MC4R基因多態(tài)性與廣州市中小學(xué)生肥胖的關(guān)聯(lián)性研究
【學(xué)位單位】:廣東藥科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類(lèi)】:R723.14
【部分圖文】:
廣東藥科大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文Polymerase Chain Reaction, QRT PCR)技術(shù),其基本原理為(如圖 2.1 所示):TaqMan 探針是一段寡核苷酸序列,該序列完整時(shí),分別位于 5’和 3’端的熒光報(bào)告基團(tuán)(Report group)R 和熒光淬滅基團(tuán)(Quencher group)Q 將會(huì)發(fā)生反應(yīng),淬滅基團(tuán) Q 將會(huì)吸收?qǐng)?bào)告基團(tuán) R 發(fā)出的熒光,從而配備的儀器無(wú)法檢測(cè)識(shí)別出熒光信號(hào);當(dāng)進(jìn)行 PCR 擴(kuò)增時(shí),Taq 酶就會(huì)發(fā)揮其 5’-3’核酸外切酶的活性將探針?biāo)饧羟校藭r(shí)兩個(gè)作用基團(tuán)就會(huì)分開(kāi),熒光檢測(cè)設(shè)備就可以檢測(cè)到 R 所發(fā)出的熒光信號(hào),而 R 有兩種類(lèi)型,一類(lèi)是 VIC 報(bào)告基團(tuán)(標(biāo)記突變等位基因),另一類(lèi)是 FAM 基團(tuán)(標(biāo)記野生等位基因)。利用 PCR 產(chǎn)物與累積熒光信號(hào)呈正比的關(guān)系,從而實(shí)現(xiàn)定量分析 PCR 產(chǎn)物的目的。而通過(guò)儀器和相應(yīng)分析軟件識(shí)別的不同熒光信號(hào)來(lái)判斷個(gè)體所屬基因型。
廣東藥科大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文(3) 分型實(shí)驗(yàn)的質(zhì)量控制對(duì) SNPs 進(jìn)行基因分型時(shí),在每個(gè) 384 孔板中均隨機(jī)設(shè)置 2 個(gè)重復(fù)樣本和 2個(gè)空白對(duì)照,以驗(yàn)證分型結(jié)果的可靠性,重復(fù)樣本分型一致率應(yīng)達(dá)到 100%。對(duì)于分型結(jié)果不明顯的樣本需再次重復(fù)實(shí)驗(yàn),若結(jié)果仍不明顯則將其剔除。Taqman探針需特別注意避光、冷藏保存,盡量避免因探針問(wèn)題而影響基因分型的效果。(4) 分型結(jié)果的解讀首先通過(guò) 7900HT 型實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 儀來(lái)檢測(cè)不同的熒光信號(hào),然后采用 SDS 2.4 圖像分析軟件來(lái)對(duì)不同的熒光信號(hào)進(jìn)行分析解讀,對(duì)位點(diǎn)等位基因?qū)崿F(xiàn)自動(dòng)分型,可以得到如下的等位基因分型散點(diǎn)圖(圖 2.2)。由圖可以確定研究樣本的基因型(野生純合子、雜合子以及突變純合子)。
圖 3.1 MC4R 基因各位點(diǎn)的連鎖不平衡程度 D'值(左側(cè))和 r2值(右側(cè))應(yīng)用 PHASE 2.1 軟件構(gòu)建 MC4R 的 rs17782313 和 rs12970134 兩位點(diǎn)的單體型。共有 TG、TA、CG、CA 四種單體型,它們?cè)谌巳褐械念l率分別為 80.51%、1.51%、2.36%和 15.62%。其中 TG 單體型的人群頻率最高。在后續(xù)單體型與肥胖的關(guān)聯(lián)分析中,由于 TA 和 CG 單體型頻率均低于 3%,因此都劃分為其他類(lèi)進(jìn)行分析。單體型與中小學(xué)生肥胖風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)聯(lián)分析結(jié)果表明:以 TG 為參照單體型,CA單體型與中小學(xué)生肥胖風(fēng)險(xiǎn)增加有統(tǒng)計(jì)學(xué)關(guān)聯(lián)(OR=1.26,95% CI=1.06-1.51,P=0.011);而其他類(lèi)(TA+CG)單體型也與中小學(xué)生肥胖發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)增加有統(tǒng)計(jì)學(xué)關(guān)聯(lián)(OR=1.65,95% CI=1.17-2.33,P=0.005)。經(jīng)協(xié)變量年級(jí)、性別、食欲、進(jìn)餐時(shí)間及上學(xué)日視屏?xí)r間調(diào)整后,CA、其他類(lèi)(TA+CG)單體型仍與中小學(xué)生肥胖高風(fēng)險(xiǎn)性之間存在統(tǒng)計(jì)學(xué)關(guān)聯(lián)(OR=1.25,95% CI=1.04-1.51,P=0.019;OR=1.61,95% CI=1.12-2.31,P=0.010)。詳見(jiàn)表 3.7。表3.7 MC4R 基因 2 個(gè)位點(diǎn)的單體型與中小學(xué)生肥胖風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)聯(lián)分析
【參考文獻(xiàn)】
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本文編號(hào):2841457
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