目的:1研究FAM102A、ACTA2、APOL6、DHRS9、ASAP1、SLC11A1基因在活動(dòng)性肺結(jié)核患者、肺結(jié)核密切接觸者以及健康對照者中的表達(dá)情況,探討其作為診斷結(jié)核病生物標(biāo)志物的可能性。2研究探討SLC11A1基因和ASAP1基因多態(tài)性與新疆喀什地區(qū)維吾爾族肺結(jié)核易感性的相關(guān)性。方法:1從山東濟(jì)寧市某醫(yī)院住院的結(jié)核病患者中收集活動(dòng)性肺結(jié)核患者30例,結(jié)核病患者的家屬中選取密切接觸者18例,體檢科選取健康對照者30例。分別用枸櫞酸鈉抗凝管取靜脈血2ml,并提取全血白細(xì)胞總RNA,并進(jìn)行RNA的逆轉(zhuǎn)錄。采用熒光實(shí)時(shí)定量PCR法,進(jìn)行FAM102A、ACTA2、APOL6、DHRS9、ASAP1、SLC11A1基因轉(zhuǎn)錄水平的檢測。統(tǒng)計(jì)分析計(jì)量資料采用x±s表示,單因素方差分析比較RNA在多組間的差異,P0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。2從新疆喀什某醫(yī)院收集維吾爾族個(gè)體血液樣本644例,其中肺結(jié)核患者251例,健康對照者393例,分別提取樣本DNA,并采用測序的分型方法(Sequence-based typing,SBT),對SLC11A1基因的3個(gè)單核苷酸多態(tài)位點(diǎn)(rs17235409 GA;rs17235416 TGTG/TGTG--/--;rs3731865 CG)及ASAP1基因的7個(gè)單核苷酸多態(tài)位點(diǎn)(rs1017281 GA;rs10956514 GA;rs12680942 GA;rs1469288GA;rs17285138 TA;rs2033059 CT;rs4733781 CA)進(jìn)行檢測,統(tǒng)計(jì)分析檢測的結(jié)果,探討SLC11A1基因及ASAP1基因的多態(tài)性與維吾爾族人群肺結(jié)核易感性的相關(guān)性;比較SLC11A1基因rs17235409 GA;rs17235416 TGTG/TGTG--/--基因型在維吾爾族人群與已報(bào)道的漢族人群及哈薩克族人群之間基因型頻率的差異。結(jié)果:1(1)與健康對照者相比,活動(dòng)性肺結(jié)核患者FAM102、SLC11A1、ASAP1、DHRS9基因的表達(dá)量分別是健康對照者的0.23倍、0.38倍、0.52倍和1.84倍,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05),而ACTA2、APOL6基因的表達(dá)量在活動(dòng)性肺結(jié)核患者與健康對照者之間差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05)。(2)與健康對照者相比,肺結(jié)核密切接觸者FAM102A、SLC11A1、ASAP1基因的表達(dá)量分別是健康對照者的0.45倍、0.64倍和0.63倍,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05);而DHRS9、ACTA2、APOL6基因的表達(dá)量在密切接觸者與健康對照者之間差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05)。(3)與肺結(jié)核密切接觸者相比,活動(dòng)性肺結(jié)核患者FAM102A、SLC11A1基因的表達(dá)量分別是潛伏結(jié)核感染者的0.50倍、0.59倍,統(tǒng)計(jì)學(xué)分析結(jié)果顯示差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05)。而ASAP1、DHRS9、ACTA2、APOL6基因的表達(dá)量在活動(dòng)性肺結(jié)核患者與密切接觸者之間差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05)。ROC曲線分析FAM102A、DHRS9、SLC11A1、ASAP1基因在活動(dòng)性肺結(jié)核患者和健康對照者中曲線下面積分別為0.831、0.863、0.841、0.848。FAM102A、SLC11A1、ASAP1基因在肺結(jié)核密切接觸者與健康對照者中曲線下面積分別為0.854、0.813、0.836。2(1)在本實(shí)驗(yàn)的維吾爾族人群樣本病例組與健康對照組中SLC11A1基因rs17235409 GA;rs17235416 TGTG/TGTG--/--;rs3731865 CG各基因型頻率P0.05,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。SLC11A1基因rs17235409在本實(shí)驗(yàn)的維吾爾族人群樣本與已報(bào)道的漢族人群樣本中GG、GA、AA基因型頻率分別是86.6%、12.9%、0.8%和77.7%、20.4%、1.9%,χ2=9.363,P0.05差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。SLC11A1基因rs17235416在本實(shí)驗(yàn)維吾爾族人群樣本和已報(bào)道的哈薩克族人群樣本中TGTG/TGTG、TGTG/-、--/--基因型頻率分別為86.3%、12.7%、0.9%和71.9%、24.5%、3.5%,χ2=35.833,P0.05,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。(2)在本實(shí)驗(yàn)的維吾爾族人群樣本病例組與健康對照組中ASAP1基因多態(tài)位點(diǎn)rs12680942 GA,GG、GA、AA基因型頻率分別為18.7%,56.6%,24.7%和20.4%,47.4%,32.7%,當(dāng)以GG/GA基因型頻率為參照,純合子AA基因型頻率在病例組中為24.7%,健康對照組為32.7%,經(jīng)χ2檢驗(yàn),初始OR值為0.693,95%的可信區(qū)間為0.485-0.989,P0.05,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。