梨小食心蟲中腸氨肽酶N3(GmolAPN3)基因的克
【學(xué)位單位】:西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:S433
【部分圖文】:
2.3 梨小食心蟲 GmolAPN3 蛋白的分段原核表達(dá)2.3.1 梨小食心蟲中腸組織的收集、RNA 的提取以及 cDNA 第一鏈的合成方法同 2.2.1,2.2.2,2.2.32.3.2 GmolAPN3 基因片段引物的設(shè)計(jì)根據(jù)梨小食心蟲 GmolAPN3 氨基酸序列的結(jié)構(gòu)特點(diǎn),將 GmolAPN3 分成以下 4 個(gè)部分,其中需要去掉 N-端的信號(hào)肽序列,C-端的 GPI 錨定序列,根據(jù)氨基酸片段尋找對(duì)應(yīng)的基因序列并設(shè)計(jì)分段克隆的引物。
圖 3.1 梨小食心蟲中腸 RNA 瓊脂糖凝膠電泳Fig. 3.1 Agarose gel electrophoresis of RNA from midgut of Grapholith 提取的梨小食心蟲中腸 RNA 經(jīng)過(guò) 1%的瓊脂糖凝膠電泳檢 5S 三條帶且 28S 及 18S 條帶清晰(圖 3.1),表明所提取的 1.9-2.0 之間,所提取 RNA 的完整性及純度已達(dá)到反轉(zhuǎn)錄
圖 3.4 GluZincin superfamily Aminopeptidase N domain(A)、ERAP1-like C-terminal domain(B)和 GmolAPN3(C)的三維結(jié)構(gòu)Fig. 3.4 The 3D structure of GluZincin superfamily Aminopeptidase N domain(A),ERAP1-like C-terminal domain(B)and GmolAPN3(C)紅色: GluZincin superfamily Aminopeptidase N domain; 藍(lán)色: ERAP1-like C-terminal domain; 綠色:鋅結(jié)合位點(diǎn); 黑色: 其他部分.Red: GluZincin superfamily Aminopeptidase N domain; Blue: ERAP1-like C-terminal domain; Green:Zinc binding site; Black: Other parts.結(jié)構(gòu)域分析表明,GmolAPN3 氨肽酶含有 GluZincin superfamily Aminopeptidase Ndomain(66—537 位氨基酸)和 ERAP1-like C-terminal domain(609-912 位氨基酸)2 個(gè)保守結(jié)構(gòu)域(圖 3.3),并且在 GluZincin superfamily Aminopeptidase N domain 的第373—396 位氨基酸處有鋅指結(jié)構(gòu)373HEXXH(X)18E396,是酶的活性位點(diǎn)。三維結(jié)構(gòu)模型(圖3.4)顯示,在 GluZincin superfamily Aminopeptidase N domain 富含 α 螺旋和 β 折疊(圖3.4: A);如圖 3.4: B 所示,ERAP1-like C-terminal domain 主要由 16 個(gè) α 螺旋組成了 8
【參考文獻(xiàn)】
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本文編號(hào):2840928
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