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水稻氮高效利用和耐低氮優(yōu)異基因挖掘與種質(zhì)創(chuàng)新

發(fā)布時(shí)間:2020-08-22 21:36
【摘要】:利用水稻8親本重組自交系群體(MAGIC群體)連續(xù)兩年分別在不同氮素條件下考查耐低氮和氮高效利用相關(guān)表型,結(jié)合基于3K全球水稻重測(cè)序種質(zhì)資源構(gòu)建的55K高通量SNP芯片鑒定的基因型,結(jié)合MAGIC群體在不同氮素水平條件下的表型,關(guān)聯(lián)分析定位氮高效利用和耐低氮QTL。在2015年和2016年連續(xù)兩年有35個(gè)與產(chǎn)量及產(chǎn)量性狀相關(guān)的主效QTL被定位到。在第6染色體短臂端定位到1個(gè)影響氮利用效率(qNGY6)主效QTL,該位點(diǎn)是具有—因多效性和穩(wěn)定表達(dá)的重要位點(diǎn),配制了用于該主效QTL精細(xì)定位的遺傳分離群體。以黃華占為輪回親本,8個(gè)優(yōu)異品種作為供體親本,構(gòu)建497份相互關(guān)聯(lián)的育種定位群體(IB群體),連續(xù)3個(gè)季節(jié)在不同氮素條件下考察產(chǎn)量及產(chǎn)量相關(guān)性狀,結(jié)合導(dǎo)入系重測(cè)序獲得的7388個(gè)SNP bin基因型數(shù)據(jù),關(guān)聯(lián)分析定位水稻耐低氮有利基因/主效QTL。在不同氮素條件下定位到35個(gè)影響產(chǎn)量及產(chǎn)量相關(guān)性狀的主效QTL,在第1染色體上的bin16和第3染色體上的bin2183-bin2186兩個(gè)區(qū)段分別定位到控制產(chǎn)量、生物量、收獲指數(shù)和結(jié)實(shí)率相關(guān)性狀的主效QTL;诙ㄎ唤Y(jié)果精細(xì)定位主效QTL qTGW2-1,該位點(diǎn)位于bin1459處的區(qū)間大小為50 kb左右。結(jié)合KASP SNP連鎖標(biāo)記對(duì)2個(gè)重要耐低氮主效位點(diǎn)(qGY1和qSP8-3)進(jìn)行后代驗(yàn)證和跟蹤,將這2個(gè)主效QTL進(jìn)行聚合,最終篩選出攜帶qGY1和qSP8-3兩個(gè)主效位點(diǎn)且耐低氮水平顯著優(yōu)于黃華占和導(dǎo)入系親本的聚合系。利用黃華占IB群體開展了水稻耐冷QTL定位研究。在云南省的3個(gè)低緯度高海拔地區(qū)(尋甸、嵩明和玉溪)連續(xù)兩年進(jìn)行耐冷鑒定,以自然低溫處理后的結(jié)實(shí)率為衡量指標(biāo)。共定位到8個(gè)與耐冷相關(guān)的主效QTL,其中在第3染色體短臂上的qCT-3-2在4個(gè)環(huán)境下均被定位到,是穩(wěn)定表達(dá)的耐冷位點(diǎn)。通過物理作圖將qCT-3-2精細(xì)定位到192 kb左右,有利基因來自于黃華占;同時(shí)qCT-3-2在水稻苗期耐冷中也發(fā)揮一定作用,因此該位點(diǎn)在水稻耐冷分子育種中有較大的應(yīng)用價(jià)值。
【學(xué)位授予單位】:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:博士后
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:S511
【圖文】:

