(zhì)檢標準為Agilent?2100?Bioanalyzer?RIN值大于等于7.0同時28S/18S比值大于??0.7,表3-1及圖3-2、3-3結(jié)果提示所檢測樣品均為合格的樣品,可進行下一步??的實驗。??26??
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【參考文獻】
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1 曹明楠;崔俊;李衛(wèi)東;;基因芯片技術(shù)在抗腫瘤藥物研究和腫瘤診斷中的應(yīng)用[J];中國藥理學(xué)與毒理學(xué)雜志;2014年06期
2 滕牧洲;馬文麗;;走近醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域中的基因芯片技術(shù)[J];分子診斷與治療雜志;2014年06期
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本文編號:2881594
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