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禾谷鐮刀菌組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶(HATs)和泛素化相關(guān)基因FgUbx5的功能研究

發(fā)布時(shí)間:2020-08-27 09:27
【摘要】:禾谷鐮刀菌(Fusarium graminearum)引起的小麥赤霉病是一種毀滅性病害。該病害不僅導(dǎo)致小麥產(chǎn)量和經(jīng)濟(jì)損失,而且產(chǎn)生的真菌毒素也會(huì)造成糧食污染,嚴(yán)重威脅人畜健康。了解禾谷鐮刀菌生長發(fā)育及致病分子機(jī)制是有效控制該病害的重要前提。蛋白乙;头核鼗趦(nèi)的表觀遺傳修飾在寄主植物與病原菌的互作中起重要作用。本文從禾谷鐮刀菌PH-1基因組中鑒定了4個(gè)組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶(HATs)基因和1個(gè)泛素化相關(guān)基因FgUbx5,從基礎(chǔ)表型性狀、轉(zhuǎn)錄組水平和蛋白水平等方面進(jìn)行研究,以期揭示它們在禾谷鐮刀菌生長發(fā)育及致病過程中的作用機(jī)制。一、禾谷鐮刀菌組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶對生長發(fā)育及組蛋白乙;揎椀挠绊(1)禾谷鐮刀菌組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶對生長發(fā)育的影響:從基因組數(shù)據(jù)庫檢索得到4個(gè)HATs基因,FgGCN5,FgRTT109,FgSAS2和FgSAS3,突變菌株表型測定發(fā)現(xiàn):FgGCN5和FgSAS3對禾谷鐮刀菌菌絲生長速率、脅迫反應(yīng)、分生孢子產(chǎn)量、有性生殖、致病力和DON毒素產(chǎn)量均有顯著影響;FgRTT109對分生孢子產(chǎn)量、有性生殖、致病力有顯著影響;FgSAS2顯著影響菌絲生長速率和分生孢子的產(chǎn)量。(2)禾谷鐮刀菌組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶基因FgGCN5和FgSAS3對乙;揎椀挠绊:FgGCN5基因缺失導(dǎo)致H3的K9、K14、K18和K27的乙;斤@著降低,表明FgGCN5調(diào)控以上位點(diǎn)的賴氨酸乙;;FgSAS3基因缺失導(dǎo)致H3的K4和K14位點(diǎn)乙;盘枏(qiáng)度顯著降低,說明FgSAS3特異地催化以上兩個(gè)位點(diǎn)的乙;,且H3K14的完全乙;枰狥gSAS3和FgGCN5的共同參與。二、禾谷鐮刀菌組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶基因FgGCN5和FgSAS3的代謝調(diào)控研究轉(zhuǎn)錄組測序分析顯示兩個(gè)突變菌株中分別有3375個(gè)和2438個(gè)差異表達(dá)基因。進(jìn)一步生物信息學(xué)分析表明FgGCN5基因參與多種生物學(xué)過程,主要包括核糖體生物合成,rRNA加工,ncRNA加工和細(xì)胞氨基酸代謝過程,FgSAS3基因主要參與氧化還原,跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)和碳代謝。在這些差異基因中多種轉(zhuǎn)錄因子、有性發(fā)育、致病力及次生代謝相關(guān)基因的表達(dá)量顯著下調(diào)。三、禾谷鐮刀菌泛素化相關(guān)基因FgUbx5對生長發(fā)育的影響對FgUbx5基因缺失菌株表型測定發(fā)現(xiàn),其生長速率下降,菌落呈現(xiàn)不規(guī)則形態(tài),孢子產(chǎn)量降低,有性生殖能力喪失,產(chǎn)毒能力下降,活性氧累積量增加,致病能力顯著下降,對多種脅迫劑的敏感性增加。四、禾谷鐮刀菌泛素化相關(guān)基因FgUbx5的代謝調(diào)控研究轉(zhuǎn)錄組分析顯示突變體中共有2664個(gè)差異表達(dá)基因,GO富集分析表明FgUbx5主要參與蛋白跨膜轉(zhuǎn)運(yùn);FgUbx5的缺失導(dǎo)致蛋白總泛素化水平增加,說明FgUbx5參與蛋白泛素化降解;親和捕獲質(zhì)譜分析共篩選出71個(gè)與FgUbx5相互作用的候選蛋白。CoIP試驗(yàn)進(jìn)一步驗(yàn)證了FgUbx5與Cdc48之間的互作關(guān)系。綜上所述,組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶和FgUbx5基因在禾谷鐮刀菌的生長發(fā)育及致病性等方面具有至關(guān)重要的作用。這為解析禾谷鐮刀菌生長發(fā)育過程,闡明毒素合成及致病機(jī)理提供了理論依據(jù)。
【學(xué)位授予單位】:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:S435.121.45
【圖文】:

序列,N-乙酰轉(zhuǎn)移酶,組蛋白,三維結(jié)構(gòu)


并且在結(jié)構(gòu)域 A 中具有保守的“P 環(huán)”(Q133-V134-R135-G136-Y137-G138),其有助于 AcCoA 結(jié)合(圖1.1C)(Trievel et al., 1999)。結(jié)構(gòu)分析表明,誘變和動(dòng)力學(xué)研究證實(shí),位于底物結(jié)合裂口底部的保守谷氨酸殘基(E173)充當(dāng)通用堿基,從賴氨酸側(cè)鏈上的-NH2 基團(tuán)中提取質(zhì)子(Trievel et al.,1999)。其他來源的 GCN5 同系物的結(jié)構(gòu)隨后被解析,包括來自人和嗜熱四膜蟲(Lin et al., 1999;Rojas et al., 1999; Clements et al., 2003)。對自由形式的、與 AcCoA 結(jié)合的、與 AcCoA 和 H3 結(jié)合的嗜熱子囊菌 GCN5 (TtGCN5)進(jìn)行分析,揭示了一個(gè)保守的序列基序(GKXP)決定了組蛋白結(jié)合特異性(Lin et al., 1999; Rojas et al., 1999; Poux et al., 2002; Clements et al., 2003)。L126的主鏈-NH 基團(tuán)與 AcCoA 的乙;聂驶跣纬蓺滏I。因此,L126 被認(rèn)為通過極化硫酯的羰基和穩(wěn)定反應(yīng)中間體而在反應(yīng)機(jī)理中起關(guān)鍵作用(Lin et al., 1999)。TtGCN5 的保守殘基 E122(相當(dāng)于 ScGCN5 的殘基 E173)可能作為一個(gè)基底通過有序水分子以促進(jìn)直接乙酰轉(zhuǎn)移(Lin et al.,1999; Clements et al., 2003)。在人類同系物中,殘基 E173(相當(dāng)于 ScGCN5 的 E575)可作為底物去質(zhì)子的基礎(chǔ)(Schuetz et al., 2007)。有趣的是,TtGCN5 的晶體結(jié)構(gòu)與肽-CoA 雙底物抑制劑結(jié)合表明在賴氨酸乙;

禾谷鐮刀菌組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶(HATs)和泛素化相關(guān)基因FgUbx5的功能研究


NuA4復(fù)合體(Lafonetal.,2007)

禾谷鐮刀菌組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶(HATs)和泛素化相關(guān)基因FgUbx5的功能研究


NuA3復(fù)合體(Lafonetal.,2007)

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本文編號:2805921

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