海島棉資源材料枯萎病抗性分析及抗枯萎病性相關(guān)基因的篩選
發(fā)布時間:2020-08-28 18:13
本研究在2014年和2015年對80份海島棉資源材料進行了枯萎病抗性調(diào)查,并對病指數(shù)據(jù)和產(chǎn)量數(shù)據(jù)進行兩年的雙因素方差分析和相關(guān)性分析。同時,在室內(nèi)進行了以06-146為父本、新海14為母本的RIL系后代中挑選出的高抗、中抗、感病、易感的10893、10895、10897、10796和父母本共6份材料的枯萎病菌誘導試驗,在接菌40小時后,取下胚軸提取RNA。通過查閱文獻和轉(zhuǎn)錄組測序,獲得與棉花枯萎病抗性相關(guān)基因或EST序列,設(shè)計引物,利用提取到的RNA進行q-PCR技術(shù),對海島棉的抗、感材料進行基因表達特性分析。得出的結(jié)論如下:1.通過兩年的田間調(diào)查,根據(jù)相關(guān)公式,計算出病指、病級、發(fā)病率、產(chǎn)量等相關(guān)數(shù)據(jù)。結(jié)果如下:對病指與年份之間進行雙因素分析,發(fā)現(xiàn)病指在年份之間差異極顯著,病指在品種間差異顯著;對所有的材料進行聚類分析,80份種質(zhì)資源材料可以劃分為3類;通過平均單株產(chǎn)量與年份之間的方差分析,可以得出產(chǎn)量在年份之間差異不顯著,但是不同資源材料與產(chǎn)量之間差異顯著;病指與產(chǎn)量間的相關(guān)性分析表明,產(chǎn)量與病指之間呈顯著性負相關(guān)。2.利用轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)進行分析,結(jié)果表明:在感染枯萎病菌樣本中抗病響應蛋白基因PR1和PR3、毒素分解代謝過程相關(guān)基因GSTF和GSTU.防御機制相關(guān)基因MRP、NPR基因、棉酚生物合成相關(guān)基因ACLA及抗病性R基因ZAR1和RPS2等已知抗病相關(guān)基因在抗病材料中都顯著表達,且大部分基因在抗病樣本中的表達水平要顯著高于感病樣本。差異表達基因功能聚類結(jié)果表明,在感染枯萎病菌樣本中都富集到了糖基轉(zhuǎn)移酶、類黃酮生物合成相關(guān)基因。這些代謝路徑中的基因成員與海島棉抗病性相關(guān),可作為研究海島棉抗病性的候選基因。3.利用已報道的與棉花枯萎病抗性有關(guān)的基因或EST序列和轉(zhuǎn)錄組測序富集到的基因序列在抗、感病材料上做熒光定量,通過在抗、感病材料上基因表達差異分析,結(jié)果如下:CFW3、CFW10、 comp62810、comp71372等抗病相關(guān)標記基因,在枯萎病病菌侵染的過程中,感、抗材料之間表達有明顯差異,其差異主要體現(xiàn)在:相對于感病材料,抗病材料的最大表達量出現(xiàn)的時間比感病材料早;表達量遠高于感病材料的;推測這4個基因可能與海島棉枯萎病抗性有關(guān)。
【學位單位】:新疆農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2016
【中圖分類】:S435.621.24
【學位單位】:新疆農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2016
【中圖分類】:S435.621.24
【參考文獻】
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1 趙蕊;呂利華;陳婷;何自福;何余容;;木爾坦棉花曲葉病毒SYBR Green Ⅰ實時熒光定量PCR檢測方法[J];華南農(nóng)業(yè)大學學報;2015年06期
2 沈元R
本文編號:2807960
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