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辣椒細(xì)胞質(zhì)雄性不育花藥的蛋白質(zhì)組學(xué)分析及CaSEP5基因的功能分析

發(fā)布時(shí)間:2020-08-03 09:38
【摘要】:盡管細(xì)胞質(zhì)雄性不育被廣泛的運(yùn)用于辣椒育種中,但其雄性不育的分子機(jī)理仍不清楚。本試驗(yàn)采用高通量非標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)label-free的方法對(duì)辣椒細(xì)胞質(zhì)雄性不育系及其相應(yīng)保持系的花藥進(jìn)行差異蛋白質(zhì)組學(xué)分析,共鑒定出324個(gè)差異蛋白。其中有47個(gè)差異蛋白在不育系中表現(xiàn)上調(diào),140個(gè)表現(xiàn)下調(diào)。此外,有75個(gè)蛋白在不育系中特異表達(dá),62個(gè)在保持系中特異表達(dá)。GO功能注釋和KEGG富集結(jié)果表明,這些差異蛋白主要參與花粉壁的合成,丙酮酸代謝,三羧酸循環(huán),線粒體電子傳遞鏈以及抗氧化反應(yīng),表明這些代謝途徑可能對(duì)調(diào)控辣椒細(xì)胞質(zhì)雄性不育系花粉的敗育過(guò)程具有重要的作用;ㄊ侵参锏纳称鞴,是決定果實(shí)和種子產(chǎn)量與品質(zhì)的重要因素。SEP-like基因家族對(duì)調(diào)控花序及花器官的分化與發(fā)育具有重要的作用,但對(duì)其調(diào)控辣椒花器官發(fā)育的分子機(jī)理知之甚少。本研究中,我們從辣椒花蕾中同源克隆得到5個(gè)SEP-like基因,分別命名為CaSEP1-CaSEP5(GenBank登錄號(hào):MG745434-38)。系統(tǒng)進(jìn)化分析結(jié)果表明它們分別屬于4個(gè)不同的亞族,其中 CaSEP1 屬于 SEP1/2 亞族,CaSEP2/3 屬于 SEP4 亞族,CaSEP4 屬于 SEP3 亞族,CaSEP5 屬于FBP9/23亞族。利用VIGS技術(shù)對(duì)CaSEP-like基因進(jìn)行功能的初步驗(yàn)證,結(jié)果表明只有CaSEP5基因沉默的植株有明顯地表型變化,具體表現(xiàn)為萼片伸長(zhǎng),甚至葉狀化;花梗直立,不能自然彎曲;果實(shí)變小。CaSEP5基因在花梗及各輪花器官中的表達(dá)量均隨著表型的嚴(yán)重程度增加而逐漸降低,且CaSEP5基因的沉默會(huì)不同程度的影響辣椒中B-、C-類基因及其他CaSEP-like基因的表達(dá)。激素含量測(cè)定結(jié)果表明,CaSEP5基因的沉默會(huì)導(dǎo)致花蕾中IAA、ABA和MeJA含量降低,而花梗中IAA和ABA含量增高。CaSEP5基因主要在花器官中表達(dá),且主要在花瓣中表達(dá),其表達(dá)量隨著花蕾的發(fā)育逐漸降低。CaSEP5基因定位于細(xì)胞核中,符合其轉(zhuǎn)錄因子的特性。酵母雙雜交和雙分子熒光互補(bǔ)結(jié)果表明,CaSEP5蛋白與其他CaSEP-like蛋白(CaSEP2和CaSEP5本身除外),以及B-、C-類蛋白間均存在物理互作。這表明,CaSEP5基因可能通過(guò)復(fù)雜的基因和激素網(wǎng)絡(luò)調(diào)控辣椒花器官的發(fā)育。
【學(xué)位授予單位】:中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:S641.3
【圖文】:

