禾谷鐮刀菌組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶(HATs)和泛素化相關(guān)基因FgUbx5的功能研究
【學(xué)位授予單位】:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:S435.121.45
【圖文】:
并且在結(jié)構(gòu)域 A 中具有保守的“P 環(huán)”(Q133-V134-R135-G136-Y137-G138),其有助于 AcCoA 結(jié)合(圖1.1C)(Trievel et al., 1999)。結(jié)構(gòu)分析表明,誘變和動(dòng)力學(xué)研究證實(shí),位于底物結(jié)合裂口底部的保守谷氨酸殘基(E173)充當(dāng)通用堿基,從賴氨酸側(cè)鏈上的-NH2 基團(tuán)中提取質(zhì)子(Trievel et al.,1999)。其他來源的 GCN5 同系物的結(jié)構(gòu)隨后被解析,包括來自人和嗜熱四膜蟲(Lin et al., 1999;Rojas et al., 1999; Clements et al., 2003)。對自由形式的、與 AcCoA 結(jié)合的、與 AcCoA 和 H3 結(jié)合的嗜熱子囊菌 GCN5 (TtGCN5)進(jìn)行分析,揭示了一個(gè)保守的序列基序(GKXP)決定了組蛋白結(jié)合特異性(Lin et al., 1999; Rojas et al., 1999; Poux et al., 2002; Clements et al., 2003)。L126的主鏈-NH 基團(tuán)與 AcCoA 的乙;聂驶跣纬蓺滏I。因此,L126 被認(rèn)為通過極化硫酯的羰基和穩(wěn)定反應(yīng)中間體而在反應(yīng)機(jī)理中起關(guān)鍵作用(Lin et al., 1999)。TtGCN5 的保守殘基 E122(相當(dāng)于 ScGCN5 的殘基 E173)可能作為一個(gè)基底通過有序水分子以促進(jìn)直接乙酰轉(zhuǎn)移(Lin et al.,1999; Clements et al., 2003)。在人類同系物中,殘基 E173(相當(dāng)于 ScGCN5 的 E575)可作為底物去質(zhì)子的基礎(chǔ)(Schuetz et al., 2007)。有趣的是,TtGCN5 的晶體結(jié)構(gòu)與肽-CoA 雙底物抑制劑結(jié)合表明在賴氨酸乙;
NuA4復(fù)合體(Lafonetal.,2007)
NuA3復(fù)合體(Lafonetal.,2007)
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本文編號:2805921
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