庫爾勒香梨成熟果實(shí)石細(xì)胞含量與POD4基因表達(dá)量的相關(guān)性分析
【部分圖文】:
確定三者之間的相關(guān)性,為今后闡述庫爾勒香梨兩種差異表型的發(fā)生機(jī)理提供候選基因。1材料與方法1.1材料1.1.1庫爾勒香梨供試材料取自新疆農(nóng)科院輪臺果樹資源圃農(nóng)戶香梨園,樹齡20年。2015年9月,樣品采摘果樹冠外圍果實(shí)100個,果實(shí)發(fā)育期150d。樣品采摘后分類:粗皮果標(biāo)準(zhǔn):選取果皮粗糙,目測果面明顯凸凹不平,果點(diǎn)粗大或萼端綠色達(dá)到果實(shí)1/3;正常果選取果面較為光滑,目測無凸凹,果點(diǎn)小,脫萼或萼端微凸的果實(shí)。果實(shí)采摘后按上述標(biāo)準(zhǔn)分組測量切塊,迅速放于液氮中冷凍處理,再放至-80℃冰箱長期保存。圖1,圖21.1.2試劑熒光定量引物POD4F和POD4R由上海生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成。RNAprepPurePlantKit購自天耿公司,PrimeScriptRRTreagentKit購自Takara公司,SyBRPremi×ExTaqTM購自TOYOBO、CFX96TMReal-TimeSystem實(shí)時熒光定量PCR儀(美國Bio-Rad),DNATaq酶購自廣東東盛生物科技有限公司。圖1粗皮果Fig.1Roughskinpear圖2正常果Fig.2Normalskinpear1.2方法1.2.1粗皮果和正常果硬度和石細(xì)胞含量測定硬度:取10個果實(shí),去皮,用BY-B型硬度計(jì)測定。石細(xì)胞含量:參照聶敬全[15]的方法進(jìn)行。稱取9個果實(shí)中部離果皮2.0mm至果心處的混合果肉35.0g,-20℃冷凍24h,在20000r/min下勻漿3min,勻漿加入水靜置,倒出上層懸浮物,重復(fù)3次,所得石細(xì)胞烘干后稱質(zhì)量,重復(fù)3次。石細(xì)胞含量=測定的石細(xì)胞干質(zhì)量/35×100。1.2.2POD4基因即時表達(dá)檢測總RNA的提取:參考RNAprepPurePlantKit進(jìn)行操作,取質(zhì)量較好的總RNA進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄。cDNA的合成:參照PrimeScriptRRTreagentKit說明書,以100ng總RNA模板為起始材料,進(jìn)行cDNA第一條鏈的合成。反應(yīng)體系包括100ng總RNA,
正常果Fig.2Normalskinpear
胞含量和POD4基因表達(dá)量的相關(guān)性實(shí)時熒光定量PCR擴(kuò)增數(shù)據(jù)采用2-△△ct方法分析。△Ct(目標(biāo)基因)=Ct(目標(biāo)基因)-Ct(同一樣本actin),△△Ct(目標(biāo)基因)=處理組△Ct(目標(biāo)基因)-對照組△Ct(目標(biāo)基因),相對倍數(shù)=2-△△ct(目標(biāo)基因)。果實(shí)硬度和石細(xì)胞含量與POD4基因相對表達(dá)量做相關(guān)性分析。1.3數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)采用Excel2007及SPSS17統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。2結(jié)果與分析2.1粗皮果和正常果硬度和石細(xì)胞含量研究表明,粗皮果果實(shí)硬度314.71km/cm2,正常果是245.22km/cm2,粗皮果是正常果的1.28倍。圖3粗皮果石細(xì)胞含量的平均值比正常果高30%,粗皮果每百克果肉中含石細(xì)胞0.52g,在正常果中每百克果肉中含石細(xì)胞0.4g。圖4圖3庫爾勒香梨果實(shí)硬度Fig.3FruitfirmnessofKorlafragrantpear圖4庫爾勒香梨果實(shí)石細(xì)胞含量Fig.4ThecontentofstonecellofKorlafragrantpear2.2RNA提取質(zhì)量檢測提取的果實(shí)RNA樣本,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測表明,獲得的總RNA均含有28S和18S兩條帶,且條帶清晰,無蛋白質(zhì)和DNA的污染,說明RNA樣品完整、無降解;RNA樣品A260/A280的值在1.95~2.00,說明樣品具有較高的純度,可滿足下一步熒光定量的要求。圖52.3POD4基因表達(dá)量利用qRT-PCR技術(shù)對成熟果實(shí)進(jìn)行基因表達(dá)量檢測表明,POD4基因在成熟期香梨粗皮果果肉中表達(dá)量為743.29,正常果表達(dá)量106.89,POD4在粗皮果中表達(dá)量是正常果的6.59倍。圖62.4石細(xì)胞增量和差異基因相對表達(dá)量的相關(guān)性研究表明,石細(xì)胞含量與POD4基因表達(dá)量存在顯著正相關(guān)性,其相關(guān)系數(shù)為0.823,石細(xì)胞62
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