ASAP1基因多態(tài)位點(diǎn)rs4733781 CA,CC、CA、AA基因型頻率分別為18.3%,57.0%,24.7%和19.9%,47.7%,32.4%,當(dāng)以CC/CA基因型頻率為參照,純合子AA基因型頻率在病例組中為24.7%,健康對照組為32.4%,經(jīng)χ2檢驗(yàn),初始OR值為0.684,95%的可信區(qū)間為0.479-0.978,P0.05,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。分層logistic回歸檢測顯示ASAP1基因多態(tài)位點(diǎn)rs12680942 GA,當(dāng)以GG/GA基因型頻率為參照,純合子AA基因型頻率在年齡小于60及不吸煙的病例組和健康對照組之間P0.05,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,調(diào)整后的OR值分別為0.764、0.799,95%的可信區(qū)間分別為0.587-0.993、0.646-0.988。ASAP1基因多態(tài)位點(diǎn)rs4733781 CA,當(dāng)以CC/CA基因型頻率為參照,純合子AA基因型頻率在年齡小于60及不吸煙的病例組和健康對照組之間P0.05,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,調(diào)整后的OR值分別為0.759、0.795,95%的可信區(qū)間分別為0.584-0.986、0.643-0.983。結(jié)論:1 FAM102、SLC11A1、ASAP1、DHRS9基因在不同患者體內(nèi)有差異性表達(dá),推測其與結(jié)核病的發(fā)生發(fā)展有一定的關(guān)系,可能是潛在的區(qū)別潛伏結(jié)核感染者、活動(dòng)性肺結(jié)核與健康者的生物標(biāo)志物。2本實(shí)驗(yàn)中維吾爾族人群SLC11A1基因多態(tài)性與肺結(jié)核易感性不存在相關(guān)性。SLC11A1基因多態(tài)位rs17235409、rs17235416基因型頻率分布在維吾爾族人群與漢族人群之間及維吾爾族人群與哈薩克族人群之間存在明顯差異。本實(shí)驗(yàn)維吾爾族人群ASAP1基因多態(tài)位點(diǎn)rs12680942 GA,rs4733781 CA多態(tài)性與肺結(jié)核易感性存在相關(guān)性,多態(tài)位rs12680942 GAAA純合子基因型,rs4733781 CA AA純合子基因型,在年齡小于60歲及不吸煙的樣本中,表現(xiàn)為可降低患肺結(jié)核的風(fēng)險(xiǎn)。
【學(xué)位單位】：石河子大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位年份】：2016
【中圖分類】：R521
【文章目錄】：
摘要
Abstract
主要符號和縮略詞語表
前言
實(shí)驗(yàn)一 FAM102A、ACTA2、APOL6、DHRS9、ASAP1、SLC11A1基因差異性表達(dá)在結(jié)核病輔助診斷應(yīng)用中的初步評估
    材料與方法
        1.材料
        2 方法
    結(jié)果
        1 研究對象基本信息
        2 RNA、CDNA質(zhì)量鑒定
            2.1 RNA質(zhì)量鑒定
            2.2 逆轉(zhuǎn)錄后目的基因PCR結(jié)果
        3 FAM102A、ACTA2、APOL6、DHRS9、ASAP1、SLC11A1的表達(dá)水平
            3.1 FAM102A、ACTA2、APOL6、DHRS9、ASAP1、SLC11A1基因?qū)崟r(shí)定量引物標(biāo)準(zhǔn)曲線
            3.2 熒光定量PCR擴(kuò)增曲線
            3.3 基因RNA的相對表達(dá)水平
        4 ROC曲線分析
            4.1 活動(dòng)性肺結(jié)核患者與健康對照者ROC曲線分析
            4.2 潛伏結(jié)核感染者與健康對照者ROC曲線分析
    討論
實(shí)驗(yàn)二 SLC11A1基因和ASAP1基因多態(tài)性與新疆喀什地區(qū)維吾爾族人群肺結(jié)核易感性的相關(guān)性研究
    材料與方法
        1.材料
        2 方法
    結(jié)果
        1 研究對象基本信息
        2 SLC11A1、ASAP1基因SNPS的主要信息
        3 SLC11A1基因多態(tài)性與維吾爾族人群結(jié)核病易感性相關(guān)性分析
        4 SLC11A1基因多態(tài)位點(diǎn)基因型頻率在維吾爾族人群與已報(bào)道的漢族人群樣本及哈薩克族人群樣本之間的差異
            4.1 SLC11A1基因多態(tài)位點(diǎn)rs17235409基因型在維吾爾族與漢族之間的分布
            4.2 SLC11A1基因多態(tài)位點(diǎn)rs17235416基因型在維吾爾族與漢族之間的分布
            4.3 SLC11A1基因多態(tài)位點(diǎn)rs17235416基因型在維吾爾族與哈薩克族之間的分布
        5 ASAP1基因多態(tài)性與維吾爾族人群結(jié)核病易感性相關(guān)性分析
            5.1 ASAP1基因7個(gè)多態(tài)位點(diǎn)與維吾爾族人群結(jié)核病易感性相關(guān)性分析
A及rs4733781 G>A與肺結(jié)核易感性相關(guān)性分析'>            5.2 分層分析ASAP1基因rs12680942 G>A及rs4733781 G>A與肺結(jié)核易感性相關(guān)性分析
    討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
文獻(xiàn)綜述
    參考文獻(xiàn)
致謝
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本文編號：2864879