辣椒細胞質(zhì)雄性不育花藥的蛋白質(zhì)組學分析及CaSEP5基因的功能分析
【學位授予單位】:中國農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2018
【分類號】:S641.3
【圖文】:
業(yè)大學博士學位論文邐第病毒誘導的基因沉默技術(shù)(VIGS)逡逑邐VIGS技術(shù)原理逡逑毒誘導的基因沉默(virus-induced邋gene邋silencing,邋VIGS),在植物中普遍存在,是染的自我防御反應,屬于轉(zhuǎn)錄后的基因沉默(post-transcriptinal邋gene邋silencing,PTGS,VIGS作為一種基因沉默技術(shù)被廣泛應用于植物基因功能的研究。其作用機制:攜帶目的片段的病毒載體侵染寄主植物后,在植物組織中大量復制,攜帶的目依賴的RNA聚合酶(RdRp)作用下合成大量的雙鏈RNA邋(dsRNA),邋dsRNA在cer的作用下被切割成21-25邋nt的小干擾RNA邋(siRNA),邋siRNA的反義鏈與RNASC邋(RNA-induced邋silencing邋complexes)結(jié)合而被激活,被激活的沉默復合物體以標靶并降解目標基因的mRNA,最終阻斷遺傳信息的傳遞[54]。逡逑Mechanism邋of邋VIGS逡逑
6.52逡逑蛋白質(zhì)SDS-PAGE電泳結(jié)果顯示,蛋白條帶清晰、完整、均一,蛋白無降解,蛋白總量大于逡逑120噸(label-free),滿足后續(xù)實驗,質(zhì)檢合格(圖2-2)。逡逑A-l邋A-2邐A-3邋B-l邋B-2邐B-3邋M逡逑kDa邋|邐■逡逑1邋_邋丨邐,haa逡逑25-灄灄2灄畫畫=逡逑14邋—1__W—:.a(chǎn)驐H桯:.逡逑圖2-2蛋白質(zhì)質(zhì)檢結(jié)果逡逑Figure邋2-2邋Qualitative邋evaluation邋of邋protein逡逑2.2.3原始數(shù)據(jù)分析及蛋白的鑒定逡逑通過label-free技術(shù)對樣品進行蛋白質(zhì)組分析,共獲得423,181條質(zhì)譜帶,其中131,536條與逡逑數(shù)據(jù)庫中已知質(zhì)譜帶匹配,共獲得114,374條獨立質(zhì)譜帶,21,506條肽段,17,882條獨立肽段和逡逑3,355種蛋白(圖2-3)。肽段長度分布如圖2-3所示,且3,355種蛋白中77%的蛋白質(zhì)包含兩條以逡逑上的肽段(圖2-4)。逡逑14逡逑
21506邐17882逡逑」■邐■邋■邐Ml邋^邐—逡逑,z,y逡逑圖2-3邋Label-free從辣椒數(shù)據(jù)庫中匹配到的質(zhì)譜帶,肽段及蛋白數(shù)量逡逑Figure邋2-3邋Spectrum,邋peptides邋and邋proteins邋identified邋from邋label-free邋proteomics逡逑2200-1逡逑2000-逡逑1800-邐|j邋'邋J逡逑1600-逡逑I邋1400-逡逑I邋1200邋-邐,邐_逡逑y邋1000-邐I邋|邋|邋I'邋I邋|邋i逡逑H.邋8(K)邋-邐■邋_逡逑5邐10邐15邐20邐25邐>30逡逑Peptide邋Length邋(in邋amino邋acids)逡逑圖2-4肽段長度分布逡逑Figure邋2-4邋The邋distribution
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