香菇耐高溫相關(guān)鄰氨基苯甲酸合酶基因功能分析
【學(xué)位授予單位】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:S646.12
【圖文】:
華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018 屆碩士研究生學(xué)位(畢業(yè))論文1.3.2 鄰氨基苯甲酸合酶結(jié)構(gòu)TrpE 由α亞基和β亞基組合的復(fù)合酶,等電點(diǎn) 5.1,分子質(zhì)量為 143000 Da(Poulsen et al 1993)。TrpE 的α亞基是催化反應(yīng)的關(guān)鍵亞基,能夠獨(dú)立地催化氨基與分支酸,生成鄰氨基苯甲酸,其活性受色氨酸的反饋抑制;β亞基為α亞基的催化提供氨基,作用是催化谷氨酰胺轉(zhuǎn)化為谷氨酸。TrpE 的α亞基和β亞基都參了谷氨酰胺依賴的鄰氨基苯甲酸反應(yīng),大量的游離氨基存在時(shí),α亞基也可以單獨(dú)的催化合成鄰氨基苯甲酸(圖 1-1)(Romero et al 1995)。這 2 個(gè)反應(yīng)且都需要 Mg2+作為輔因子(Niyogi & Fink 1992)。Kanno et al(2004)體外重構(gòu)了水稻 TrpE 的同工酶,動(dòng)力學(xué)分析發(fā)現(xiàn),即使以 NH4+作為氨基供體時(shí),α亞基也需要與β亞基結(jié)合才能獲得最大酶活。
3 結(jié)果與分析3.1 LeTrpE 蛋白結(jié)構(gòu)和同源性分析以香菇單核體全基因組測(cè)序數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),將 LetrpE 基因蛋白序列提交至 NCBIConserved Domian Search(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/wrpsb.cgi),分析 LeTrpE 蛋白的結(jié)構(gòu)組成(圖 3-1),發(fā)現(xiàn) LeTrpE 蛋白包含 424 個(gè)氨基酸,屬于 Chorismate_bind super family(54-409 AA),其中 54-133 為 LeTrpE 結(jié)構(gòu)保守域。二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,該蛋白以α-螺旋(11 個(gè))和β-轉(zhuǎn)角(17 個(gè))為主;Interpro 蛋白功能預(yù)測(cè) LeTrpE 分子量是 47.00kDa,等電點(diǎn)為 6.37,參與細(xì)胞內(nèi)色氨酸代謝過(guò)程。在 NCBI 上通過(guò) CDS 翻譯的氨基酸序列對(duì) LeTrpE 蛋白進(jìn)行同源性比對(duì)分析,發(fā)現(xiàn)香菇 LeTrpE 和其它真菌的蛋白的同源性差異較大,說(shuō)明是一種比較獨(dú)特的蛋白(圖 3-2)。
于 Chorismate_bind super family(54-409 AA),其中 54-133 為 LeTrpE 結(jié)構(gòu)保守域二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,該蛋白以α-螺旋(11 個(gè))和β-轉(zhuǎn)角(17 個(gè)為主;Interpro 蛋白功能預(yù)測(cè) LeTrpE 分子量是 47.00kDa,等電點(diǎn)為 6.37,參與細(xì)胞內(nèi)色氨酸代謝過(guò)程。在 NCBI 上通過(guò) CDS 翻譯的氨基酸序列對(duì) LeTrpE 蛋白進(jìn)同源性比對(duì)分析,發(fā)現(xiàn)香菇 LeTrpE 和其它真菌的蛋白的同源性差異較大,說(shuō)明一種比較獨(dú)特的蛋白(圖 3-2)。圖 3-1 香菇 LeTrpE 蛋白功能結(jié)構(gòu)域Fig 3-1 Functional motif of LeTrpE in L.edodes
【相似文獻(xiàn)】
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9 李麗s
本文編號(hào):2764736
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