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    百合單萜合成酶基因多態(tài)性研究和功能驗證

    發(fā)布時間:2020-10-27 18:19
       百合的花香層次豐富,不同的類群花香不同。大部分亞洲百合沒有香味;而東方百合香味過于濃烈,很多消費者并不喜歡。所以增加亞洲百合的香味,降低東方百合的香味是百合育種家試圖實現(xiàn)的目標。東方百合中致香的關鍵成分是單萜類物質,所以對百合花香基因的研究主要集中在單萜合成酶基因。單萜類物質成分和含量隨品種不同而不同,為了研究單萜合成酶基因在不同品種百合中的多態(tài)性,本試驗在66個百合品種中克隆百合單萜合成酶基因,一共獲得32個單萜合成酶基因,這些基因可以分為三類:LTPS-a、LTPS-b 和 LTPS-c,在 32 個基因中有 23 個屬于 LTPS-a,2 個屬于 LTPS-b,7個屬于LTPS-c。其中有71.01%的品種中都含有LTPS-a,它的開放閱讀框有1761bp,編碼586個氨基酸·,克隆到的LTPS-b數(shù)量最少,只存在于8.70%的品種中,有12個堿基的插入,它的開放閱讀框有1773bp,編碼590個氨基酸;有36.23%的品種中都含有LTPS-c,它缺失114個堿基,開放閱讀框有1647bp,編碼548個氨基酸。三類單萜合成酶都存在萜類合酶保守域DDxxD和單萜類合酶保守域RRx8W。LTPS-a和LTPS-b存在底物結合保守域RX8H,但LTPS-c不存在此保守域。三類單萜合成合酶中分別有55、8、39個SNPs,LTPS-a的核酸多態(tài)性指數(shù)最大。研究基因多態(tài)性與單萜類物質釋放量的關系發(fā)現(xiàn),第230,873位點的突變和α-蒎烯的釋放量相關性最大,而第99,101,407,1108,1150,1225位點的突變和羅勒烯的釋放量相關性最大。從有香百合O1 1中克隆到三種單萜合成酶基因:LsoTPS-α、LsoTPS-b和LsoTPS-c,無香百合AT6中克隆到兩種單萜合成酶:LrlTPS-a和LrlTPS-c,構建這五個基因的超表達載體,轉化到大腸桿菌中進行表達,誘導后上述五個基因在大腸桿菌中均有表達,但亞洲百合中的LrlTPS-c表達量較低,通過超聲波破碎法提取蛋白用于體外酶活性分析,在蛋白中加入單萜合成酶的底物香葉基焦磷酸(GPP),5個基因均可把GPP轉化為羅勒烯。
    【學位單位】:山西農(nóng)業(yè)大學
    【學位級別】:碩士
    【學位年份】:2018
    【中圖分類】:S682.29
    【部分圖文】:

    電泳圖,電泳圖,合成酶基因


    2.2.1總RNA的提取??利用Tnzol裂解液提。叮秱百合品種盛丌期花瓣的總RNA,。催策M行瓊脂糖??凝膠電泳以檢測其質量,通過生物光度il檢測總含鼠和質■^圖2顯示A3、A5、A6??和A7的RNA電泳圖,表明提取的RNA既無降解、也尤污染。??氣爭i?i?丨??、養(yǎng)一雙,善要-.辱?1000???sec??.'t??圖2?A3、?A5、?A6?#卩A7總RNA電泳圖??Fig.?2?Electrophoresis?pattern?of?RNAs?in?A3,?A5,?A6?and?A7??2.2.2單萜合成酶基因序列分析??以反轉錄得到的cDNA為模板進行PCR擴增,在66個品種中都得到一條1700bp??左右的片段,將此片段進行克隆測序獲得序列信息。66個百合品種中一共得到32個單??萜合成酶基因可分為三個類型,命名為LTPS-a、LTPS-b、LTPS-c(圖3)。LTPS-a型序列??有23個,LTPS-b型序列有2個,LTPS-c型序列有7個。這32個基因可以翻譯成23??個蛋白

    序列,合成酶基因,單萜,系統(tǒng)發(fā)育樹


    以反轉錄得到的cDNA為模板進行PCR擴增,在66個品種中都得到一條1700bp??左右的片段,將此片段進行克隆測序獲得序列信息。66個百合品種中一共得到32個單??萜合成酶基因可分為三個類型,命名為LTPS-a、LTPS-b、LTPS-c(圖3)。LTPS-a型序列??有23個,LTPS-b型序列有2個,LTPS-c型序列有7個。這32個基因可以翻譯成23??個蛋白,LTPS-a型蛋白有14個,LTPS-b型蛋白有2個,LTPS-c型蛋白有7個,將這??些基因序列提交NCBI,得到登錄號(表5)。這三種LTPS基因在不同百合雜種系的??分布也不同,如表6所示,LTPS-b在所有品種中的分布是最少的(占品種數(shù)的8.70%),??只在六個品種中發(fā)現(xiàn)它,喇東百合、亞喇百合、麝東百合中均未克隆得到LTPS-b;?LTPS-a??在所有品種中的分布是最廣泛的,分布于76.81%的品種中;LTPS-c的分布范圍居中,??分布于26.09%的品種中。-些百合品種中同時克隆到2到3種單萜合成酶基因,例如:??A3、A8、AT6、Tl、0T13?和?OT16?都含有?LTPS-a?和?LTPS-c。N1?含有?LTPS-a?和?LTPS-b

    示意圖,百合,單萜,合成酶基因


    圈6嚷|邦百合單萜合成酶越閃第:?:到第四個外顯+的局部示意圖??Fig.?6?Diagram?depicting?the?exon3?to?exon4?oi'?Li/ium?monotei-pene?sythase?gene??
    【參考文獻】

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