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樺褐孔菌三磷酸甘油醛脫氫酶基因及啟動(dòng)子的克隆與分析

發(fā)布時(shí)間:2020-05-24 19:26
【摘要】:樺褐孔菌Inonotus obliquus(Ach.ex Pers.)Pilat屬銹革孔菌科,纖孔菌屬,主要成分有多糖、樺褐孔菌醇、樺褐孔菌素、三萜類化合物等,具有抗癌、降血糖、降血脂、抗氧化等多種藥用功能。三磷酸甘油醛脫氫酶(GPD)是維持生命活動(dòng)最基本的酶之一,參與組織中的糖酵解過(guò)程,常用于真菌的逆境脅迫和菌種的分類鑒定。GPD啟動(dòng)子含有TATA box、CART box和一個(gè)多CT序列,具有很強(qiáng)的調(diào)控異源基因轉(zhuǎn)錄的功能,目前GPD啟動(dòng)子已經(jīng)作為外源基因啟動(dòng)子用于轉(zhuǎn)化香菇、平菇、草菇、雙孢菇、靈芝等。本試驗(yàn)以樺褐孔菌為試驗(yàn)材料,克隆GPD基因及啟動(dòng)子序列,并對(duì)其進(jìn)行分析,為樺褐孔菌菌株的分類鑒定、功能研究及高效表達(dá)載體的建立提供基因資源。1.使用簡(jiǎn)并引物PCR和RACE技術(shù)克隆了樺褐孔菌GPD基因(IoGPD)的全長(zhǎng)序列,其長(zhǎng)度為1223 bp,編碼339個(gè)氨基酸。2.氨基酸序列分析表明,IoGPD沒(méi)有信號(hào)肽序列,定位于細(xì)胞質(zhì),屬于3-磷酸甘油醛脫氫酶家族中的I型。3.對(duì)IoGPD編碼的氨基酸序列進(jìn)行相似性搜索,結(jié)果顯示IoGPD與真菌的GPD同源,與同屬纖孔菌屬的鮑姆桑黃和同為銹革孔菌科的地中海嗜藍(lán)孢孔菌GPD蛋白相似性最高,達(dá)88%。4.利用染色體步移技術(shù)從樺褐孔菌JL01菌株中成功克隆獲得了 IoGPD啟動(dòng)子序列446 bp。5.序列分析結(jié)果表明IoGPD啟動(dòng)子在152 bp和160 bp處有兩個(gè)轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn),含有TATA、CAAT、CCAATbox等啟動(dòng)子基本元件,而且還包括調(diào)控低溫、光照、生理晝夜節(jié)律控制和參與蛋白代謝調(diào)節(jié)等重要順式作用元件LTR、02-site、circadian、Sp1、TCCC-motif等。
【圖文】:

三磷酸甘油醛,脫氫酶基因,基因,醛脫氫酶基因


2.1三磷酸甘油醛脫氫酶基因全長(zhǎng)的克隆逡逑2.1.1樺褐孔菌總RNA的提取逡逑使用Trizol改良法提取樺褐孔菌總RNA邋(如圖1所示),圖中28S、18S清逡逑晰可見(jiàn),且28S條帶亮度是18S條帶亮度的兩倍,說(shuō)明RNA完整降解少,效率逡逑高,可用于進(jìn)行后續(xù)試驗(yàn)。逡逑:二逡逑y:二:逡逑圖1樺褐孔菌總RNA電泳檢測(cè)圖逡逑Fig.l邋Total邋RNA邋agarose邋gel邋electrophoresis邋of邋Inonotus邋obliquus逡逑2.1.2三磷酸甘油醛脫氫酶基因片段的克隆逡逑將提取的樺褐孔菌總RNA進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄合成cDNA第一條鏈,以此為模板進(jìn)逡逑行簡(jiǎn)并PCR擴(kuò)增,獲得GPD基因片段與預(yù)期大小相一致(如圖2所示)。基因逡逑片段測(cè)序結(jié)果表明,GPD基因片段長(zhǎng)945邋bp,基因比對(duì)結(jié)果顯示,三磷酸甘油逡逑醛脫氫酶基因片段與云芝(XM_008041897.1邋)基因相似性為97%,因此,初步逡逑判定該基因片段為樺褐孔菌的GPD基因片段。逡逑M123邐4567逡逑500邋bp—?邋■逡逑圖2樺褐孔菌GPD基因片段的電泳檢測(cè)圖逡逑Fig.2邋Agarose邋gel邋electrophoresis邋of邋fragments邋of邋GPD

電泳圖,電泳圖,三磷酸甘油醛,脫氫酶基因


根據(jù)獲得的GPD基因片段設(shè)計(jì)基因特異性引物,將提取的總RNA按照逡逑RACE試劑盒的要求進(jìn)行cDNA第一條鏈的合成,然后進(jìn)行PCR擴(kuò)增獲得GPD逡逑基因的51端和端(如圖3所示),將其進(jìn)行回收、連接、轉(zhuǎn)化等操作后送去測(cè)逡逑序。逡逑M邋1邐2邐M邋1邐2逡逑2000bP—?邐sE二邐焌灥奏看逡逑B1邐B2逡逑圖3樺褐孔菌GPD基因的5HACE和TRACE電泳圖逡逑Fig.3邋Agarose邋gel邋electrophoresis邋of邋5邋^RACE邋and邋3邋^ACE邋of邋GPD邋gene逡逑M:邋DL2000邋marker;邋Bl:邋5,RACE邋產(chǎn)物;B2:邋3,RACE邋產(chǎn)物逡逑M:邋DL2000marker;邋B1:邋Products邋of邋5'RACE;邋B2:邋Products邋of邋3fRACE逡逑2.1.4三磷酸甘油醛脫氫酶基因全長(zhǎng)的克隆逡逑將擴(kuò)增得到的保守區(qū)片段與RACE克隆獲得5'端和3'端序列進(jìn)行拼接,并根逡逑據(jù)拼接結(jié)果設(shè)計(jì)用于克隆三磷酸甘油醛脫氫酶基因全長(zhǎng)的特異性引物,以cDNA逡逑為模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增(如圖4所示),將PCR產(chǎn)物進(jìn)行切膠、回收、連接轉(zhuǎn)逡逑化和菌液檢測(cè)后送去測(cè)序。三磷酸甘油醛脫氫酶基因全長(zhǎng)測(cè)序結(jié)果表明基因編碼逡逑區(qū)序列與序列拼接結(jié)果一致。三磷酸甘油醛脫氫酶基因的全長(zhǎng)序列為1223邋bp,逡逑GenBank登錄號(hào)為KX986801.],因此可以確定克隆得到了三磷酸甘油醛脫氫酶逡逑基因的全長(zhǎng)序列,,將其命名為/0G/>£>?
【學(xué)位授予單位】:延邊大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:S567.3

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2678874

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