作用機(jī)制,載體,基因沉默


業(yè)大學(xué)博士學(xué)位論文邐第病毒誘導(dǎo)的基因沉默技術(shù)(VIGS)逡逑邐VIGS技術(shù)原理逡逑毒誘導(dǎo)的基因沉默(virus-induced邋gene邋silencing,邋VIGS),在植物中普遍存在,是染的自我防御反應(yīng),屬于轉(zhuǎn)錄后的基因沉默(post-transcriptinal邋gene邋silencing,PTGS,VIGS作為一種基因沉默技術(shù)被廣泛應(yīng)用于植物基因功能的研究。其作用機(jī)制:攜帶目的片段的病毒載體侵染寄主植物后,在植物組織中大量復(fù)制,攜帶的目依賴的RNA聚合酶(RdRp)作用下合成大量的雙鏈RNA邋(dsRNA),邋dsRNA在cer的作用下被切割成21-25邋nt的小干擾RNA邋(siRNA),邋siRNA的反義鏈與RNASC邋(RNA-induced邋silencing邋complexes)結(jié)合而被激活,被激活的沉默復(fù)合物體以標(biāo)靶并降解目標(biāo)基因的mRNA,最終阻斷遺傳信息的傳遞[54]。逡逑Mechanism邋of邋VIGS逡逑

長(zhǎng)度分布,蛋白質(zhì),質(zhì)譜,種蛋


6.52逡逑蛋白質(zhì)SDS-PAGE電泳結(jié)果顯示,蛋白條帶清晰、完整、均一,蛋白無(wú)降解,蛋白總量大于逡逑120噸(label-free),滿足后續(xù)實(shí)驗(yàn),質(zhì)檢合格(圖2-2)。逡逑A-l邋A-2邐A-3邋B-l邋B-2邐B-3邋M逡逑kDa邋|邐■逡逑1邋_邋丨邐,haa逡逑25-灄灄2灄畫(huà)畫(huà)=逡逑14邋—1__W —:.a(chǎn)驐H桯:.逡逑圖2-2蛋白質(zhì)質(zhì)檢結(jié)果逡逑Figure邋2-2邋Qualitative邋evaluation邋of邋protein逡逑2.2.3原始數(shù)據(jù)分析及蛋白的鑒定逡逑通過(guò)label-free技術(shù)對(duì)樣品進(jìn)行蛋白質(zhì)組分析,共獲得423,181條質(zhì)譜帶,其中131,536條與逡逑數(shù)據(jù)庫(kù)中已知質(zhì)譜帶匹配,共獲得114,374條獨(dú)立質(zhì)譜帶,21,506條肽段,17,882條獨(dú)立肽段和逡逑3,355種蛋白(圖2-3)。肽段長(zhǎng)度分布如圖2-3所示,且3,355種蛋白中77%的蛋白質(zhì)包含兩條以逡逑上的肽段(圖2-4)。逡逑14逡逑

長(zhǎng)度分布,長(zhǎng)度分布,辣椒,質(zhì)譜


21506邐17882逡逑」■邐■邋■邐Ml邋^邐—逡逑,z,y逡逑圖2-3邋Label-free從辣椒數(shù)據(jù)庫(kù)中匹配到的質(zhì)譜帶,肽段及蛋白數(shù)量逡逑Figure邋2-3邋Spectrum,邋peptides邋and邋proteins邋identified邋from邋label-free邋proteomics逡逑2200-1逡逑2000-逡逑1800-邐|j邋'邋J逡逑1600-逡逑I邋1400-逡逑I邋1200邋-邐,邐_逡逑y邋1000-邐I邋|邋|邋I'邋I邋|邋i逡逑H.邋8(K)邋-邐■邋_逡逑5邐10邐15邐20邐25邐>30逡逑Peptide邋Length邋(in邋amino邋acids)逡逑圖2-4肽段長(zhǎng)度分布逡逑Figure邋2-4邋The邋distribution

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