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辣椒細胞質(zhì)雄性不育花藥的蛋白質(zhì)組學分析及CaSEP5基因的功能分析

發(fā)布時間:2020-08-03 09:38
【摘要】:盡管細胞質(zhì)雄性不育被廣泛的運用于辣椒育種中,但其雄性不育的分子機理仍不清楚。本試驗采用高通量非標記定量蛋白質(zhì)組學label-free的方法對辣椒細胞質(zhì)雄性不育系及其相應保持系的花藥進行差異蛋白質(zhì)組學分析,共鑒定出324個差異蛋白。其中有47個差異蛋白在不育系中表現(xiàn)上調(diào),140個表現(xiàn)下調(diào)。此外,有75個蛋白在不育系中特異表達,62個在保持系中特異表達。GO功能注釋和KEGG富集結(jié)果表明,這些差異蛋白主要參與花粉壁的合成,丙酮酸代謝,三羧酸循環(huán),線粒體電子傳遞鏈以及抗氧化反應,表明這些代謝途徑可能對調(diào)控辣椒細胞質(zhì)雄性不育系花粉的敗育過程具有重要的作用;ㄊ侵参锏纳称鞴,是決定果實和種子產(chǎn)量與品質(zhì)的重要因素。SEP-like基因家族對調(diào)控花序及花器官的分化與發(fā)育具有重要的作用,但對其調(diào)控辣椒花器官發(fā)育的分子機理知之甚少。本研究中,我們從辣椒花蕾中同源克隆得到5個SEP-like基因,分別命名為CaSEP1-CaSEP5(GenBank登錄號:MG745434-38)。系統(tǒng)進化分析結(jié)果表明它們分別屬于4個不同的亞族,其中 CaSEP1 屬于 SEP1/2 亞族,CaSEP2/3 屬于 SEP4 亞族,CaSEP4 屬于 SEP3 亞族,CaSEP5 屬于FBP9/23亞族。利用VIGS技術(shù)對CaSEP-like基因進行功能的初步驗證,結(jié)果表明只有CaSEP5基因沉默的植株有明顯地表型變化,具體表現(xiàn)為萼片伸長,甚至葉狀化;花梗直立,不能自然彎曲;果實變小。CaSEP5基因在花梗及各輪花器官中的表達量均隨著表型的嚴重程度增加而逐漸降低,且CaSEP5基因的沉默會不同程度的影響辣椒中B-、C-類基因及其他CaSEP-like基因的表達。激素含量測定結(jié)果表明,CaSEP5基因的沉默會導致花蕾中IAA、ABA和MeJA含量降低,而花梗中IAA和ABA含量增高。CaSEP5基因主要在花器官中表達,且主要在花瓣中表達,其表達量隨著花蕾的發(fā)育逐漸降低。CaSEP5基因定位于細胞核中,符合其轉(zhuǎn)錄因子的特性。酵母雙雜交和雙分子熒光互補結(jié)果表明,CaSEP5蛋白與其他CaSEP-like蛋白(CaSEP2和CaSEP5本身除外),以及B-、C-類蛋白間均存在物理互作。這表明,CaSEP5基因可能通過復雜的基因和激素網(wǎng)絡調(diào)控辣椒花器官的發(fā)育。
【學位授予單位】:中國農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2018
【分類號】:S641.3
【圖文】:

作用機制,載體,基因沉默


業(yè)大學博士學位論文邐第病毒誘導的基因沉默技術(shù)(VIGS)逡逑邐VIGS技術(shù)原理逡逑毒誘導的基因沉默(virus-induced邋gene邋silencing,邋VIGS),在植物中普遍存在,是染的自我防御反應,屬于轉(zhuǎn)錄后的基因沉默(post-transcriptinal邋gene邋silencing,PTGS,VIGS作為一種基因沉默技術(shù)被廣泛應用于植物基因功能的研究。其作用機制:攜帶目的片段的病毒載體侵染寄主植物后,在植物組織中大量復制,攜帶的目依賴的RNA聚合酶(RdRp)作用下合成大量的雙鏈RNA邋(dsRNA),邋dsRNA在cer的作用下被切割成21-25邋nt的小干擾RNA邋(siRNA),邋siRNA的反義鏈與RNASC邋(RNA-induced邋silencing邋complexes)結(jié)合而被激活,被激活的沉默復合物體以標靶并降解目標基因的mRNA,最終阻斷遺傳信息的傳遞[54]。逡逑Mechanism邋of邋VIGS逡逑

長度分布,蛋白質(zhì),質(zhì)譜,種蛋


6.52逡逑蛋白質(zhì)SDS-PAGE電泳結(jié)果顯示,蛋白條帶清晰、完整、均一,蛋白無降解,蛋白總量大于逡逑120噸(label-free),滿足后續(xù)實驗,質(zhì)檢合格(圖2-2)。逡逑A-l邋A-2邐A-3邋B-l邋B-2邐B-3邋M逡逑kDa邋|邐■逡逑1邋_邋丨邐,haa逡逑25-灄灄2灄畫畫=逡逑14邋—1__W —:.a(chǎn)驐H桯:.逡逑圖2-2蛋白質(zhì)質(zhì)檢結(jié)果逡逑Figure邋2-2邋Qualitative邋evaluation邋of邋protein逡逑2.2.3原始數(shù)據(jù)分析及蛋白的鑒定逡逑通過label-free技術(shù)對樣品進行蛋白質(zhì)組分析,共獲得423,181條質(zhì)譜帶,其中131,536條與逡逑數(shù)據(jù)庫中已知質(zhì)譜帶匹配,共獲得114,374條獨立質(zhì)譜帶,21,506條肽段,17,882條獨立肽段和逡逑3,355種蛋白(圖2-3)。肽段長度分布如圖2-3所示,且3,355種蛋白中77%的蛋白質(zhì)包含兩條以逡逑上的肽段(圖2-4)。逡逑14逡逑

長度分布,長度分布,辣椒,質(zhì)譜


21506邐17882逡逑」■邐■邋■邐Ml邋^邐—逡逑,z,y逡逑圖2-3邋Label-free從辣椒數(shù)據(jù)庫中匹配到的質(zhì)譜帶,肽段及蛋白數(shù)量逡逑Figure邋2-3邋Spectrum,邋peptides邋and邋proteins邋identified邋from邋label-free邋proteomics逡逑2200-1逡逑2000-逡逑1800-邐|j邋'邋J逡逑1600-逡逑I邋1400-逡逑I邋1200邋-邐,邐_逡逑y邋1000-邐I邋|邋|邋I'邋I邋|邋i逡逑H.邋8(K)邋-邐■邋_逡逑5邐10邐15邐20邐25邐>30逡逑Peptide邋Length邋(in邋amino邋acids)逡逑圖2-4肽段長度分布逡逑Figure邋2-4邋The邋distribution

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