越來越多的證據(jù)表明,在癌癥的發(fā)展和進展中,BAP1起到了關鍵作用,但是目前對BAP1基因表達的調(diào)控機制尚不清楚。G-四鏈體是富含串聯(lián)重復鳥嘌呤的DNA或RNA組成的二級結(jié)構(gòu)。由氫鍵連接的四個鳥嘌呤形成環(huán)狀平面G-四分體,三個或更多G-四分體堆疊形成了 G-四鏈體。大量的研究表明,G-四鏈體結(jié)構(gòu)在腫瘤發(fā)生過程中起著重要的調(diào)節(jié)作用,因此,G-四鏈體結(jié)構(gòu)和相關的解旋酶在癌癥治療中是一個新的探索領域。在本論文中,我們發(fā)現(xiàn)BAP1啟動子區(qū)域反義鏈上包含多個串聯(lián)的鳥嘌呤以及重復序列,這些序列具有很高的形成G-四鏈體結(jié)構(gòu)的可能性。我們根據(jù)BAP1啟動子反義鏈的鳥嘌呤富集區(qū)域序列合成了寡核苷酸鏈,在圓二色性光譜分析研究中,這些序列顯示了 G-四鏈體結(jié)構(gòu)特征吸收峰,進一步的分析也揭示了它們可以形成多種G-四鏈體結(jié)構(gòu)。在報告載體研究中,BAP1啟動子中預測G-四鏈體結(jié)構(gòu)形成序列的突變或刪除會降低報告載體的表達,顯示G-四鏈體的存在促進了 BAP1基因表達。與此相符,具有DNA解旋酶活性的染色質(zhì)重塑蛋白CHD2和CHD7與BAP1啟動子結(jié)合并可能消除G4-四鏈體結(jié)構(gòu)以抑制BAP1基因表達。總之,BAP1啟動子反義鏈上包含了可以形成G-四鏈體結(jié)構(gòu)的序列,這些G-四鏈體結(jié)構(gòu)促進BAP1基因的表達,而DNA解旋酶CHD2和CHD7可能通過解開這些G-四鏈體來抑制BAP1基因表達。
【學位單位】：東北林業(yè)大學
【學位級別】：碩士
【學位年份】：2018
【中圖分類】：Q78
【部分圖文】：

Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎａｌ?Ｓｔａｒｔ?Ｓｉｔｅ，在圖?３－１?中標注為＋１）上游?１０００?ｂｐ?減基序列中?Ｇ／Ｃ??百分含量達到６９．７％，而在轉(zhuǎn)錄起始位點上游的２００?ｂｐ堿基序列胞嘧啶與鳥嘌呤的含量??中更是高達７９．０％?（見圖３－１）。??屬一－?———￣■—?Ｐｒｏｍｏｔｅｒ?———?．＿．－５’－ＵＴＲ?爹??ＴＳＳ??－１０００?－８００?－６００?－４００?－２００?－１，＋１?＋２２７??．；??６９．７％?７９．０％，??（Ｇ／Ｃ?ｃｏｎｔｅｎｔ）??圖３－１?ＢＡＰ１基因ＴＳＳ上游啟動子區(qū)Ｇ／Ｃ含量分析，ＴＳＳ表示轉(zhuǎn)錄起始位點??Ｇ－四鏈體結(jié)構(gòu)在基因啟動子區(qū)域的正義鏈或反義鏈中均能夠形成。當我們觀察??ＢＡＰ１啟動子區(qū)時，顯然可以發(fā)現(xiàn)序列中含有很多連續(xù)的胞嘧啶分布在其中，從而其反??義鏈相應區(qū)域形成了保守的核苷酸序列模塊（Ｇ２３－Ｎ１－７－Ｇ２３－Ｎ１－７－Ｇ２３－Ｎ１－７－Ｇ２３?），該??序列模型即為形成Ｇ－四鏈體的保守序列。尤其是在該區(qū)域內(nèi)，在ＴＳＳ上游２００?ｂｐ序列??內(nèi)，僅僅胞嘧啶含量就占有６２．５％?（見圖３－２）。因此，僅僅通過ＤＮＡ序列的特征來??看

在預測Ｇ－四鏈體結(jié)構(gòu)中有很多種算法，在這里，我們利用了一種稱為ＱＧＲＳ??Ｍａｐｐｅｒ的在線預測算法來分析ＢＡＰ１基因的啟動子序列［８６］。從分析結(jié)果中我們發(fā)現(xiàn)，??在其反義鏈上有數(shù)個連續(xù)的鳥嘌呤簇的得分超過４０?（見圖３－３），而己知能夠形成穩(wěn)定??Ｇ－四鏈體結(jié)構(gòu)的ＭＹＣ啟動子內(nèi)鳥嘌呤富集序列得分為４２分。而有趣的一點是，在??ＢＡＰ１啟動子中，一些具有高分，即具有比較高潛能形成Ｇ－四鏈體的序列是重復出現(xiàn)??的

