樺褐孔菌三磷酸甘油醛脫氫酶基因及啟動(dòng)子的克隆與分析
【圖文】:
2.1三磷酸甘油醛脫氫酶基因全長(zhǎng)的克隆逡逑2.1.1樺褐孔菌總RNA的提取逡逑使用Trizol改良法提取樺褐孔菌總RNA邋(如圖1所示),圖中28S、18S清逡逑晰可見(jiàn),且28S條帶亮度是18S條帶亮度的兩倍,說(shuō)明RNA完整降解少,效率逡逑高,可用于進(jìn)行后續(xù)試驗(yàn)。逡逑:二逡逑y:二:逡逑圖1樺褐孔菌總RNA電泳檢測(cè)圖逡逑Fig.l邋Total邋RNA邋agarose邋gel邋electrophoresis邋of邋Inonotus邋obliquus逡逑2.1.2三磷酸甘油醛脫氫酶基因片段的克隆逡逑將提取的樺褐孔菌總RNA進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄合成cDNA第一條鏈,以此為模板進(jìn)逡逑行簡(jiǎn)并PCR擴(kuò)增,獲得GPD基因片段與預(yù)期大小相一致(如圖2所示)。基因逡逑片段測(cè)序結(jié)果表明,GPD基因片段長(zhǎng)945邋bp,基因比對(duì)結(jié)果顯示,三磷酸甘油逡逑醛脫氫酶基因片段與云芝(XM_008041897.1邋)基因相似性為97%,因此,初步逡逑判定該基因片段為樺褐孔菌的GPD基因片段。逡逑M123邐4567逡逑500邋bp—?邋■逡逑圖2樺褐孔菌GPD基因片段的電泳檢測(cè)圖逡逑Fig.2邋Agarose邋gel邋electrophoresis邋of邋fragments邋of邋GPD
根據(jù)獲得的GPD基因片段設(shè)計(jì)基因特異性引物,將提取的總RNA按照逡逑RACE試劑盒的要求進(jìn)行cDNA第一條鏈的合成,然后進(jìn)行PCR擴(kuò)增獲得GPD逡逑基因的51端和端(如圖3所示),將其進(jìn)行回收、連接、轉(zhuǎn)化等操作后送去測(cè)逡逑序。逡逑M邋1邐2邐M邋1邐2逡逑2000bP—?邐sE二邐焌灥奏看逡逑B1邐B2逡逑圖3樺褐孔菌GPD基因的5HACE和TRACE電泳圖逡逑Fig.3邋Agarose邋gel邋electrophoresis邋of邋5邋^RACE邋and邋3邋^ACE邋of邋GPD邋gene逡逑M:邋DL2000邋marker;邋Bl:邋5,RACE邋產(chǎn)物;B2:邋3,RACE邋產(chǎn)物逡逑M:邋DL2000marker;邋B1:邋Products邋of邋5'RACE;邋B2:邋Products邋of邋3fRACE逡逑2.1.4三磷酸甘油醛脫氫酶基因全長(zhǎng)的克隆逡逑將擴(kuò)增得到的保守區(qū)片段與RACE克隆獲得5'端和3'端序列進(jìn)行拼接,并根逡逑據(jù)拼接結(jié)果設(shè)計(jì)用于克隆三磷酸甘油醛脫氫酶基因全長(zhǎng)的特異性引物,以cDNA逡逑為模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增(如圖4所示),將PCR產(chǎn)物進(jìn)行切膠、回收、連接轉(zhuǎn)逡逑化和菌液檢測(cè)后送去測(cè)序。三磷酸甘油醛脫氫酶基因全長(zhǎng)測(cè)序結(jié)果表明基因編碼逡逑區(qū)序列與序列拼接結(jié)果一致。三磷酸甘油醛脫氫酶基因的全長(zhǎng)序列為1223邋bp,逡逑GenBank登錄號(hào)為KX986801.],因此可以確定克隆得到了三磷酸甘油醛脫氫酶逡逑基因的全長(zhǎng)序列,,將其命名為/0G/>£>?
【學(xué)位授予單位】:延邊大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:S567.3
【參考文獻(xiàn)】
相關(guān)期刊論文 前10條
1 隋飛飛;陳艷秋;;樺褐孔菌β-葡萄糖苷酶基因的克隆與定量表達(dá)分析[J];食用菌學(xué)報(bào);2015年03期
2 劉蒙蒙;宋超;邢詠梅;郭順星;;藥用真菌豬苓4種小GTPase基因的克隆和表達(dá)分析[J];藥學(xué)學(xué)報(bào);2015年09期
3 鄭苗苗;張令昂;焦戰(zhàn)戰(zhàn);邵淑麗;;紅平菇HP1錳過(guò)氧化物酶基因克隆及染料脫色的研究[J];西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào);2015年04期
4 尹勇剛;隋飛飛;陳艷秋;;樺褐孔菌漆酶基因片段的克隆與序列分析[J];吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);2014年05期
5 周莉莉;陳瑞琴;陳秀蘭;曾胤新;陳波;;應(yīng)用hiTAIL-PCR技術(shù)克隆Marinomonas sp.BSi20584菌株β-半乳糖苷酶基因[J];極地研究;2013年03期
6 傅常娥;郭曉帆;隋飛飛;閆可;陳艷秋;;樺褐孔菌菌株遺傳多樣性分析方法的比較[J];延邊大學(xué)農(nóng)學(xué)學(xué)報(bào);2013年01期
7 康丹;方小艷;游騰飛;王婷婷;眭安平;楊星勇;;染色體步移技術(shù)克隆已知序列側(cè)翼啟動(dòng)子的研究進(jìn)展[J];農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào);2013年03期
8 張如平;姚建南;李國(guó)立;李良昌;;樺褐孔菌多糖抗哮喘作用實(shí)驗(yàn)研究[J];當(dāng)代醫(yī)學(xué);2012年35期
9 閆可;尹勇剛;傅常娥;郭曉帆;陳艷秋;;樺褐孔菌菌株遺傳多樣性的ISSR分析[J];食用菌學(xué)報(bào);2012年02期
10 聶燕華;林俊芳;王杰;尤琳烽;郭麗瓊;;銀耳芽孢內(nèi)源gpd啟動(dòng)子的克隆與功能鑒定[J];食用菌學(xué)報(bào);2012年02期
本文編號(hào):2678874
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/2678874.html