二穗短柄草根中木栓質(zhì)脂肪醇合成基因的克隆與功能驗(yàn)證
發(fā)布時(shí)間:2020-10-27 20:13
植物根部木栓質(zhì)在植物抵御各種生物和非生物脅迫中具有重要作用。二穗短柄草作為麥類作物重要的模式植物,研究其與抗旱相關(guān)基因和機(jī)理,可為小麥等重要作物的研究提供借鑒。本論文通過(guò)氣相色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀(GC-MS)和氣相色譜(GC)分析了二穗短柄草根中木栓質(zhì)的組成和含量及其變化特點(diǎn)。利用擬南芥木栓質(zhì)脂肪醇合成酶基因AtFAR1的蛋白序列在二穗短柄草數(shù)據(jù)庫(kù)中分別進(jìn)行同源比對(duì),對(duì)獲得的同源序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析,確定出了二穗短柄草木栓質(zhì)脂肪醇合成酶相關(guān)的候選基因;分析候選基因在不同組織的表達(dá)特征,從中選擇重要的候選基因進(jìn)行了克隆和功能驗(yàn)證。研究結(jié)果如下:1.二穗短柄草根中木栓質(zhì)組成成分有初級(jí)脂肪醇、脂肪酸、ω-羥基脂肪酸和α,ω-二羧酸,物質(zhì)組成與已經(jīng)發(fā)表的擬南芥和其他物種的木栓質(zhì)組成成分相似。但是在組成成分的含量上存在一定的差異。2.二穗短柄草基因組中存在6個(gè)候選基因,共編碼6個(gè)蛋白質(zhì)。氨基酸序列多重比對(duì)后顯示,只有BdFAR4(Bradi3g20000)與AtFAR1具有50%以上的氨基酸一致性,BdFAR1(Bradi4g38460)、BdFAR2(Bradi3g42780)、BdFAR3(Bradi4g37860)、BdFAR4(Bradi3g20000)、BdFAR5(Bradi1g73877)和BdFAR6(Bradi4g37860)與AtFAR1的氨基酸序列一致性分別是40.34%、42.30%、45.20%、50.80%、35.61%和44%。通過(guò)生物信息學(xué)分析,推測(cè)這些基因可能具有合成初級(jí)脂肪醇的功能。前期我們已克隆了BdFAR1、BdFAR2和BdFAR3,并已證明BdFAR1、BdFAR2和BdFAR3參與二穗短柄草葉片表皮蠟質(zhì)中脂肪醇的合成;而B(niǎo)dFAR4主要在根中表達(dá)。因此,我們推測(cè)BdFAR4可能參與二穗短柄草根中木栓質(zhì)脂肪醇的合成。3.在酵母中異源表達(dá)BdFAR4基因表明,BdFAR4具有編碼脂肪;o酶A的功能。通過(guò)構(gòu)建酵母表達(dá)載體,轉(zhuǎn)化酵母與提取酵母產(chǎn)物檢測(cè)后,我們發(fā)現(xiàn)相比于空載體,轉(zhuǎn)化了目的基因的酵母菌株中合成了鏈長(zhǎng)為C20和C22的脂肪醇。4.在番茄中異源表達(dá)BdFAR4基因表明,轉(zhuǎn)基因番茄T_1代的根中木栓質(zhì)脂肪醇的含量顯著增加,其中以鏈長(zhǎng)為C20和C22的初級(jí)脂肪醇增加最多。與空載體植株相比,轉(zhuǎn)基因植株根中木栓質(zhì)脂肪醇的含量明顯增加了1.4-1.7倍,其中鏈長(zhǎng)為C20的初級(jí)脂肪醇增加了1.3-1.8倍,鏈長(zhǎng)為C22的初級(jí)脂肪醇增加了1.4-1.8倍。綜上結(jié)果表明BdFAR4具有合成木栓質(zhì)脂肪醇的功能,并且主要合成鏈長(zhǎng)為C20和C22的初級(jí)脂肪醇。
【學(xué)位單位】:西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:Q943.2
【部分圖文】:
甲苯胺藍(lán)、熒光黃 88、小蘗堿和蘇丹紅對(duì)含木栓質(zhì)的組織染色,使用熒光顯微鏡可測(cè)到木栓質(zhì)的脂類物質(zhì)、酚類物質(zhì)和其他組成木栓質(zhì)的物質(zhì)(Brundrett et al. 1988)。這些染色技術(shù)我們?cè)谥参锏母、周皮和塊莖部位發(fā)現(xiàn)了木栓質(zhì),但是由于染色技?jí)蜢`敏,在木栓質(zhì)合成的早期以及植物生長(zhǎng)的不同時(shí)期木栓質(zhì)合成較少時(shí)會(huì)存在檢到木栓質(zhì)的情況。例如研究者對(duì)擬南芥發(fā)育后期的種子染色發(fā)現(xiàn)只在種子合點(diǎn)區(qū)域,利用熒光黃 88 染料或蘇丹紅 7B 對(duì)植物(Gyceria maxima)根進(jìn)行染色也沒(méi)有檢測(cè)栓質(zhì)的存在,但是對(duì) Gyceria maxima 木栓質(zhì)進(jìn)行氣相色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀(GC-MS)分析,該植物的根部已經(jīng)形成了較多的脂肪類物質(zhì),使用熒光顯微鏡觀察該植物根的橫發(fā)現(xiàn)酚類物質(zhì)已經(jīng)開(kāi)始沉積(Schreibe, 2007; Beisson et al. 2007; Franke et al. 2009)。