發(fā)布時(shí)間：2020-05-25 22:04

【摘要】：在癌與正常組織樣本間識(shí)別差異表達(dá)的基因是腫瘤研究最基礎(chǔ)的分析。然而,目前廣泛使用的差異表達(dá)基因分析方法僅能識(shí)別其表達(dá)水平在兩類(lèi)樣本間存在統(tǒng)計(jì)差異的基因,即群體水平的差異表達(dá)基因,而無(wú)法判斷這些群體差異表達(dá)基因在病人個(gè)體中的差異表達(dá)情況。癌與癌旁配對(duì)組織樣本數(shù)據(jù)是一類(lèi)特殊的數(shù)據(jù),這類(lèi)數(shù)據(jù)可以反映基因在癌組織樣本參照自身癌旁正常組織樣本中表達(dá)水平的相對(duì)改變量。在本研究中,我們首先在群體水平上識(shí)別出了食管鱗狀細(xì)胞癌組織相對(duì)正常組織在群體水平上的差異基因。然后,收集117對(duì)食管鱗狀細(xì)胞癌組織和配對(duì)的癌旁正常組織的基因表達(dá)譜數(shù)據(jù),通過(guò)直接比較基因在配對(duì)組織中的表達(dá)水平,確定了群體差異表達(dá)基因在每個(gè)病人癌組織相較自身正常組織中的表達(dá)變化,進(jìn)而刻畫(huà)了群體差異表達(dá)基因在食管鱗狀細(xì)胞癌病人群體中的差異表達(dá)頻率。在此基礎(chǔ)上,我們發(fā)現(xiàn)有些基因在高達(dá)99.14%以上的食管鱗狀細(xì)胞癌病人的癌組織中相較自身正常組織發(fā)生了相同方向的差異表達(dá)。據(jù)此,我們提出了食管鱗狀細(xì)胞癌中普遍異常表達(dá)基因的概念,并識(shí)別出170個(gè)(包括141個(gè)上調(diào)表達(dá)和29個(gè)下調(diào)表達(dá))食管鱗狀細(xì)胞癌中普遍異常表達(dá)的基因。這些基因至少在95.73%病人的癌組織中相較配對(duì)癌旁組織發(fā)生同樣的差異表達(dá),是食管組織發(fā)生鱗狀細(xì)胞癌變時(shí)在分子水平上的共性改變。在這些食管鱗狀細(xì)胞癌中普遍異常表達(dá)的基因中,包括一些編碼激酶的基因,例如參與細(xì)胞周期中DNA損傷響應(yīng)的CHEK1和ATR基因,及與癌細(xì)胞的增殖與凋亡密切相關(guān)參與細(xì)胞有絲分裂的AURKA與AURKB等。此外,編碼中心體蛋白55的CEP55基因在病人群體中的上調(diào)頻率為97.44%(95%,CI:92.73%~99.12%)。由于CEPP55在胃癌中的高表達(dá)有促進(jìn)癌細(xì)胞增殖的作用,推測(cè)其在食管鱗狀細(xì)胞癌中的高表達(dá)也有相同的作用,那么以CEP55為靶點(diǎn)設(shè)計(jì)藥物來(lái)抑制其在食管鱗狀細(xì)胞癌中的表達(dá),則會(huì)抑制癌細(xì)胞的增殖。由于CEP55在食管鱗狀細(xì)胞癌中普遍上調(diào),因此是一個(gè)值得探索的藥物候選靶標(biāo)。綜上所述,通過(guò)識(shí)別在食管鱗狀細(xì)胞癌中普遍異常表達(dá)基因,可以為研究食管鱗狀細(xì)胞癌發(fā)病的分子機(jī)制以及疾病的治療提供新線(xiàn)索。
【圖文】：

間接受到網(wǎng)絡(luò)中的兩個(gè)關(guān)鍵節(jié)點(diǎn) CDK1 和 CDK2 的下調(diào)調(diào)控（如圖3.1 所示）。作為食管鱗狀細(xì)胞癌中的一個(gè)普遍下調(diào)表達(dá)基因，KAT2B 在 97.44%（95%，，CI:92.73%~99.12%）的病人癌組織中較癌旁正常組織發(fā)生了下調(diào)表達(dá)。該基因上游的 CDK1[25-31]和 CDK2[32-35]同屬于 CDK 家族，即周期蛋白依賴(lài)性激
【學(xué)位授予單位】：福建醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2018
【分類(lèi)號(hào)】：R735.1

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前2條

1 Kyle J Napier;Mary Scheerer;Subhasis Misra;;Esophageal cancer: A Review of epidemiology, pathogenesis, staging workup and treatment modalities[J];World Journal of Gastrointestinal Oncology;2014年05期

2 王玉祥;祝淑釵;封巍;李娟;蘇景偉;李任;;CHK1和CHK2 shRNA轉(zhuǎn)染對(duì)食管癌細(xì)胞照射后G_2期阻滯的影響[J];中華腫瘤雜志;2006年08期

本文編號(hào)：2680808