水稻,親本,耐低氮,水稻氮


院博士后出站報(bào)告邐水稻氮高效利用與耐低氮遺傳重疊分析與優(yōu)異基因挖掘逡逑的表現(xiàn),即評(píng)價(jià)水稻氮高效利用。正常施氮田塊的各項(xiàng)指標(biāo)作為氮條件下(正常田塊不施氮和缺氮田塊)水稻MAGIC群體的氮高氮能力。逡逑表1構(gòu)建MAGIC群體的親本來源及特點(diǎn)逡逑品種名稱邐來源邐主要特征邐逡逑SAGC08邐中國邐大穗、蓮桿粗壯、抗旱逡逑HHZ5-SAL9-Y3-Y1邐中國邐氮高效利用、耐鹽、優(yōu)質(zhì)逡逑BP1976B-2-3-7-TB-1-1邐印度尼西亞耐低氮、抗旱、抗稻瘟病逡逑PR33282-B-8-1-1-1-1-1邐菲律賓邐高產(chǎn)、穩(wěn)產(chǎn)逡逑FFZ1邐中國邐氮高效利用、大穗、優(yōu)質(zhì)逡逑CT16658-5-2-2SR-2-3-6MP邋哥倫比亞邐耐低氮、抗旱逡逑IR68邐菲律賓邐大粒、莖桿粗壯逡逑IR02A127邐菲律賓邐綜合抗病性強(qiáng)逡逑

施氮,連鎖圖


C邐1.112邐0.731邐0.106邐0.110邐0.210邐57.8逡逑D邐1.053邐0.791邐0.099邐0.229邐0.328邐53.6逡逑E邐1.217邐0.910邐0.117邐0.192邐0.309邐52.0逡逑正常田邐F邐1.181邐0.881邐0.180邐0.254邐0.434邐53.6逡逑G邐1.161邐0.760邐0.173邐0.185邐0.351邐47.7逡逑H邐1.146邐0.724邐0.178邐0.201邐0.379邐48.8逡逑Max邐1.513邐1.007邐0.422邐0.420邐0.661邐89.0逡逑Min邐0.770邐0.489邐0.032邐0.076邐0.204邐24.7逡逑Mean±SD邐1.132±0.106邐0.716±0.087邐0.188±0.042邐0.18±0.053邐0.369±0.072邐58.9±7.9逡逑A邐0.899邐0.611邐0.161邐0.128邐0.290逡逑B邐0.946邐0.535邐0.186邐0.108邐0.277逡逑C邐1.048邐0.581邐0.121邐0.082邐0.203逡逑D邐1.026邐0.629邐0.139邐0.128邐0.267逡逑E邐1.079邐0.702邐0.144邐0.113邐0.257逡逑不施氮邐F邐1.079邐0.683邐0.196邐0.146邐0.347逡逑G邐1.096邐0.689邐0.161邐0.145邐0.306逡逑H邐1.086邐0.683邐0.22

曼哈頓,染色體,區(qū)段


圖3主效QTL妒W的曼哈頓圖逡逑BM邐HI逡逑2015{,-邐2015^逡逑1邋:;1逡逑^邋tAi邋.Hid邐.邐i邋?一邋_..邐.邋.邋....邐■…1邐1邐a邐?邐r邐''邐?;邋?邐-邐I邐>邐i邐?邐.邐?邐1邐-2016’r邐:邋??1邐20164逡逑;邋ii逡逑t邐i邋j逡逑>—A邐.1.邐,邋J邋_4睡_|邋?lf邐■!邋iM邐hMM‘邐J邐*邐i邐l邐?.?‘,.*‘???邐?邐.邐>邐*邐t邐V邐?邋tHD邐NGY逡逑2015:丨-邐2015M逡逑■邐H逡逑■■邋jV.)y>f<邐>??■?邐_邋_?邐?■如邋I邐ijL^isd逡逑2016邋丨!’邐.邋:*3邐2016:!逡逑二邋%邋-4逡逑i’邐”邐_逡逑?邋?邐>■--;邋一—邋-J邐?邋-邋-邋—邐,一■*__■■邐7邋j邋.?__,_?■<.邐??邋I.邋■邋t?邐?i?i邐?l邐■邐*邐-邐"邐l邋'邐?邐.邐4邐-I邐;邐f邋<f邋M圖4第6染色體相同區(qū)段定位不同主效QTL的曼哈頓圖逡逑

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本文編號(hào):2801178

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