【摘要】：第一部分雌激素受體陽性絕經(jīng)后乳腺癌肥胖相關基因的GEO數(shù)據(jù)分析及驗證背景與目的:乳腺癌是如今世界各地女性中最常見的惡性腫瘤之一。而肥胖會使絕經(jīng)后乳腺癌的發(fā)病風險增高,BMI指數(shù)每增加1個單位,絕經(jīng)后的女性患乳腺癌的風險會增加2%。另外肥胖對絕經(jīng)前和絕經(jīng)后患者的預后都有負面影響,但影響最顯著的是雌激素受體陽性的絕經(jīng)后患者,這一發(fā)現(xiàn)由德國BRENDA隊列的回顧性分析證實。本研究利用GEO公共數(shù)據(jù)庫下載的乳腺癌基因芯片數(shù)據(jù),以期探索肥胖與雌激素受體陽性絕經(jīng)后乳腺癌的相關基因。方法:1基因表達譜數(shù)據(jù)分析在基于R語言的Bioconductor平臺上數(shù)據(jù)的預處理之后,進行篩選差異表達基因、GO(gene ontology)分析、聚類分析和KEGG Pathway分析等步驟。2實時熒光定量PCR方法采用SYBR法實時熒光定量PCR檢測96對組織標本中COL1A2、MMP14、SLC26A3基因mRNA表達水平。3 Western blotting 方法隨機選取6對肥胖組乳腺癌和6對非肥組乳腺癌組織標本,提取總蛋白,進行 Western blotting 檢測。結果:1.基因芯片數(shù)據(jù)分析最終共篩選出差異表達基因566個,肥胖雌激素受體陽性絕經(jīng)后乳腺癌有342個基因表達上調,224個基因表達下調。2.目的基因mRNA表達水平檢測COL1A2基因的mRNA表達水平在61.4%的乳腺癌組織中上調(59/96,P=0.046),在肥胖組中mRNA相對表達量明顯高于非肥胖組(P=0.013)。MMP14基因的mRNA表達水平在55.2%的癌組織中上調(53/96,P0.0002),在肥胖組中mRNA相對表達量明顯高于非肥胖組(P=0.003)。SLC26A3基因的mRNA表達水平在78.1%的癌組織中下調(75/96,P=0.0085),在肥胖組中mRNA相對表達量明顯低于非肥胖組(P=0.008)。3.Western blotting檢測COL1A2蛋白表達水平相對于癌旁組織,乳腺癌組織中的COL1A2蛋白表達量更高;相對于非肥胖組乳腺癌組織,肥胖組的COL1A2蛋白相對表達量更高。結論:1、基因芯片數(shù)據(jù)分析結果顯示,肥胖雌激素受體陽性絕經(jīng)后乳腺癌的差異表達基因主要與金屬肽酶活性、膠原代謝過程等23種細胞功能有關;KEGG Pathway分析顯示差異表達基因主要參與的信號通路有:PDGF信號通路,血小板的激活觸發(fā)等。2、COL1A2基因可能是肥胖雌激素受體陽性絕經(jīng)后乳腺癌的相關基因及潛在的治療靶點。第二部分 循環(huán)腫瘤DNA檢測及其在乳腺癌中的臨床應用隨著檢測技術的精進,循環(huán)腫瘤DNA在腫瘤的早期診斷、預后評估、療效及腫瘤負荷監(jiān)測等方面有著非常廣闊的應用前景。同時,乳腺癌的化療、靶向治療和內分泌治療將更加個體化及針對性。
【圖文】：

圖３－１差異表達基因監(jiān)督層次聚類分析圖逡逑Ｓｕｐｅｒｖｉｓｅｄ邋Ｃｌｕｓｔｅｒ邋Ａｎａｌｙｓｉｓ邋ｏｆ邋Ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ邋Ｅｘｐｒｅｓ邋ｃｌｕｓｔｅｒｉｎｇ邋ｏｆ邋５６６邋ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ邋ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ邋ｇｅｎｅｓ邋ｖｅａｌｅｄ邋ｃｌｅａｒ邋ｐａｔｔｅｒｎ邋ｏｆ邋ｇｅｎｅｓ邋ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ邋ｉｎ邋ｏｂｅｓｉｔｙｅｓ邋ｗｅｒｅ邋ｄｅｎｏｔｅｄ邋ｉｎ邋ｃｏｌｕｍｎｓ邋ａｎｄ邋ｇｅｎｅｓ邋ｗｅｒｅ邋ｄｈ邋ｇｅｎｅｓ邋ａｃｒｏｓｓ邋ｔｈｅ邋ｓａｍｐｌｅ邋ｉｓ邋ｓｃａｌｅｄ邋ｔｏ邋［－６，，４］邋ｉｎｔｐｉｃｔｅｄ邋ｕｓｉｎｇ邋ａ邋ｃｏｌｏｒ邋ｓｃａｌｅ邋ａｓ邋ｓｈｏｗｎ邋ａｔ邋ｔｈｅ邋ｔｏｐ邋ｏｆ邋ｔｈｅｉｃａｔｅｄ邋ｉｎ邋ｒｅｄ，邋ａｎｄ邋ｌｏｗｌｙ邋ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ邋ｉｎ邋ｇｒｅｅｎ．逡逑
【學位授予單位】：南方醫(yī)科大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2018
【分類號】：R737.9

【參考文獻】

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6 張思維;雷正龍;李光琳;鄒小農;趙平;陳萬青;;中國腫瘤登記地區(qū)2006年腫瘤發(fā)病和死亡資料分析[J];中國腫瘤;2010年06期

7 張思維;雷正龍;李光琳;鄒小農;陳萬青;趙平;;中國腫瘤登記地區(qū)2005年發(fā)病死亡資料分析[J];中國腫瘤;2009年12期

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10 張思維;陳萬青;雷正龍;鄒小農;趙平;;中國腫瘤登記處2004年惡性腫瘤發(fā)病資料分析[J];中國腫瘤;2008年11期

本文編號：2682247