美國(guó)白蛾滯育相關(guān)基因的篩選與種群分化的研究
發(fā)布時(shí)間:2020-07-02 09:47
【摘要】:美國(guó)白蛾(Hyphantria cunea)屬鱗翅目(Lepidoptera)燈蛾科(Arctiidae),原產(chǎn)于北美地區(qū),后因人類(lèi)活動(dòng)入侵到多個(gè)國(guó)家,先現(xiàn)已成為一種世界性檢疫害蟲(chóng),對(duì)包括我國(guó)在內(nèi)的諸多國(guó)家造成了嚴(yán)重的危害。為探究與美國(guó)白蛾滯育相關(guān)的基因,以沈陽(yáng)地區(qū)美國(guó)白蛾蛹(滯育和非滯育)為材料,通過(guò)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的手段,對(duì)美國(guó)白蛾滯育蛹和非滯育蛹的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行了測(cè)定,通過(guò)對(duì)比,得到了二者間的差異表達(dá)基因,經(jīng)篩選,進(jìn)而獲得美國(guó)白蛾滯育相關(guān)基因。此外,為探究不同地理種群美國(guó)白蛾種群的分化情況,以中國(guó)、美國(guó)不同地理種群的美國(guó)白蛾老熟幼蟲(chóng)為材料,采用分子標(biāo)記的方法,對(duì)美國(guó)白蛾COⅠ序列進(jìn)行了測(cè)定,并結(jié)合GeneBank中美國(guó)白蛾COI序列,通過(guò)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)對(duì)中國(guó)、美國(guó)、加拿大和匈牙利種群間的關(guān)系加以探究。兩部分研究的結(jié)論如下:1.經(jīng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序與拼接得到58,151條unigene,與9個(gè)公共數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì),共有21,689條unigene得到了注釋(37.3%),其中Nr數(shù)據(jù)庫(kù)注釋到的unigene最多(20,872,35.89%),且美國(guó)白蛾與家蠶(Bombyx mori)同源性最高(7,596,36.39%);將unigene與GO數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì),共注釋到16,734條unigene,分屬3大類(lèi),61個(gè)功能群;KEGG pathway分析表明,3,225條unigene定位到332個(gè)代謝通路。2.對(duì)unigene進(jìn)行篩選,取FDR≤0.001且log_2|Fold change|1的基因?yàn)椴町惐磉_(dá)基因。共得到差異表達(dá)基因32,464條,其中上調(diào)基因29,013條,下調(diào)基因3,451條。結(jié)合差異表達(dá)基因的表達(dá)量和現(xiàn)有研究結(jié)果,共篩選到MCM2、JHAMT、PRPCK、HSP20、FOXO3、PIK3R、SDH2等滯育相關(guān)基因。3.對(duì)中國(guó)10個(gè)地點(diǎn)種群和美國(guó)12個(gè)地理種群(紅頭型和黑頭型樣品)美國(guó)白蛾的COI序列進(jìn)行測(cè)序,得到709bp COI序列,其中變異位點(diǎn)46個(gè)。利用MEGA5.1分別采用最大進(jìn)似然法和鄰接法基于Kimura-2-Parameter模型構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),結(jié)果表明,除威斯康辛州和北卡羅納州黑頭型種群外,美國(guó)白蛾紅、黑頭型種群間存在較大差異,且中國(guó)種群COI序列相似度較高,分化不明顯。4.將中、美種群COI序列與GeneBank中加拿大和匈牙利種群的COI序列數(shù)據(jù)相結(jié)合,得到519bp的COI序列片段,采用相同方法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),可知,美國(guó)白蛾美國(guó)東部、中東部黑頭型種群,加拿大東南部種群和中國(guó)種群可聚為一枝,有著較近的親緣關(guān)系。
【學(xué)位授予單位】:沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類(lèi)號(hào)】:S763.42
本文編號(hào):2738048
【學(xué)位授予單位】:沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類(lèi)號(hào)】:S763.42
本文編號(hào):2738048
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/2738048.html
最近更新
教材專(zhuān)著