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小麥MATE轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因的克隆及功能研究

發(fā)布時(shí)間:2020-05-22 19:47
【摘要】:多藥物及有毒化合物外排轉(zhuǎn)運(yùn)家族(Multidrug And Toxic Compound Extrusion Family,MATE)蛋白是五類外排轉(zhuǎn)運(yùn)家族蛋白之一,在各種生物體中起著重要作用。近年來,模式植物擬南芥中MATE家族蛋白研究也逐漸增多,但目前尚無小麥中該類蛋白研究的報(bào)道。本研究以一個(gè)小麥MATE家族轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白AK336065為研究對象,通過生物信息學(xué)、分子生物學(xué)、遺傳學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)等方法對其進(jìn)行克隆和功能研究。獲得以下實(shí)驗(yàn)結(jié)果:(1)構(gòu)建小麥、人、酵母、擬南芥MATE家族轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化樹,發(fā)現(xiàn)它們之間具有較高的同源性。(2)通過將AK336065蛋白與已報(bào)道的古細(xì)菌PfMATE蛋白進(jìn)行同源性序列比對,結(jié)果顯示二者具有較高同源性。根據(jù)PfMATE蛋白12個(gè)跨膜域的位置,預(yù)測了AK336065蛋白的12個(gè)跨膜域。通過蛋白亞細(xì)胞定位實(shí)驗(yàn),發(fā)現(xiàn)AK336065蛋白與晚期內(nèi)體的定位蛋白ARA7有大部分信號重合,表明AK336065蛋白主要定位于晚期內(nèi)體,推測AK336065蛋白可能參與細(xì)胞內(nèi)體介導(dǎo)的生物學(xué)過程。(3)通過構(gòu)建二元載體,并通過農(nóng)桿菌介導(dǎo)遺傳轉(zhuǎn)化,獲得AK336065過表達(dá)轉(zhuǎn)基因植株系。AK336065基因過表達(dá)導(dǎo)致野生型擬南芥開花時(shí)間提前、葉片衰老加劇、蓮座葉矮化叢生等。在碳饑餓誘導(dǎo)植物衰老體系實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn),AK336065基因促進(jìn)植物葉片衰老,表明AK336065基因參與了葉片衰老調(diào)控,是衰老的正調(diào)控因子。(4)發(fā)現(xiàn)AK336065過表達(dá)轉(zhuǎn)基因植株表型與實(shí)驗(yàn)室研究的abs3-1D突變體表型較一致,而且根據(jù)進(jìn)化分析,AK336065與ABS3、ABS4、ABS3L1、ABS3L2屬同一進(jìn)化分支,猜測它們彼此的功能具有相似性。通過將AK336065基因在mateq突變體中過表達(dá),發(fā)現(xiàn)其可以將mateq突變體表型回復(fù)至類似于abs3-1D突變體表型。表明AK336065與ABS3及其同源基因功能相似。(5)小麥AK336065蛋白可能作為一種自噬受體與小麥ATG8自噬家族蛋白具有保守的特異性相互作用。構(gòu)建BiFC載體通過原生質(zhì)體表達(dá),發(fā)現(xiàn)AK336065蛋白與TaATG8d蛋白存在物理互作。通過預(yù)測AK336065蛋白AIM區(qū)、丙氨酸取代實(shí)驗(yàn)及雙分子熒光互補(bǔ)實(shí)驗(yàn)來驗(yàn)證這兩個(gè)蛋白互作發(fā)生的特異性。實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)將AK336065蛋白中預(yù)測的兩個(gè)AIM1、AIM2定點(diǎn)突變后,AK336065~(AIM1+AIM2)與TaATG8d蛋白互作受到明顯抑制。表明AK336065蛋白的AIM1、AIM2在與TaATG8d蛋白特異性互作中起重要作用。
【圖文】:

家族,擬南芥,酵母,進(jìn)化樹


圖 2-1AK336065 與人、酵母、擬南芥 MATE 蛋白家族進(jìn)化樹ig 2-1 Phylogenetic tree of AK336065 and Human, Yeast, and Arabidopsis MAtransporter family6065 在人、酵母、擬南芥 MATE 家族蛋白中的進(jìn)化位置;藍(lán)框?yàn)榻湍?YD、小麥 MATE 家族蛋白中的進(jìn)化位置;綠框?yàn)槿?hMATE1、hMATE2 在酵小麥 MATE 家族蛋白中的進(jìn)化位置,比例尺代表氨基酸替換率me circle was the phylogenetic position of AK336065 in the human, yeast andin family; The blue frame circle was the phylogenetic position of yeast YDR33, Arabidopsis and wheat MATE protein family; The green frame circle was the uman hMATE1、hMATE2 in the yeast, Arabidopsis and wheat MATE protein scale showed amino acid replacement rates. MATE 蛋白同源性比對列比對軟件,輸出結(jié)果相同區(qū)域和相似區(qū)域分別用黑色和灰色陰對結(jié)果可以看出 AK336065 與 PfMATE 相似度較高,并根白的 12 個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域來推測 AK336065 的可能跨膜結(jié)構(gòu)域(圖

同源性,蛋白,亞細(xì)胞定位,體循環(huán)系統(tǒng)


圖 2-2AK336065 與 PfMATE 蛋白同源性比對及跨膜結(jié)構(gòu)域預(yù)測Fig 2-2 Homologous alignment result of AK336065 with PfMATE protein and theresult of transmembrane domains prediction.2 小麥 MATE 蛋白的亞細(xì)胞定位將 P35S::AK336065-GFP 融 合 表 達(dá) 載 體 與 晚 期 內(nèi) 體 定 位 融 合 載5S::mScarlet-ARA7 共同轉(zhuǎn)化原生質(zhì)體。結(jié)果顯示:AK336065-GFP 呈現(xiàn)離散的點(diǎn)信號(圖 2-3);AK336065-GFP 與 mScarlet-ARA7 有大部分信號重合(圖 2-3)。蛋白定位于細(xì)胞的晚期內(nèi)體,可能參與了細(xì)胞內(nèi)體循環(huán)系統(tǒng)運(yùn)輸過程。圖 2-3AK336065 在擬南芥葉肉細(xì)胞中的亞細(xì)胞定位Fig 2-3 Subcellular localization of AK336065 in Arabidopsis mesophyll cells
【學(xué)位授予單位】:西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:Q943.2

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本文編號:2676510

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