【摘要】：在癌與正常組織樣本間識別差異表達的基因是腫瘤研究最基礎的分析。然而,目前廣泛使用的差異表達基因分析方法僅能識別其表達水平在兩類樣本間存在統(tǒng)計差異的基因,即群體水平的差異表達基因,而無法判斷這些群體差異表達基因在病人個體中的差異表達情況。癌與癌旁配對組織樣本數(shù)據(jù)是一類特殊的數(shù)據(jù),這類數(shù)據(jù)可以反映基因在癌組織樣本參照自身癌旁正常組織樣本中表達水平的相對改變量。在本研究中,我們首先在群體水平上識別出了食管鱗狀細胞癌組織相對正常組織在群體水平上的差異基因。然后,收集117對食管鱗狀細胞癌組織和配對的癌旁正常組織的基因表達譜數(shù)據(jù),通過直接比較基因在配對組織中的表達水平,確定了群體差異表達基因在每個病人癌組織相較自身正常組織中的表達變化,進而刻畫了群體差異表達基因在食管鱗狀細胞癌病人群體中的差異表達頻率。在此基礎上,我們發(fā)現(xiàn)有些基因在高達99.14%以上的食管鱗狀細胞癌病人的癌組織中相較自身正常組織發(fā)生了相同方向的差異表達。據(jù)此,我們提出了食管鱗狀細胞癌中普遍異常表達基因的概念,并識別出170個(包括141個上調(diào)表達和29個下調(diào)表達)食管鱗狀細胞癌中普遍異常表達的基因。這些基因至少在95.73%病人的癌組織中相較配對癌旁組織發(fā)生同樣的差異表達,是食管組織發(fā)生鱗狀細胞癌變時在分子水平上的共性改變。在這些食管鱗狀細胞癌中普遍異常表達的基因中,包括一些編碼激酶的基因,例如參與細胞周期中DNA損傷響應的CHEK1和ATR基因,及與癌細胞的增殖與凋亡密切相關參與細胞有絲分裂的AURKA與AURKB等。此外,編碼中心體蛋白55的CEP55基因在病人群體中的上調(diào)頻率為97.44%(95%,CI:92.73%~99.12%)。由于CEPP55在胃癌中的高表達有促進癌細胞增殖的作用,推測其在食管鱗狀細胞癌中的高表達也有相同的作用,那么以CEP55為靶點設計藥物來抑制其在食管鱗狀細胞癌中的表達,則會抑制癌細胞的增殖。由于CEP55在食管鱗狀細胞癌中普遍上調(diào),因此是一個值得探索的藥物候選靶標。綜上所述,通過識別在食管鱗狀細胞癌中普遍異常表達基因,可以為研究食管鱗狀細胞癌發(fā)病的分子機制以及疾病的治療提供新線索。
【圖文】：

間接受到網(wǎng)絡中的兩個關鍵節(jié)點 CDK1 和 CDK2 的下調(diào)調(diào)控（如圖3.1 所示）。作為食管鱗狀細胞癌中的一個普遍下調(diào)表達基因，KAT2B 在 97.44%（95%，，CI:92.73%~99.12%）的病人癌組織中較癌旁正常組織發(fā)生了下調(diào)表達。該基因上游的 CDK1[25-31]和 CDK2[32-35]同屬于 CDK 家族，即周期蛋白依賴性激
【學位授予單位】：福建醫(yī)科大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2018
【分類號】：R735.1

【參考文獻】

相關期刊論文 前2條

1 Kyle J Napier;Mary Scheerer;Subhasis Misra;;Esophageal cancer: A Review of epidemiology, pathogenesis, staging workup and treatment modalities[J];World Journal of Gastrointestinal Oncology;2014年05期

2 王玉祥;祝淑釵;封巍;李娟;蘇景偉;李任;;CHK1和CHK2 shRNA轉(zhuǎn)染對食管癌細胞照射后G_2期阻滯的影響[J];中華腫瘤雜志;2006年08期

本文編號：2680808