高溫脅迫下黃瓜基因的表達變化
發(fā)布時間:2020-06-14 13:12
【摘要】:黃瓜(CucumissativusL.,2n=2x=14)是葫蘆科甜瓜屬一年生攀緣性草本植物,是世界上普遍栽培的一種瓜類作物,也是我國種植范圍最廣的主要蔬菜作物之一。隨著全球氣候的日趨變暖,高溫熱害給黃瓜的生產(chǎn)帶來的影響日益嚴重,已經(jīng)成為我國黃瓜生產(chǎn)中急需解決的難題之一。有關黃瓜熱害分子機理尚缺乏系統(tǒng)、深入的研究。本研究在對八十份黃瓜種質(zhì)資源進行耐熱性鑒定與篩選的基礎上,以黃瓜耐高溫品系'GY2'為試材,運用RNA-seq技術,分析了 43(±1)℃高溫脅迫6h(T1)和12h(T2)全基因組轉(zhuǎn)錄組水平上的差異,對候選基因在耐高溫品系'GY2'和高溫敏感品系'平望乳瓜'中進行表達驗證。主要研究結果如下:1.高溫脅迫處理后對兩個時間點進行差異表達基因進行分析,一共得到6063個差異表達基因。其中,43℃條件下處理6 h有3196個基因差異表達,1702個基因上調(diào)表達,1494個下調(diào)表達;處理12 h有4711個基因差異表達,2038個上調(diào)表達,2673個下調(diào)表達。2.通過對差異基因GO富集、KEGG通路分析,并結合黃瓜基因組數(shù)據(jù)庫的功能注釋,我們發(fā)現(xiàn)黃瓜響應高溫脅迫的基因主要集中在光合作用、熱激轉(zhuǎn)錄因子和熱激蛋白等3大類,結合功能注釋共確定耐高溫候選基因18個用于qRT-PCR分析。3.18個候選基因在耐高溫品系'GY2'與高溫敏感型品系'平望乳瓜'中表達驗證結果表明,其中的6個基因可能與黃瓜應答耐熱脅迫相關,包括2個熱激轉(zhuǎn)錄因子基因和4個熱激蛋白相關基因。6個候選基因在'GY2'中隨著高溫脅迫的時間延長表達量明顯逐漸增加,而在'平望乳瓜'中,表達量無明顯變化;CsalG467710在耐/敏高溫品系中均上調(diào)表達,不同溫度下在'GY2'中該基因的表達量均顯著高于平望乳瓜。初步認為,CsalG467710在黃瓜應答高溫脅迫中具有重要作用。
【學位授予單位】:揚州大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2018
【分類號】:S642.2
【圖文】:
“rRNAprocessing”和“responseto邋heat”富集顯著(圖邋2-3);邋T2邋中的差異基因“photosynthesis,逡逑light邋harvesting”、“response邋to邋heat”富集顯著(圖2-4)。由此可見,高溫脅迫過程中,光合逡逑作用、抵抗熱害與蛋白質(zhì)折疊相關的功能基因與高溫熱害聯(lián)系更緊密。逡逑對差異基因進行KEGG分析顯示高溫脅迫處理共涉及到110個通路,通過富集顯著性逡逑分析在表2-3給出了富集最顯著的10個通路,主要涉及光合作用、碳固定與植物激素信號逡逑
邐Molecular邋function邐Biological邋process逡逑圖2-2差異表達基因GO注釋分類統(tǒng)計圖逡逑Figure邋2-2邋Classification邋of邋differentially邋expressed邋genes邋GO邋annotations逡逑注:橫坐標為GO分類,縱坐標左邊為基因數(shù)目所占百分比,右邊為基因數(shù)Q。辶x希牽埃海埃埃埃福保擔埃義希攏椋錚歟錚紓椋悖幔戾澹穡潁錚悖澹螅簀義希牽埃海埃埃埃福保擔插危危牽埃海埃埃埃梗梗福峰危牽埃海埃埃擔埃福梗跺義希恚澹簦幔猓錚歟椋沐澹穡潁錚悖澹螅簀澹危悖澹歟歟酰歟幔蟈澹穡潁錚悖澹螅簀危潁澹螅穡錚睿螅邋澹簦镥澹螅簦椋恚酰歟酰簀義,逦_弪q、''辶x希懾危保危
本文編號:2712833
【學位授予單位】:揚州大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2018
【分類號】:S642.2
【圖文】:
“rRNAprocessing”和“responseto邋heat”富集顯著(圖邋2-3);邋T2邋中的差異基因“photosynthesis,逡逑light邋harvesting”、“response邋to邋heat”富集顯著(圖2-4)。由此可見,高溫脅迫過程中,光合逡逑作用、抵抗熱害與蛋白質(zhì)折疊相關的功能基因與高溫熱害聯(lián)系更緊密。逡逑對差異基因進行KEGG分析顯示高溫脅迫處理共涉及到110個通路,通過富集顯著性逡逑分析在表2-3給出了富集最顯著的10個通路,主要涉及光合作用、碳固定與植物激素信號逡逑
邐Molecular邋function邐Biological邋process逡逑圖2-2差異表達基因GO注釋分類統(tǒng)計圖逡逑Figure邋2-2邋Classification邋of邋differentially邋expressed邋genes邋GO邋annotations逡逑注:橫坐標為GO分類,縱坐標左邊為基因數(shù)目所占百分比,右邊為基因數(shù)Q。辶x希牽埃海埃埃埃福保擔埃義希攏椋錚歟錚紓椋悖幔戾澹穡潁錚悖澹螅簀義希牽埃海埃埃埃福保擔插危危牽埃海埃埃埃梗梗福峰危牽埃海埃埃擔埃福梗跺義希恚澹簦幔猓錚歟椋沐澹穡潁錚悖澹螅簀澹危悖澹歟歟酰歟幔蟈澹穡潁錚悖澹螅簀危潁澹螅穡錚睿螅邋澹簦镥澹螅簦椋恚酰歟酰簀義,逦_弪q、''辶x希懾危保危
本文編號:2712833
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