MC4R基因多態(tài)性與廣州市中小學生肥胖的關(guān)聯(lián)性研究
【學位單位】:廣東藥科大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2018
【中圖分類】:R723.14
【部分圖文】:
廣東藥科大學碩士研究生學位論文Polymerase Chain Reaction, QRT PCR)技術(shù),其基本原理為(如圖 2.1 所示):TaqMan 探針是一段寡核苷酸序列,該序列完整時,分別位于 5’和 3’端的熒光報告基團(Report group)R 和熒光淬滅基團(Quencher group)Q 將會發(fā)生反應(yīng),淬滅基團 Q 將會吸收報告基團 R 發(fā)出的熒光,從而配備的儀器無法檢測識別出熒光信號;當進行 PCR 擴增時,Taq 酶就會發(fā)揮其 5’-3’核酸外切酶的活性將探針水解剪切,此時兩個作用基團就會分開,熒光檢測設(shè)備就可以檢測到 R 所發(fā)出的熒光信號,而 R 有兩種類型,一類是 VIC 報告基團(標記突變等位基因),另一類是 FAM 基團(標記野生等位基因)。利用 PCR 產(chǎn)物與累積熒光信號呈正比的關(guān)系,從而實現(xiàn)定量分析 PCR 產(chǎn)物的目的。而通過儀器和相應(yīng)分析軟件識別的不同熒光信號來判斷個體所屬基因型。
廣東藥科大學碩士研究生學位論文(3) 分型實驗的質(zhì)量控制對 SNPs 進行基因分型時,在每個 384 孔板中均隨機設(shè)置 2 個重復(fù)樣本和 2個空白對照,以驗證分型結(jié)果的可靠性,重復(fù)樣本分型一致率應(yīng)達到 100%。對于分型結(jié)果不明顯的樣本需再次重復(fù)實驗,若結(jié)果仍不明顯則將其剔除。Taqman探針需特別注意避光、冷藏保存,盡量避免因探針問題而影響基因分型的效果。(4) 分型結(jié)果的解讀首先通過 7900HT 型實時熒光定量 PCR 儀來檢測不同的熒光信號,然后采用 SDS 2.4 圖像分析軟件來對不同的熒光信號進行分析解讀,對位點等位基因?qū)崿F(xiàn)自動分型,可以得到如下的等位基因分型散點圖(圖 2.2)。由圖可以確定研究樣本的基因型(野生純合子、雜合子以及突變純合子)。
圖 3.1 MC4R 基因各位點的連鎖不平衡程度 D'值(左側(cè))和 r2值(右側(cè))應(yīng)用 PHASE 2.1 軟件構(gòu)建 MC4R 的 rs17782313 和 rs12970134 兩位點的單體型。共有 TG、TA、CG、CA 四種單體型,它們在人群中的頻率分別為 80.51%、1.51%、2.36%和 15.62%。其中 TG 單體型的人群頻率最高。在后續(xù)單體型與肥胖的關(guān)聯(lián)分析中,由于 TA 和 CG 單體型頻率均低于 3%,因此都劃分為其他類進行分析。單體型與中小學生肥胖風險的關(guān)聯(lián)分析結(jié)果表明:以 TG 為參照單體型,CA單體型與中小學生肥胖風險增加有統(tǒng)計學關(guān)聯(lián)(OR=1.26,95% CI=1.06-1.51,P=0.011);而其他類(TA+CG)單體型也與中小學生肥胖發(fā)生風險增加有統(tǒng)計學關(guān)聯(lián)(OR=1.65,95% CI=1.17-2.33,P=0.005)。經(jīng)協(xié)變量年級、性別、食欲、進餐時間及上學日視屏時間調(diào)整后,CA、其他類(TA+CG)單體型仍與中小學生肥胖高風險性之間存在統(tǒng)計學關(guān)聯(lián)(OR=1.25,95% CI=1.04-1.51,P=0.019;OR=1.61,95% CI=1.12-2.31,P=0.010)。詳見表 3.7。表3.7 MC4R 基因 2 個位點的單體型與中小學生肥胖風險的關(guān)聯(lián)分析
【參考文獻】
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本文編號:2841457
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