?？Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ??ＴＳＳ??圖３－２?ＢＡＰ１基因ＴＳＳ上游啟動子區(qū)序列??３．１．２利用ＱＧＲＳ?Ｍａｐｐｅｒ預測Ｇ－四鏈體??在預測Ｇ－四鏈體結(jié)構(gòu)中有很多種算法，在這里，我們利用了一種稱為ＱＧＲＳ??Ｍａｐｐｅｒ的在線預測算法來分析ＢＡＰ１基因的啟動子序列［８６］。從分析結(jié)果中我們發(fā)現(xiàn)，??在其反義鏈上有數(shù)個連續(xù)的鳥嘌呤簇的得分超過４０?（見圖３－３），而己知能夠形成穩(wěn)定??Ｇ－四鏈體結(jié)構(gòu)的ＭＹＣ啟動子內(nèi)鳥嘌呤富集序列得分為４２分。而有趣的一點是，在??ＢＡＰ１啟動子中，一些具有高分，即具有比較高潛能形成Ｇ－四鏈體的序列是重復出現(xiàn)??的
【相似文獻】

相關期刊論文 前10條

1 高娟;袁谷;徐明;;G-四鏈體結(jié)構(gòu)的檢測、功能及調(diào)控[J];生理科學進展;2014年05期

2 吉妍娟;陳興來;劉晶華;;研究G-四鏈體與其配體相互作用的技術(shù)方法概述[J];浙江化工;2013年06期

3 孔德明;楊薇;;G-四鏈體的構(gòu)型、熱穩(wěn)定性測試及其在鉀離子定量檢測中的應用[J];化學通報;2010年05期

4 殷菲,劉建輝,彭孝軍;以G-四鏈體為靶點的小分子端粒酶抑制劑研究進展[J];化學通報;2004年04期

5 孫紅霞;向俊鋒;張亞周;徐廣智;徐樑華;唐亞林;;光譜法研究G-四鏈體與亞甲藍的相互作用[J];科學通報;2006年09期

6 常天俊;李剛;李衛(wèi)國;;G-四鏈體核酸的生物學功能[J];生命的化學;2014年03期

7 段娜娜;王娜;楊薇;孔德明;;利用對G-四鏈體環(huán)部的構(gòu)型調(diào)節(jié)進行傳感器的設計[J];分析化學;2014年10期

8 覃江克;楊政敏;蘭文麗;唐煌;蘇桂發(fā);高石花;;口占噸酮衍生物的合成及與G-四鏈體作用的研究[J];廣西師范大學學報(自然科學版);2009年04期

9 郭曉強;;G-四鏈體:核酸的“新”結(jié)構(gòu)[J];生命的化學;2014年04期

10 張弛;吳偉彬;盧宇靖;古練權(quán);黃志紓;;吲哚并喹啉衍生物與G-四鏈體相互作用的分子模擬研究[J];化學學報;2008年08期

相關博士學位論文 前10條

1 高亞婷;若干小分子對大分子構(gòu)象影響的研究[D];中國科學技術(shù)大學;2018年

2 高尚;G-四鏈體結(jié)構(gòu)的質(zhì)譜光譜性質(zhì)研究[D];吉林大學;2016年

3 郝潤;幾種原小檗堿類生物堿與G-四鏈體結(jié)構(gòu)相互作用的研究[D];北京工業(yè)大學;2014年

4 黃靜;苯并咪唑?qū)四鏈體的調(diào)控和抗癌活性研究及可視化方法檢測G四鏈體[D];武漢大學;2010年

5 李明輝;G-四鏈體的三維結(jié)構(gòu)及其與小分子相互作用的理論研究[D];吉林大學;2010年

6 劉婷婷;基于G-四鏈體為靶點的五種民族藥用植物有效成分篩選和研究[D];中央民族大學;2016年

7 章丹;基于不同DNA序列形成的G-四鏈體結(jié)構(gòu)無標記檢測多種金屬離子[D];武漢大學;2011年

8 羅旭健;靶向端粒G-四鏈體DNA的抗腫瘤鉑化合物的合成、表征及其作用機理研究[D];中南大學;2014年

9 王立華;靶向四鏈體DNAs鄰菲羅啉衍生物的設計合成及生物活性研究[D];山西大學;2013年

10 李錦蓮;有機配體靶向DNA G-四鏈體的分子模擬研究[D];延邊大學;2011年

相關碩士學位論文 前10條

1 李盈舟;BAP1基因啟動子區(qū)G-四鏈體的結(jié)構(gòu)鑒定及其對基因表達調(diào)控的研究[D];東北林業(yè)大學;2018年

2 丁婕琴;基于c-MYC G-四鏈體結(jié)構(gòu)發(fā)現(xiàn)高選擇性探針及其動力學機識別制研究[D];華中農(nóng)業(yè)大學;2018年

3 孫鑫;靶向核酸高級結(jié)構(gòu)的熒光探針設計合成及應用研究[D];華北理工大學;2018年

4 李子奇;選擇性結(jié)合雙倍體G-四鏈體DNA的化合物的合成與活性研究[D];南方醫(yī)科大學;2018年

5 曾智萍;芳烴釕化合物的抗腫瘤作用機制研究[D];廣東藥科大學;2018年

6 張立娜;具有不同聚集趨勢的水溶性陽離子卟啉對不同pH條件下G-四鏈體識別能力的研究[D];天津大學;2017年

7 趙婷婷;應用ABEEMσπ極化力場研究G-四鏈體水溶液下的結(jié)構(gòu)及性質(zhì)[D];遼寧師范大學;2018年

8 孫紅霞;G-四鏈體與抗腫瘤藥物小分子相互作用機理的研究[D];北京化工大學;2006年

9 吳彬;分子擁擠條件下陽離子卟啉對G-四鏈體的識別和穩(wěn)定[D];天津大學;2013年

10 郭俊紅;三苯甲烷類染料與G-四鏈體的作用及其應用[D];南開大學;2010年

本文編號：2844434