【摘要】：突觸小泡相關(guān)膜蛋白1基因(VAMP1)的變異是導(dǎo)致鼠類對D型肉毒梭毒素滅鼠劑產(chǎn)生抗性的主要原因。本研究利用轉(zhuǎn)錄組測序的方法,分析青藏高原地區(qū)5種主要害鼠:高原鼠兔(Ochotona curzoniae)、高原鼢鼠(Eospalax baileyi)、長尾倉鼠(Cricetulus longicaudatus)、青海松田鼠(Neodon fuscus)和喜馬拉雅旱獺(Marmota himalayana)的VAMP1序列信息。同時,分別采集來自5個地理種群的58只高原鼠兔和59只高原鼢鼠,對VAMP1基因第二外顯子區(qū)序列進行分析。結(jié)果顯示,從轉(zhuǎn)錄組組裝文件中成功獲得5種動物的VAMP1基因全序列,長度均為357 bp,共檢測到46個核苷酸變異位點和4個氨基酸變異位點,但未發(fā)現(xiàn)與D型肉毒素抗性相關(guān)的氨基酸位點。對高原鼠兔群體和高原鼢鼠群體的VAMP1基因第二外顯子序列的分析顯示,高原鼠兔所有個體的序列高度保守,而在高原鼢鼠中則存在一個同義突變位點,但兩物種在D型肉毒素抗性相關(guān)位點上都未監(jiān)測出位點變異。該研究結(jié)果提示,D型肉毒殺鼠劑在青藏高原地區(qū)害鼠防治方面應(yīng)該可以長期發(fā)揮重要作用。
【圖文】：

·46·動物學(xué)雜志ChineseJournalofZoology52卷表2本研究中5種害鼠及豚鼠、小鼠VAMP1基因編碼區(qū)DNA序列（上三角）和氨基酸序列（下三角）相似度(%)Table2Similarity(%)amongDNAsequences(uppertriangular)andaminoacidsequences(lowertriangular)ofVAMP1codingsequenceoffiverodentsfromtheQinghai-TibetPlateauaswellasMouseandGuineaPig物種Species12345671小鼠Musmusculus93.692.293.693.092.791.62豚鼠Caviaporcellus10093.895.094.193.393.83高原鼠兔Ochotonacurzoniae10010010010099.297.54高原鼢鼠Eospalaxbaileyi10010093.810099.294.75長尾倉鼠Cricetuluslongicaudatus10010092.795.599.293.66青海松田鼠Neodonfuscus99.299.292.494.796.692.77喜馬拉雅旱獺Marmotahimalayana97.597.592.797.597.596.6圖1青藏高原5種害鼠及小鼠、豚鼠VAMP1氨基酸序列變異位點分布Fig.1VariablesitesdistributionofVAMP1aminoacidsequencesoffivespeciesofrodentsendemictotheQinghai-TibetPlateauaswellasMouseandGuineaPig序列中的點表示與小鼠序列相同。Thedotsshowidentitiestomouse.序列校對和拼接，得到完整的VAMP1基因第二外顯子序列，比對后的全長為159bp。序列分析顯示，高原鼠兔第二外顯子DNA序列在所有個體之間都無變異，而高原鼢鼠在第二外顯子的30號位點（對應(yīng)于基因編碼區(qū)全序列的159號位點）上出現(xiàn)C/T單核苷酸多態(tài)性，經(jīng)翻譯確認(rèn)為同義突變。在所采集的個體中，來自祁連縣八寶鎮(zhèn)所有個體都為胸腺嘧啶（T），而來自澤庫縣巴灘牧場和稱多縣稱文鎮(zhèn)所有個體都為胞嘧啶（C），其余在兩個種群中，3種