透射電子顯微鏡觀察發(fā)現(xiàn),木栓質(zhì)的片層結(jié)構(gòu)呈明暗相間的結(jié)構(gòu),并有研究者發(fā)現(xiàn)質(zhì)的深色帶層與酚類物質(zhì)的含量有關(guān),淺色帶層的厚度與木栓質(zhì)脂類物質(zhì)中的脂肪烷基鏈長(zhǎng)度相關(guān)(Buchala and Ryser; 1996; Bernards, 2002)。有研究發(fā)現(xiàn)在栓皮櫟的根木栓化的過(guò)程中,木栓質(zhì)最早出現(xiàn)在栓皮櫟的內(nèi)皮層凱氏帶中(Machado et al.13)。植物細(xì)胞壁中木栓質(zhì)的分布以及組成木栓質(zhì)的化學(xué)物質(zhì)會(huì)因?yàn)橹参锏陌l(fā)育階及各組織的不同功能而有所差異。
圖 1-2 木栓質(zhì)合成及其運(yùn)輸至細(xì)胞壁的路徑概述(韓雪源和茅林春,2017)Fig.1-2 Overview of the suberin biosynthetic pathway with subsequent transportto the cell wall組成木栓質(zhì)的單體物質(zhì)主要是超長(zhǎng)鏈脂肪酸衍生物(C18-C30)、ω-羥基脂肪酸和α羧酸。因此,木栓質(zhì)生物合成過(guò)程中兩個(gè)重要的步驟是脂肪酸延長(zhǎng)和ω-碳氧化。脂的合成發(fā)生在細(xì)胞質(zhì)體內(nèi),主要由脂肪酸合成酶復(fù)合體(fatty acids synthmplex,FAS)催化合成的,脂肪酸的合成需經(jīng)過(guò)縮合、還原、脫氫和還原四步反應(yīng)。合反應(yīng):在β-酮酰-ACP 合成酶(β-ketoacyl-ACP synthases, KAS)的催化下,酰基-A來(lái)自 2C 供體的丙二酰-ACP(malonyl-ACP)發(fā)生反應(yīng),產(chǎn)生 4C 的中間產(chǎn)物β-酮酰-A)還原反應(yīng):在β-酮酰-ACP 還原酶(β-ketoacyl-ACP reductase, KAR)的作用下,將 4C酮酰-ACP 還原為 4C 的β-羥酰-ACP。(3)脫氫反應(yīng):4C 的β-羥酰-ACP 在β-羥酰-A水酶(β-hydroxyacyl-ACP dehydrase, DH)的催化下脫掉一個(gè)水分子形成 4C 的反式-酰 ACP。(4)還原反應(yīng):在反式-△2-烯酰 ACP 還原酶(trans-△2-enoyl-ACP reductR)作用下,將 4C 的反式-△2-烯酰 ACP 還原為 4C 的;-ACP。這樣每經(jīng)過(guò)一個(gè),就多增加 2 個(gè)碳原子,大概經(jīng)過(guò) 6~7 次循環(huán)后,就形成了 C16或 C18的酰基-AC
第三章 二穗短柄草木栓質(zhì)脂肪醇合成酶基因 BdFAR4 的克隆 白質(zhì)序列,利用 MEGA 6.06 軟件與來(lái)自普通小麥和擬南芥樹(shù)分析。如圖 3-2 所示,這些同源蛋白序列可以分為兩大類白,一類是小麥中的同源蛋白,而二穗短柄草中的 BdFAAR4、BdFAR5 和 BdFAR6 與擬南芥和小麥中的同源基因聚合小麥中的FAR基因聚在一支可能的原因是二穗短柄草和小麥同源關(guān)系較近。由此推測(cè)候選基因 BdFAR1、BdFAR2、BdFFAR6 可能具有合成初級(jí)脂肪醇的功能,可能參與植物根中
【參考文獻(xiàn)】
本文編號(hào):2859001
【學(xué)位單位】:西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:Q943.2
【部分圖文】:
甲苯胺藍(lán)、熒光黃 88、小蘗堿和蘇丹紅對(duì)含木栓質(zhì)的組織染色,使用熒光顯微鏡可測(cè)到木栓質(zhì)的脂類物質(zhì)、酚類物質(zhì)和其他組成木栓質(zhì)的物質(zhì)(Brundrett et al. 1988)。這些染色技術(shù)我們?cè)谥参锏母、周皮和塊莖部位發(fā)現(xiàn)了木栓質(zhì),但是由于染色技?jí)蜢`敏,在木栓質(zhì)合成的早期以及植物生長(zhǎng)的不同時(shí)期木栓質(zhì)合成較少時(shí)會(huì)存在檢到木栓質(zhì)的情況。