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甘藍型油菜TT8基因初步分析

發(fā)布時間:2020-06-30 17:06
【摘要】:目前還沒有發(fā)現(xiàn)天然的甘藍型黃籽油菜,現(xiàn)在栽培的甘藍型黃籽油菜主要是通過遠緣雜交、誘導突變等方法培育的。因為甘藍型油菜黃籽基因來源多樣,所以甘藍型油菜黃籽形成的機理還沒有闡釋清楚。但在芥菜型油菜、白菜型油菜中TT8基因是調(diào)控種皮顏色的關鍵基因。本實驗室通過芥菜型油菜黃籽材料(SY)與甘藍型油菜黑籽材料進行種間雜交,培育出黃籽性狀穩(wěn)定的甘藍型黃籽油菜。為了探索甘藍型油菜黃籽形成原因,選擇了4份甘藍型油菜進行全基因組重測序,分析甘藍型油菜黃籽與黑籽在基因組上的差異;根據(jù)SY的A染色體組TT8基因序列設計同源克隆引物,對10個甘藍型油菜材料進行同源克隆,分析甘藍型油菜黃籽與黑籽在TT8基因序列上是否存在差異,及其差異產(chǎn)生的原因。全基因組重測序比對發(fā)現(xiàn),甘藍型黃籽油菜中,有149 776個可能的芥菜型油菜SNP位點的導入片段。通過設置E值為1e-10,I值大于90%,比對長度200 bp以上,比對區(qū)間屬于J09,得到了在J09染色體上且符合黃籽區(qū)域27Mb~28Mb的scaffold區(qū)間有1125個。10份甘藍型油菜A基因組的TT8基因同源克隆測序,卻發(fā)現(xiàn)基因序列沒有差異。通過聚類分析,發(fā)現(xiàn)甘藍型油菜黑籽和黃籽存在組內(nèi)交叉,可能是來自不同親本緣故。在對授粉后15天種子中基因表達分析,發(fā)現(xiàn)ANS、ANR和DFR在甘藍型油菜黃籽和黑籽中都表達。本研究發(fā)現(xiàn)在甘藍型黑籽和黃籽材料中,A基因組TT8基因序列沒有改變,這與芥菜型油菜和白菜型油菜因為存在大片段插入而導致基因序列改變不同。通過種子中基因表達分析,推測黃籽種皮的類黃酮合成途徑可能比芥菜型油菜和白菜型油菜更加復雜。在后續(xù)的甘藍型黃籽形成原因的研究中,可以調(diào)整對其類黃酮合成途徑網(wǎng)絡和TT8基因上下游區(qū)域進行探索。
【學位授予單位】:湖南農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2018
【分類號】:S565.4

【參考文獻】

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本文編號:2735569

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