百合單萜合成酶基因多態(tài)性研究和功能驗(yàn)證
【學(xué)位單位】:山西農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:S682.29
【部分圖文】:
2.2.1總RNA的提取??利用Tnzol裂解液提。叮秱(gè)百合品種盛丌期花瓣的總RNA,。催策M(jìn)行瓊脂糖??凝膠電泳以檢測其質(zhì)量,通過生物光度il檢測總含鼠和質(zhì)■^圖2顯示A3、A5、A6??和A7的RNA電泳圖,表明提取的RNA既無降解、也尤污染。??氣爭i?i?丨??、養(yǎng)一雙,善要-.辱?1000???sec??.'t??圖2?A3、?A5、?A6?#卩A7總RNA電泳圖??Fig.?2?Electrophoresis?pattern?of?RNAs?in?A3,?A5,?A6?and?A7??2.2.2單萜合成酶基因序列分析??以反轉(zhuǎn)錄得到的cDNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,在66個(gè)品種中都得到一條1700bp??左右的片段,將此片段進(jìn)行克隆測序獲得序列信息。66個(gè)百合品種中一共得到32個(gè)單??萜合成酶基因可分為三個(gè)類型,命名為LTPS-a、LTPS-b、LTPS-c(圖3)。LTPS-a型序列??有23個(gè),LTPS-b型序列有2個(gè),LTPS-c型序列有7個(gè)。這32個(gè)基因可以翻譯成23??個(gè)蛋白
以反轉(zhuǎn)錄得到的cDNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,在66個(gè)品種中都得到一條1700bp??左右的片段,將此片段進(jìn)行克隆測序獲得序列信息。66個(gè)百合品種中一共得到32個(gè)單??萜合成酶基因可分為三個(gè)類型,命名為LTPS-a、LTPS-b、LTPS-c(圖3)。LTPS-a型序列??有23個(gè),LTPS-b型序列有2個(gè),LTPS-c型序列有7個(gè)。這32個(gè)基因可以翻譯成23??個(gè)蛋白,LTPS-a型蛋白有14個(gè),LTPS-b型蛋白有2個(gè),LTPS-c型蛋白有7個(gè),將這??些基因序列提交NCBI,得到登錄號(表5)。這三種LTPS基因在不同百合雜種系的??分布也不同,如表6所示,LTPS-b在所有品種中的分布是最少的(占品種數(shù)的8.70%),??只在六個(gè)品種中發(fā)現(xiàn)它,喇東百合、亞喇百合、麝東百合中均未克隆得到LTPS-b;?LTPS-a??在所有品種中的分布是最廣泛的,分布于76.81%的品種中;LTPS-c的分布范圍居中,??分布于26.09%的品種中。-些百合品種中同時(shí)克隆到2到3種單萜合成酶基因,例如:??A3、A8、AT6、Tl、0T13?和?OT16?都含有?LTPS-a?和?LTPS-c。N1?含有?LTPS-a?和?LTPS-b
圈6嚷|邦百合單萜合成酶越閃第:?:到第四個(gè)外顯+的局部示意圖??Fig.?6?Diagram?depicting?the?exon3?to?exon4?oi'?Li/ium?monotei-pene?sythase?gene??
【參考文獻(xiàn)】
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本文編號:2858876
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