例如研究者對(duì)擬南芥發(fā)育后期的種子染色發(fā)現(xiàn)只在種子合點(diǎn)區(qū)域,利用熒光黃 88 染料或蘇丹紅 7B 對(duì)植物(Gyceria maxima)根進(jìn)行染色也沒(méi)有檢測(cè)栓質(zhì)的存在,但是對(duì) Gyceria maxima 木栓質(zhì)進(jìn)行氣相色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀(GC-MS)分析,該植物的根部已經(jīng)形成了較多的脂肪類物質(zhì),使用熒光顯微鏡觀察該植物根的橫發(fā)現(xiàn)酚類物質(zhì)已經(jīng)開(kāi)始沉積(Schreibe, 2007; Beisson et al. 2007; Franke et al. 2009)。透射電子顯微鏡觀察發(fā)現(xiàn),木栓質(zhì)的片層結(jié)構(gòu)呈明暗相間的結(jié)構(gòu),并有研究者發(fā)現(xiàn)質(zhì)的深色帶層與酚類物質(zhì)的含量有關(guān),淺色帶層的厚度與木栓質(zhì)脂類物質(zhì)中的脂肪烷基鏈長(zhǎng)度相關(guān)(Buchala and Ryser; 1996; Bernards, 2002)。有研究發(fā)現(xiàn)在栓皮櫟的根木栓化的過(guò)程中,木栓質(zhì)最早出現(xiàn)在栓皮櫟的內(nèi)皮層凱氏帶中(Machado et al.13)。植物細(xì)胞壁中木栓質(zhì)的分布以及組成木栓質(zhì)的化學(xué)物質(zhì)會(huì)因?yàn)橹参锏陌l(fā)育階及各組織的不同功能而有所差異。
圖 1-2 木栓質(zhì)合成及其運(yùn)輸至細(xì)胞壁的路徑概述(韓雪源和茅林春,2017)Fig.1-2 Overview of the suberin biosynthetic pathway with subsequent transportto the cell wall組成木栓質(zhì)的單體物質(zhì)主要是超長(zhǎng)鏈脂肪酸衍生物(C18-C30)、ω-羥基脂肪酸和α羧酸。因此,木栓質(zhì)生物合成過(guò)程中兩個(gè)重要的步驟是脂肪酸延長(zhǎng)和ω-碳氧化。脂的合成發(fā)生在細(xì)胞質(zhì)體內(nèi),主要由脂肪酸合成酶復(fù)合體(fatty acids synthmplex,FAS)催化合成的,脂肪酸的合成需經(jīng)過(guò)縮合、還原、脫氫和還原四步反應(yīng)。合反應(yīng):在β-酮酰-ACP 合成酶(β-ketoacyl-ACP synthases, KAS)的催化下,酰基-A來(lái)自 2C 供體的丙二酰-ACP(malonyl-ACP)發(fā)生反應(yīng),產(chǎn)生 4C 的中間產(chǎn)物β-酮酰-A)還原反應(yīng):在β-酮酰-ACP 還原酶(β-ketoacyl-ACP reductase, KAR)的作用下,將 4C酮酰-ACP 還原為 4C 的β-羥酰-ACP。(3)脫氫反應(yīng):4C 的β-羥酰-ACP 在β-羥酰-A水酶(β-hydroxyacyl-ACP dehydrase, DH)的催化下脫掉一個(gè)水分子形成 4C 的反式-酰 ACP。(4)還原反應(yīng):在反式-△2-烯酰 ACP 還原酶(trans-△2-enoyl-ACP reductR)作用下,將 4C 的反式-△2-烯酰 ACP 還原為 4C 的;-ACP。這樣每經(jīng)過(guò)一個(gè),就多增加 2 個(gè)碳原子,大概經(jīng)過(guò) 6~7 次循環(huán)后,就形成了 C16或 C18的酰基-AC
第三章 二穗短柄草木栓質(zhì)脂肪醇合成酶基因 BdFAR4 的克隆 白質(zhì)序列,利用 MEGA 6.06 軟件與來(lái)自普通小麥和擬南芥樹(shù)分析。如圖 3-2 所示,這些同源蛋白序列可以分為兩大類白,一類是小麥中的同源蛋白,而二穗短柄草中的 BdFAAR4、BdFAR5 和 BdFAR6 與擬南芥和小麥中的同源基因聚合小麥中的FAR基因聚在一支可能的原因是二穗短柄草和小麥同源關(guān)系較近。由此推測(cè)候選基因 BdFAR1、BdFAR2、BdFFAR6 可能具有合成初級(jí)脂肪醇的功能,可能參與植物根中
【參考文獻(xiàn)】
相關(guān)期刊論文 前1條
1 韓雪源;茅林春;;木栓質(zhì)組成成分、組織化學(xué)特性及其生物合成研究進(jìn)展[J];植物學(xué)報(bào);2017年03期
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1 孫瑜琳;小麥葉片和穗表皮蠟質(zhì)組分分析及其相關(guān)合成基因的篩選[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2015年
本文編號(hào):2859001
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