·46·動物學(xué)雜志ChineseJournalofZoology52卷表2本研究中5種害鼠及豚鼠、小鼠VAMP1基因編碼區(qū)DNA序列（上三角）和氨基酸序列（下三角）相似度(%)Table2Similarity(%)amongDNAsequences(uppertriangular)andaminoacidsequences(lowertriangular)ofVAMP1codingsequenceoffiverodentsfromtheQinghai-TibetPlateauaswellasMouseandGuineaPig物種Species12345671小鼠Musmusculus93.692.293.693.092.791.62豚鼠Caviaporcellus10093.895.094.193.393.83高原鼠兔Ochotonacurzoniae10010010010099.297.54高原鼢鼠Eospalaxbaileyi10010093.810099.294.75長尾倉鼠Cricetuluslongicaudatus10010092.795.599.293.66青海松田鼠Neodonfuscus99.299.292.494.796.692.77喜馬拉雅旱獺Marmotahimalayana97.597.592.797.597.596.6圖1青藏高原5種害鼠及小鼠、豚鼠VAMP1氨基酸序列變異位點分布Fig.1VariablesitesdistributionofVAMP1aminoacidsequencesoffivespeciesofrodentsendemictotheQinghai-TibetPlateauaswellasMouseandGuineaPig序列中的點表示與小鼠序列相同。Thedotsshowidentitiestomouse.序列校對和拼接，得到完整的VAMP1基因第二外顯子序列，比對后的全長為159bp。序列分析顯示，高原鼠兔第二外顯子DNA序列在所有個體之間都無變異，而高原鼢鼠在第二外顯子的30號位點（對應(yīng)于基因編碼區(qū)全序列的159號位點）上出現(xiàn)C/T單核苷酸多態(tài)性，經(jīng)翻譯確認(rèn)為同義突變。在所采集的個體中，來自祁連縣八寶鎮(zhèn)所有個體都為胸腺嘧啶（T），而來自澤庫縣巴灘牧場和稱多縣稱文鎮(zhèn)所有個體都為胞嘧啶（C），其余在兩個種群中，3種

·46·動物學(xué)雜志ChineseJournalofZoology52卷表2本研究中5種害鼠及豚鼠、小鼠VAMP1基因編碼區(qū)DNA序列（上三角）和氨基酸序列（下三角）相似度(%)Table2Similarity(%)amongDNAsequences(uppertriangular)andaminoacidsequences(lowertriangular)ofVAMP1codingsequenceoffiverodentsfromtheQinghai-TibetPlateauaswellasMouseandGuineaPig物種Species12345671小鼠Musmusculus93.692.293.693.092.791.62豚鼠Caviaporcellus10093.895.094.193.393.83高原鼠兔Ochotonacurzoniae10010010010099.297.54高原鼢鼠Eospalaxbaileyi10010093.810099.294.75長尾倉鼠Cricetuluslongicaudatus10010092.795.599.293.66青海松田鼠Neodonfuscus99.299.292.494.796.692.77喜馬拉雅旱獺Marmotahimalayana97.597.592.797.597.596.6圖1青藏高原5種害鼠及小鼠、豚鼠VAMP1氨基酸序列變異位點分布Fig.1VariablesitesdistributionofVAMP1aminoacidsequencesoffivespeciesofrodentsendemictotheQinghai-TibetPlateauaswellasMouseandGuineaPig序列中的點表示與小鼠序列相同。Thedotsshowidentitiestomouse.序列校對和拼接，得到完整的VAMP1基因第二外顯子序列，比對后的全長為159bp。序列分析顯示，高原鼠兔第二外顯子DNA序列在所有個體之間都無變異，而高原鼢鼠在第二外顯子的30號位點（對應(yīng)于基因編碼區(qū)全序列的159號位點）上出現(xiàn)C/T單核苷酸多態(tài)性，經(jīng)翻譯確認(rèn)為同義突變。在所采集的個體中，來自祁連縣八寶鎮(zhèn)所有個體都為胸腺嘧啶（T），而來自澤庫縣巴灘牧場和稱多縣稱文鎮(zhèn)所有個體都為胞嘧啶（C），其余在兩個種群中，3種

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