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下調(diào)FOXK1表達(dá)對(duì)結(jié)直腸癌細(xì)胞系SW480基因表達(dá)譜的影響

發(fā)布時(shí)間:2020-11-13 02:28
   目的及意義結(jié)直腸癌的早期發(fā)現(xiàn)及早期治療可提高患者的遠(yuǎn)期生存率及其生存質(zhì)量;但由于結(jié)直腸癌早期并無(wú)明顯的、特異性的臨床癥狀或體征,早期診治該疾病仍有困難。雖然目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)多種和結(jié)直腸癌相關(guān)的腫瘤標(biāo)記物,仍難以用于診斷及靶向治療。此外結(jié)直腸癌的高死亡率主要是由于術(shù)后腫瘤復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移所導(dǎo)致的。因此對(duì)結(jié)直腸癌發(fā)生、侵襲和轉(zhuǎn)移的分子機(jī)制的深入研究給早期結(jié)直腸癌的發(fā)現(xiàn)及相關(guān)的靶向治療提供可能,進(jìn)而提高患者的生存率及生存質(zhì)量。研究發(fā)現(xiàn)FOXK1能夠調(diào)控胚胎發(fā)育、維持代謝平衡,參與細(xì)胞代謝及生長(zhǎng),其與結(jié)直腸癌的發(fā)生發(fā)展有著密切的相關(guān)性。實(shí)驗(yàn)研究表明其下調(diào)能抑制結(jié)直腸癌細(xì)胞的增殖、侵襲以及轉(zhuǎn)移。本課題主要通過(guò)基因芯片檢測(cè)技術(shù)了解下調(diào)FOXK1的表達(dá)對(duì)結(jié)直腸癌細(xì)胞系SW480基因表達(dá)譜的影響以讓課題組最終探究其下游基因及其相關(guān)機(jī)制,為未來(lái)開展對(duì)結(jié)直腸癌的新的靶向治療提供可能。實(shí)驗(yàn)研究方法根據(jù)課題組前期實(shí)驗(yàn)結(jié)果,本課題選取SW480細(xì)胞系進(jìn)行實(shí)驗(yàn),將其分別設(shè)置為對(duì)照組及實(shí)驗(yàn)組,實(shí)驗(yàn)組轉(zhuǎn)染FOXK1-siRNA,對(duì)照組轉(zhuǎn)染Scrambled-siRNA,通過(guò)該RNA干擾技術(shù)在腸癌細(xì)胞系中靶向敲低癌基因FOXK1,利用蛋白質(zhì)免疫印跡試驗(yàn)驗(yàn)證轉(zhuǎn)染后的FOXK1表達(dá)情況,通過(guò)Nanodrop2000超微量分光光度計(jì)及Agilent 2100 Bioanalyzer對(duì)RNA進(jìn)行質(zhì)檢,采用基因芯片技術(shù)了解下調(diào)FOXK1的表達(dá)對(duì)腸癌細(xì)胞系SW480基因表達(dá)譜的影響,以符合|Fold Change|大于2同時(shí)P-value小于0.05的條件作為顯著差異的篩選標(biāo)準(zhǔn)。結(jié)果結(jié)果顯示相對(duì)于對(duì)照組,實(shí)驗(yàn)組中有888個(gè)基因有顯著差異表達(dá),其中有491個(gè)基因的表達(dá)是上調(diào)的,有397個(gè)基因的表達(dá)是下調(diào)的。結(jié)論基因芯片結(jié)果提示相對(duì)于對(duì)照組,許多參與腫瘤發(fā)生發(fā)展的基因發(fā)生了改變。通過(guò)KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行pathway分析提示FOXK1可能通過(guò)參與多條信號(hào)通路調(diào)控腫瘤細(xì)胞的發(fā)生發(fā)展。
【學(xué)位單位】:南方醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:R735.34
【部分圖文】:

蛋白質(zhì)免疫印跡,樣品,質(zhì)檢標(biāo)準(zhǔn),比干


28S/18S<0.7均考慮樣品存在部分降解,若2100RIN<=6.0則考慮樣品降解,故??質(zhì)檢標(biāo)準(zhǔn)為Agilent?2100?Bioanalyzer?RIN值大于等于7.0同時(shí)28S/18S比值大于??0.7,表3-1及圖3-2、3-3結(jié)果提示所檢測(cè)樣品均為合格的樣品,可進(jìn)行下一步??的實(shí)驗(yàn)。??26??

樣本,基因芯片,原始數(shù)據(jù)


i?I?i?I?I?i?I?I ̄i?i??20?25?30?35?40?45?50?55?W?65?(j)??圖3-3?Agilent?2100?Bioanalyzer檢測(cè)到的各個(gè)樣品總RNA的結(jié)果圖。??Figure?3-3?These?graphs?show?total?RNA?electropherograms?detected?by?Agilent?2100??Bioanalyzer.??3.2.2基因芯片的數(shù)據(jù)??(1)基因芯片的原始數(shù)據(jù)??-?.??■?--??(:?^?■?\??I?r??.?.??'??i?ir.?I??圖3-4基因芯片的原始數(shù)據(jù),A圖為樣本C71-1,?B圖為樣本C72-1,?C圖為樣本C71-2,?D??圖為樣本C72-2,?E圖為樣本C7卜3,?F圖為樣本C72-3。??Figure?3-4?Original?Data?of?microarray??figure?A?represents?C71?-1??figure?B?represents?C72-1,??28??

樣本,樣品,基因芯片,原始數(shù)據(jù)


'??i?ir.?I??圖3-4基因芯片的原始數(shù)據(jù),A圖為樣本C71-1,?B圖為樣本C72-1,?C圖為樣本C71-2,?D??圖為樣本C72-2,?E圖為樣本C7卜3,?F圖為樣本C72-3。??Figure?3-4?Original?Data?of?microarray??figure?A?represents?C71?-1??figure?B?represents?C72-1,??28??
【參考文獻(xiàn)】

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1 曹明楠;崔俊;李衛(wèi)東;;基因芯片技術(shù)在抗腫瘤藥物研究和腫瘤診斷中的應(yīng)用[J];中國(guó)藥理學(xué)與毒理學(xué)雜志;2014年06期

2 滕牧洲;馬文麗;;走近醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域中的基因芯片技術(shù)[J];分子診斷與治療雜志;2014年06期

3 張國(guó)棟;張德保;;基因芯片技術(shù)在腫瘤研究與治療中的應(yīng)用[J];腫瘤藥學(xué);2011年05期

4 邢國(guó)宏,張進(jìn)川;基因芯片技術(shù)在肺癌研究中的應(yīng)用[J];國(guó)外醫(yī)學(xué).呼吸系統(tǒng)分冊(cè);2004年04期



本文編號(hào):2881594

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